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不同致病力MDRV双重RT-PCR检测方法建立及诱导细胞凋亡研究

发布时间:2021-04-14 01:40
  番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)是以感染番鸭出现“肝白点”为主要病变特征,并可引起软脚,喜卧,趾、跗关节肿胀等症状的一种传染性很强的病毒。2001年以来,本实验室分离出多株番鸭呼肠孤病毒,其中包括不同致病力的YB株和YJL株。经测序分析,YB株与MDRV法国89026株的S4基因同源性达94%以上,而YJL株与禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)S1133株、176株的S1基因之间同源率高达96%以上,YB株与YJL株之间S组基因同源性低于30%。YB毒株在临床上表现为高致病力的特点,能够引起高的致死率,YJL毒株,在临床上对番鸭表现为低致病力的特点。由于两毒株在临床症状上有着类似发病症状和致病机理,通过临床诊断鉴别比较困难,所以建立一种快速、高效、特异的检测方法对于临床上区分不同致病力毒株具有重要意义。YJL株的S1基因编码P10、P17和σ C三个蛋白,而YB株的S4基因编码P10和σC两个蛋白,不含有P17蛋白,且两个毒株的P10蛋白基因的同源性极低。根据这2株病毒基因特点,分别针对YB株P10蛋白基因和YJL株P17蛋白基因... 

【文章来源】:福建农林大学福建省

【文章页数】:69 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

不同致病力MDRV双重RT-PCR检测方法建立及诱导细胞凋亡研究


图1单项PCR特异性扩增结果??Fig.5.?Specific?amplification?res^Lts?of?single?PCR??

同源性,核苷酸,基因,毒株


为288bp和441bp,位置与??预期大小相符。对这2株PCR扩增产物测序获得的序列,经DNAstar软件分析,??这些序列分别与原来的参考序列一致。??将YB株、YJL株与NCBI上公布的包括传统毒株法国株89026在内的6株??MDRV病毒株的P10蛋白基因和包括标准株美国S1133株、176ARV病毒株在内??的6株ARV毒株的P17蛋白基因进行同源序列比对(登录号见表2-5),以得知??两毒株在病原地域分布的地位和关系,2个蛋白基因核苷酸序列同源性分析及发??育进化树枝见图2、图3、图4、图5。由图可知,YB毒株与传统毒株国内3株??MDRV毒株、法国89026株同源性均在94%以上,与YJL株、ARV?S1133株同??源性仅40%,从发育树可知YB株与传统法国株89026、国内株ZJ2000、S12、??C4属于同一进化分支,YJL株与ARVS1133株属于另外一进化分支,关系较远。??而Y几毒株与包括参考株美国S1133、加拿大株176在内的国内外几株ARV毒??株同源性高达99%以上,从发育树可知它们之间的演化距离只有0.4,说明其核??苷酸同源性很高。??表2-5?MDRV参考毒株??Table2-5?MDRV?reference?strains??毒株?ii?登录号?ii?±ii?登录号??Strain?Country?Accession?No.?Strain?Country?Accession?No.??MDRVYB-P10?中国福建?KC571174?ARV?SI?133?美国?AF330703??MDRV?89026?法国?AJ310526?ARV?PI00?美国?DQ868791??M

进化树,基因


00M?segment?S4.seq??[-1-…MDRVYBPIO.seq???—MDRVS12P10.seq??-??MDRVC4P10.seq???r?ARVS1133?segment?Slseq??,一?^?MDRVYJLseamentSl.seq??79.2?■■■■■■■■?"??i?i?i?i?i?i?i?i??70?60?50?40?30?20?10?0??Nucleotide?Substitutions?(x100)??图3?P10基因发育进化树??Fig.?3?PIO?gene?phylogenetic?tree??Percent?Identity??1?2?3.4?5?6?7.??1?99?g?'?99/-{?99,8 ̄|99.5?]99i?|39.3?I?"l?—?l.fDRV?Fujian?YJL.seq??:_|||?99.S?丨100.0丨?99.3?i?99.3?丨?99.9?丨?T?—?ARV?China?C-98.seq??§?3?:?0.9?丨?0.4?99.8?I?99.1?丨?99.0?199.7?丨?3?ARV?Guang?R1.seq??〇-?4?0.2?|?0?0?!?0?2?MB?9^8?|?99.8?llOQ.O!?4?ARV?Taiwan?918?seq??^?5?0.5?l?0.7?0.9?l?0.2?"Mi?99.9?i?99.-1?:?ARV?US祆?S1133.seq??6?Q.6?0.?? ̄1.0?}?oT]?Q.1?Ml?99-3?[—6_—?ARV?USA?P100.seq??7?!?0.7?〇

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硕士论文
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[2]禽(鸡源)呼肠孤病毒的分离与鉴定[D]. 梁英.福建农林大学 2005
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本文编号:3136403

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