猪流行性腹泻病毒中国流行株的遗传变异分析与S基因高变区的表达

发布时间：2021-04-26 16:18

　　自2010年10月份起，由猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）引起的猪急性腹泻在中国多个养猪省份暴发。该病是以腹泻、呕吐、脱水和对哺乳仔猪高致死率为特征的一种高度接触性肠道传染病，易感猪发病率可高达100%，给猪场带来了严重的经济损失。为了解PEDV的遗传变异情况，本研究根据GeneBank中PEDV经典毒株CV777株的全序列设计了19对特异性引物，采用RT-PCR方法对分离自河南省某猪场的PEDV流行株CH/ZMDZY/11的全基因组进行分段扩增、克隆和测序，获得了基因组的完整序列。在此基础上，作者对2010-2012年间PEDV中国流行株的遗传变异情况进行了分析，核苷酸和氨基酸序列比对结果显示，与经典毒株CV777相比，目前中国PEDV流行株已经发生了变异。来自中国各地的10株PEDV流行株具有很高的同源性（98.2%～99.1%），并与韩国强毒株DR13和中国早期毒株CH-S亲缘关系较近，而与经典毒株CV777的亲缘关系较远（96.8%～97%）。PEDV中国流行株与参考毒株相比，各主要基因均发生了不同程度的变异，尤其以S... 

【文章来源】：河南农业大学河南省

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
致谢
摘要
文献综述
    1 PEDV 的生物学特性
    2 PEDV 的基因组特点及主要编码蛋白的功能
    3 PEDV 分子流行病学研究进展
    4 PED 诊断方法研究进展
    5 PED 防控研究进展
    6 本研究的目的与意义
试验一 PEDV CH/ZMDZY/11 株全基因组序列测定与分析
    1 材料与方法
    2 结果
    3 讨论
试验二 2010-2012年中国猪流行性腹泻病毒流行株的遗传变异分析
    1 材料与方法
    2 结果
    3 讨论
试验三 PEDV 中国流行株 S 基因高变区的表达与鉴定
    1 材料与方法
    2 结果
    3 讨论
参考文献
Abstract
附录1：作者读研期间已发表文章
附录2：PEDV CH/ZMDZY/11 株全基因序列（登录号：KC196276.1）


【参考文献】：
期刊论文
[1]猪流行性腹泻病毒PEDV-GD12株的分离与鉴定[J]. 古洪浪,邓胜朝,崔进,刘晓露,刘超,袁航,马岚,张桂红.  中国兽医杂志. 2013(11)
[2]猪流行性腹泻病毒RT-PCR鉴别诊断方法的建立[J]. 吴玉璐,程群,虞凌雪,侯怡轩,王康,刘光清,童光志,周艳君.  中国农业科学. 2013(20)
[3]2011—2012年我国部分地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异分析[J]. 郭容利,何孔旺,茅爱华,刘浩飞,俞正玉,倪艳秀,温立斌,李彬,王小敏,张雪寒,吕立新,周俊明.  畜牧与兽医. 2013(05)
[4]2010～2012年华中地区猪流行性腹泻病毒分子特征和遗传进化分析[J]. 郑逢梅,霍金耀,赵军,常洪涛,王晓梦,陈陆,王川庆.  病毒学报. 2013(02)
[5]猪流行性腹泻病毒E基因真核表达载体的构建与鉴定[J]. 付通超,万红平,程渝,颜其贵.  畜牧兽医杂志. 2012(04)
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[7]猪流行性腹泻病毒SYBRⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立[J]. 修金生,周伦江,陈如敬,王隆柏,陈小权.  中国兽医科学. 2012(02)
[8]猪流行性腹泻病毒基因及其疫苗的研究[J]. 王凤,汤德元,李春燕,王彬,张晓杰,甘振磊,刘志杰.  猪业科学. 2010(12)
[9]猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪A群轮状病毒多重RT-PCR检测方法的建立及临床应用[J]. 张坤,何启盖.  畜牧兽医学报. 2010(08)
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硕士论文
[1]猪流行性腹泻病毒检测方法建立及基因变异分析[D]. 霍金耀.河南农业大学 2013
[2]PEDV S与猪IL-18联合DNA疫苗免疫效果研究[D]. 斯琴高娃.东北农业大学 2011
[3]三株猪流行性腹泻病毒的Envelope（Small Membrane，sM）编码基因的序列测定比较[D]. 刘春艳.中国农业科学院 2003



本文编号：3161723