鄱阳湖地区鸭禽流感病毒分子流行病学解析与耐药性初探

发布时间：2017-04-18 07:30

  本文关键词：鄱阳湖地区鸭禽流感病毒分子流行病学解析与耐药性初探，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：江西鄱阳湖是主要的候鸟栖息地是东亚-澳大利亚候鸟迁徙路线的必经之地,这给周边散养家禽和候鸟之间的接触创造了条件,增加了禽流感病毒在野鸟和家禽之间的传播几率。本研究选取鄱阳湖周边7个县区的养殖户进行入户采样和调查,通过研究了解禽流感各亚型在家鸭中的流行情况,并对其进行基因进化和分子特征分析,了解其基因进化情况及耐药风险。2014年在江西鄱阳湖周边七个区县的户家鸭养殖场采集粪便和水样等环境样本共计3467份,将采集的样本使用无特定病原体(SPF)鸡胚进行病毒分离,使用红细胞凝集试验进行初筛,再使用荧光实时反转录聚合酶链反应(Real-time PCR)方法确定甲型流感病毒,随后进行二代测序实验,得到全基因组序列后进行分子进化和耐药位点分析。所有采集的环境样本,血凝阳性率为3.18%(109/3425),血凝阳性标本中甲型流感核酸阳性率为44.95%(49/109),49份标本中分离到了禽流感病毒,其中H10N3亚型2株,H11N3亚型2株,H12N5亚型2株,H3N2亚型5株,H3N3亚型2株,H3N6亚型8株,H3N8亚型5株,H4N6亚型8株,H5N6亚型3株,H6N1亚型1株,H6N6亚型4株,H7N7亚型3株,混型4株。3株H5N6毒株,HA基因属于clade2.3.4.4分支,其6个内部片段均来源于H5N6亚型。耐药位点分析结果显示,金刚烷胺类和神经氨酸酶抑制剂均敏感。鄱阳湖地区饲养的家禽中流行共监测到H10N3, H11N3, H12N5, H3N2, H3N3, H3N6, H3N8, H4N6, H5N6, H6N1, H6N6, H7N7,混型等亚型流行,其中H5N6存在感染人的风险。
【关键词】：禽流感病毒 鄱阳湖 家鸭 基因进化 耐药
【学位授予单位】：北京农学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S858.32
【目录】：

• 摘要4-5
• Abstract5-6
• 缩略词表6-9
• 1. 引言9-12
• 1.1 研究的目的和意义9-10
• 1.2 国内外的研究现状10-12
• 2. 研究内容和方法12-14
• 2.1 研究对象12
• 2.2 现场调查与标本采集12
• 2.3 标本的运输和处理12-13
• 2.4 实验室检测13
• 2.5 结果分析13
• 2.6 质量控制13-14
• 3. 材料和方法14-28
• 3.1 材料14-18
• 3.1.1 调查登记表14
• 3.1.2 环境样本采样14
• 3.1.3 病毒分离14-15
• 3.1.4 核酸提取15
• 3.1.5 实时荧光定量鉴定15-16
• 3.1.6 一步法反转录聚合酶链式反应(One-step RT-PCR)16
• 3.1.7 凝胶电泳及纯化16
• 3.1.8 产物定量及全基因组序列测定16-17
• 3.1.9 个人防护17-18
• 3.2 方法18-28
• 3.2.1 现场样本采集18
• 3.2.2 病原学检测18-22
• 3.2.3 全基因序列测定22-27
• 3.2.4 数据和序列分析27-28
• 4. 结果28-57
• 4.1 标本采集情况28-29
• 4.2 血凝检测结果29-31
• 4.3 A型禽流感核酸检测结果31-33
• 4.4 测序亚型及结果分析33-34
• 4.5 H5N6亚型同源性分析34-39
• 4.6 系统进化树及分子特征分析39-56
• 4.7 分子特征分析及耐药性位点分析56-57
• 5. 讨论57-60
• 6. 结论60-61
• 6.160
• 6.260
• 6.360-61
• 参考文献61-65
• 致谢65-66
• 个人简介66-68

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 ;美研制出抗禽流感新药[J];中国禽业导刊;2000年20期

2 徐兆炜;禽流感1999年近况[J];预防医学情报杂志;2000年02期

3 谢健屏;禽流感病毒[J];中国临床医生;2000年04期

4 ;禽流感的病毒特性[J];中国家禽;2001年05期

5 ;禽流感高免球蛋白效果好[J];中国家禽;2001年08期

6 ;农业部、国家质检总局、外经贸部发出紧急通知 要求严堵禽流感[J];内蒙古畜牧科学;2001年03期

7 ;农业部等紧急通知各地严防禽流感[J];四川畜牧兽医;2001年06期

8 罗开健,沈祥广,苏鸿程,劳秋红;禽泰克对禽流感的防治效果试验[J];养禽与禽病防治;2001年02期

9 卢建红;禽流感的危害[J];湖南农业;2001年03期

10 魏凤祥,周琦,张萍,叶喜永;加强禽流感诊断 提高预防能力[J];中国动物保健;2001年06期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 孙晓林;;禽流感和公共卫生[A];中国畜牧兽医学会兽医病理学分第12次暨中国动物病理生理学专业委员会第11次学术讨论会论文集[C];2003年

2 何义林;叶冬青;;禽流感病毒对人类感染机制的研究进展[A];第二届全国人畜共患病学术研讨会论文集[C];2008年

3 春阳;李东;;再论“以科学发展观应对禽流感事件”——评禽流感病毒变种两次恐慌论[A];首届中国黄羽肉鸡行业发展大会会刊[C];2008年

4 邓洁丽;段明星;俞初一;江龙;;聚联乙炔有序组装体在识别禽流感病毒方面的应用研究[A];中国化学会第十二届胶体与界面化学会议论文摘要集[C];2009年

5 孙恩泽;谢敏;赵海粟;黄碧海;刘书琳;张万坡;张志凌;王汉中;庞代文;;量子点标记禽流感病毒[A];第六届全国化学生物学学术会议论文摘要集[C];2009年

6 黄志坚;陈强;李清禄;王寿昆;江和基;;不同消毒剂对禽流感病毒的杀灭试验[A];福建省科协第八届学术年会分会场“转变饲养方式，，促进海西畜牧业和谐发展”学术年会论文集[C];2008年

7 周祖华;张敏;程礼明;徐彬;沈彩信;;禽流感流行趋势分析[A];全国人畜共患病学术研讨会论文集[C];2006年

8 王志宇;张议文;刘桂林;;禽流感病毒的分子生物学研究进展[A];全国动物生理生化第十一次学术交流会论文摘要汇编[C];2010年

9 刘迎芳;饶子和;;禽流感病毒(H5N1)RNA聚合酶PA亚基相关三维晶体结构与功能分析[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年

10 韦婷;胡杰;兰彬;陆文俊;苏凯;覃芳芸;;广西暴发中低毒力禽流感情况报告[A];中国畜牧兽医学会禽病学会分会第十次学术研讨会论文集[C];2000年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 农业部动物疫病诊断与流行病学中心主任 崔尚金 博士;候鸟发生禽流感给我们的警示[N];中国畜牧兽医报;2005年

2 莫书莹;世卫警告：禽流感或大流行全球经济应警惕[N];第一财经日报;2005年

3 本报记者 魏红欣;禽流感“啄”痛全球经济[N];国际金融报;2005年

4 本报记者　许凯;狙击禽流感：一场鸟与人的战争[N];国际金融报;2005年

5 新华社记者　杨爱国;防控禽流感需要加强国际合作[N];光明日报;2005年

6 李杨;禽流感疫情不会长期影响农产品期价[N];金融时报;2005年

7 罗政、夏文辉;香港强化防止禽流感措施[N];人民日报海外版;2004年

8 本报记者　张向永　赵秀芹;禽流感让全世界手牵手[N];市场报;2005年

9 ;禽流感病毒能否绝迹？[N];中国石油报;2004年

10 何源;严防禽流感从境外传入我国[N];中国食品质量报;2005年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 邹镇;H5N1型禽流感病毒和甲型H1N1流感病毒致急性呼吸损伤的机理研究[D];北京协和医学院;2012年

2 赵蔚;基于磁分离和荧光量子点标记的高灵敏禽流感病毒检测[D];武汉大学;2012年

3 区嘉贤;H7N9禽流感患者的临床特征及预后分析[D];复旦大学;2014年

4 刘三红;禽流感的数学建模及数值模拟[D];华中师范大学;2015年

5 樊兆斌;野鸟源禽流感病毒(AIV)分离株的遗传进化及其致病性研究[D];东北林业大学;2014年

6 桑晓宇;H9N2亚型禽流感病毒在豚鼠模型中水平传播的分子机制研究[D];中国农业科学院;2015年

7 杨文涛;靶向树突状细胞通用型禽流感病毒重组乳酸菌的研究[D];吉林农业大学;2015年

8 石霖;北方某省主要亚型禽流感现地调查分析及RT-LAMP检测方法研究[D];东北农业大学;2015年

9 张晓剑;HA蛋白糖基化修饰对H5N1亚型禽流感病毒复制、致病性和抗原性的影响[D];扬州大学;2014年

10 朱闻斐;H7N9禽流感病毒致病与传播机制研究[D];中国疾病预防控制中心;2015年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 高晓龙;2014年度中国东部候鸟禽流感病毒分离与鉴定[D];中国农业科学院;2015年

2 徐晓龙;H5和H7亚型禽流感病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立[D];中国农业科学院;2015年

3 韩苗苗;一类人畜共患的禽流感传染病传播模型[D];大连理工大学;2015年

4 王秋珍;H9N2禽流感病毒NS1蛋白诱导的氧化应激促进DF-1细胞凋亡[D];西北农林科技大学;2015年

5 梁威;5株H9N2亚型AIV血凝素结构分析及感染A549细胞的蛋白质组学研究[D];山东农业大学;2015年

6 刘媛媛;MDCK细胞表达鸡ST3GAL I基因对H9亚型禽流感病毒增殖情况的影响[D];河南农业大学;2013年

7 孟芳;H9N2亚型禽流感HA基因演化及其内部基因在H5N2亚型流感病毒演化中的作用[D];山东农业大学;2015年

8 韩雯;山东地区H9N2禽流感流行病学调查及流行毒株分子生物学检测[D];山东农业大学;2014年

9 查国飞;昆虫细胞表达重组H5亚型禽流感HA蛋白及其免疫原性研究[D];安徽农业大学;2014年

10 侯群;新疆青格达湖湿地鸟类中H5、H7亚型AIV和NDV流行病学监测[D];石河子大学;2015年

  本文关键词：鄱阳湖地区鸭禽流感病毒分子流行病学解析与耐药性初探，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：314346