西藏高原藏猪盲肠微生物群落结构与多样性的研究

发布时间：2021-04-24 12:27

　　本研究旨在探讨西藏高原放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪（杜×长×大,DLY猪）盲肠微生物的群落组成及多样性,从而部分揭示西藏高原藏猪肠道微生物的特异性。选用日龄相近的放牧藏猪、舍饲藏猪及DLY猪各5头,放牧藏猪由林芝本地农牧民采用传统方式放牧养殖,舍饲藏猪及DLY猪圈养并饲喂相同饲粮,160日龄时前腔静脉放血屠宰,采集盲肠食糜于液氮速冻待测。采用高通量测序技术测定样品16S rRNA V3-V4区域的基因序列。结果表明,在15个样本的16S rRNA基因V3-V4区测序共获得了659 904条有效序列,其中放牧藏猪213 031条、舍饲藏猪219 417条、DLY猪227 456条。放牧藏猪盲肠微生物OTU总数、Chao1指数、ACE指数及香农（Shannon）指数均显著高于舍饲藏猪与DLY猪（P<0.05）,而舍饲藏猪与DLY猪无显著差异（P>0.05）。3个类型猪盲肠微生物共划分为13个门,56个属。厚壁菌门（Firmicutes）是3个类型猪相对丰度共同最高的门。放线菌门（Actinobacteria）与疣微菌门（Verrucomicrobia）在放牧藏猪中相对丰度显著高... 

【文章来源】：畜牧兽医学报. 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验动物
    1.2 屠宰采样
    1.3 总DNA提取
    1.4 PCR扩增
    1.5 文库制备及测序
    1.6 测序信息分析
2 结 果
    2.1 盲肠微生物群落的丰富度及多样性分析
    2.2 盲肠微生物群落分类学组成分析
    2.3 盲肠微生物群落组成聚类分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]利用宏基因组学鉴定藏猪腹泻粪便病毒种群[J]. 胡承哲,周群,李玉,张敏,汤承,张斌.  畜牧兽医学报. 2019(12)
[2]饲粮能量水平对断奶藏仔猪生产性能、养分消化率和血液生化指标的影响[J]. 谭占坤,张定华,商鹏,刘锁珠,强巴央宗,张健,董亚南.  西南农业学报. 2017(07)
[3]藏猪粪样微生物对不同纤维底物的体外发酵[J]. 刘锁珠,李龙,付冠华,王利红,强巴央宗,李家奎.  中国兽医学报. 2017(07)
[4]藏猪耐粗饲特性及其生化机理研究[J]. 李江凌,陈晓晖,刘锐,王秋实,曾凯,廖党金,高荣,吕学斌.  中国猪业. 2015(02)
[5]藏猪食草机理的研究——藏猪肠道微生物的多样性分析[J]. 肖文萍,刘海艳,赵海波,白龙,彭甲银,刘雪青,王建刚,宋宇轩,曹斌云.  中国兽医学报. 2013(03)

博士论文
[1]藏猪肠道细菌群落组成与纤维素分解菌的研究[D]. 杨伟平.西北农林科技大学 2015



本文编号：3157358