利用鸡胚表达谱数据筛选皮肤发育相关基因的研究

发布时间：2021-04-12 16:29

　　家鸡（Gallus domesticus）躯体被覆羽毛而跖部为鳞片状皮肤,代表了比较典型的皮肤结构,是研究皮肤调控机理的理想模型。本研究利用来航鸡胚胎期背部和跖部皮肤的表达谱数据（GSE62882）,筛选不同日龄胚胎背部羽毛皮肤上皮（7 d、9 d）、间充质（7 d、9 d）和跖部鳞片皮肤上皮（9 d、11 d）、间充质（9 d、11d）的差异表达基因,探讨胚胎皮肤发育的调控通路。结果显示:羽毛皮肤上皮（7d、9d）鳞片皮肤上皮（9 d、11 d）差异表达显著基因（Padj<0.05）,分别为28个和116个;对4组极表达差异显著基因（P<0.01）进行GO分析,发现富集在单细胞组织发育相关条目的差异基因最多,羽毛上皮（7 d、9 d）部分差异基因富集在细胞黏附;4组差异基因的KEGG分析中,筛选出共同的信号通路黏附斑激酶（FAK）信号通路,该通路介导的细胞黏附活动可能参与鸡胚胎皮肤发育过程。血小板源性生长因子（Platelet Derived Growth FactorSubunitB,PDFGB）、关键基因纤维连接蛋白1（Fibronectin1,FN1）和细胞基质蛋白... 

【文章来源】：中国畜牧杂志. 2020,56(09)北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

20个样本表达量数据标准化后的统计信息

4组差异基因（P<0.01）韦恩图解分析结果如图2所示，脂肪酸结合蛋白（Fatty Acid Binding Protein7,FABP7）在4组差异分析中均为差异基因（P<0.01),FE7-9、FM7-9和SE9-11有27个共同基因。FE7-9和SE9-11含有184个共同基因（FE-SE）。对FE7-9、FM7-9、SE9-11、SM9-11和FE-SE的基因进行核心基因分析并合并作图（图3），可见核心基因组成一个较大的互作网络，并通过关键基因纤维连接蛋白1(Fibronectin1,FN1）和血小板源性生长因子（Platelet Derived Growth Factor Subunit B,PDFGB）连接在一起。图3 4组差异分析的核心基因合并后的互作图

4组差异分析的核心基因合并后的互作图


本文编号：3133608