基于高通量测序和Q-PCR芯片技术分析养殖环境中苍蝇携带细菌菌群结构和耐药基因特点

发布时间：2021-04-22 19:42

　　利用高通量测序和定量聚合酶链反应芯片技术,分析和比较鸡舍和奶牛舍粪便和苍蝇细菌菌群结构、潜在致病菌以及耐药基因（Antibiotic resistance gene,ARG）和移动遗传元件（Mobile genetic element,MGE）。动物粪便和苍蝇样品中鉴定出13个共有细菌门,且优势菌门一致,分别为厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和放线菌门（Actinobacteria）。另外,从苍蝇和粪便样品中分别检测到32和21个潜在致病菌属,其中9个为两者共有;从苍蝇和粪便中分别扩增出242和273个ARG/MGE,其中215个为两者共有。溯源分析显示,苍蝇携带菌群结构、ARG和MGE均与其所处环境动物粪便相似性较高。养殖环境是苍蝇携带细菌菌群和耐药基因重要来源,苍蝇可作为分析养殖环境中耐药基因特点重要参考。 

【文章来源】：东北农业大学学报. 2020,51(11)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 细菌菌群分析
    1.3 Q-PCR芯片检测
    1.4 统计分析
2 结果与分析
    2.1 细菌菌群结构
    2.2 细菌菌群α多样性分析
    2.3 苍蝇细菌菌群溯源
    2.4 潜在致病菌
    2.5 ARG和MGE特点
    2.6 共有ARG和MGE
3 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]畜禽养殖场空气中可培养抗生素耐药菌污染特点研究[J]. 张兰河,贺雨伟,陈默,高敏,仇天雷,王旭明.  环境科学. 2016(12)
[2]垃圾填埋场苍蝇和恶臭污染控制技术研究进展[J]. 张杰,李杭芬,赵由才,张瑞娜,宋立杰,邰俊.  环境污染与防治. 2016(01)



本文编号：3154355