细毛羊多胎性状候选基因多态性检测与分析

发布时间：2021-04-30 00:33

　　多胎细毛羊育种是我国细毛羊产业发展的重点方向,提升细毛羊繁殖力是当下细毛羊品种选育的重中之重,但控制其多胎性状的基因仍不清楚。本研究以我国具有代表性的细毛羊品种高山美利奴羊、中国美利奴羊、青海细毛羊、敖汉细毛羊为研究对象,以控制羊繁殖性状基因BMPRIB、BMP15、GDF9、FSHR、FSHβ、INHA、INHBA、GnRHR、GnRH为细毛羊多胎性状候选基因,基于全基因组测序结果,进行外显子单核苷酸多态性筛选,并采用RNAfold和NPS@软件预测单核苷酸多态性对候选基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构的影响。将引起高山美利奴羊候选基因编码氨基酸变化位点作为该基因特异性候选位点,利用直接测序法检测高山美利奴羊多态性,分析候选基因多态性与产羔数的相关性,筛选影响多胎性状的基因。主要研究结果如下:1.四个细毛羊品种多胎性状候选基因中BMPR-IB基因外显子检测到5个SNPs（A753G、T1020C、C1035T、C1269A、C1626A）;BMP15基因外显子上没有检测到SNP位点;GDF9基因外显子共检测到7个SNPs（G260A、C471T、G477A、G721A、G750A、... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：71 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
英文缩略表
第一章 引言
    1.1 研究用细毛羊品种介绍
        1.1.1 高山美利奴羊
        1.1.2 中国美利奴羊
        1.1.3 青海细毛羊
        1.1.4 敖汉细毛羊
    1.2 多胎性状候选基因单核苷酸多态性研究进展
        1.2.1 BMPR-IB基因
        1.2.2 BMP15基因
        1.2.3 GDF9基因
        1.2.4 FSHR与FSHβ基因
        1.2.5 INHA与INHBA基因
        1.2.6 GnRHR与GnRH基因
    1.3 DNA分子标记技术
        1.3.1 单核苷酸多态性
        1.3.2 直接测序法
    1.4 本研究的目的意义
第二章 细毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9基因多态性检测与分析
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 主要试验试剂及仪器
    2.2 试验方法
        2.2.1 样品的采集
        2.2.2 血液基因组DNA提取及质量检测
        2.2.3 全基因组测序及BMPR-IB、BMP15、GDF9 基因外显子多态位点检测
        2.2.4 细毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9 基因多态位点遗传多样性分析
        2.2.5 生物信息学分析
        2.2.6 高山美利奴羊BMPR-IB基因多态性与产羔数关联分析
    2.3 结果与分析
        2.3.1 细毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9基因外显子SNPs筛选
        2.3.2 细毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9基因群体遗传学分析
        2.3.3 生物信息学分析
        2.3.4 高山美利奴羊BMPR-IB基因多态性与产羔数关联分析
    2.4 讨论
    2.5 小结
第三章 细毛羊FSHR和FSHβ基因多态性检测与分析
    3.1 试验材料
    3.2 试验方法
    3.3 结果与分析
        3.3.1 细毛羊FSHR与FSHβ基因外显子SNPs筛选
        3.3.2 细毛羊FSHR与FSHβ基因群体遗传学分析
        3.3.3 生物信息学分析
        3.3.4 高山美利奴羊FSHR基因多态性与产羔数关联分析
    3.4 讨论
    3.5 小结
第四章 细毛羊INHA和INHBA基因多态性检测与分析
    4.1 试验材料
    4.2 试验方法
    4.3 结果与分析
        4.3.1 细毛羊INHA与INHBA基因外显子SNPs筛选
        4.3.2 细毛羊INHA与INHBA基因群体遗传学分析
        4.3.3 生物信息学分析
        4.3.4 高山美利奴羊INHA与INHBA基因多态性与产羔数关联分析
    4.4 讨论
    4.5 小结
第五章 细毛羊GnRHR和GnRH基因多态性检测与分析
    5.1 试验材料
    5.2 试验方法
    5.3 结果与分析
        5.3.1 细毛羊GnRHR与GnRH基因外显子SNPs筛选
        5.3.2 细毛羊GnRHR与GnRH基因群体遗传学分析
        5.3.3 生物信息学分析
        5.3.4 高山美利奴羊GnRHR与GnRH基因多态性与产羔数关联分析
    5.4 讨论
    5.5 小结
第六章 全文结论
参考文献
附录
致谢
作者简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]6个绵羊群体BMP15、GDF9基因多态性分析[J]. 吴翠玲,宗兴龙,赵卓,赵云辉,翟博,张明新,王春昕.  中国畜牧兽医. 2018(08)
[2]非遗传因素对中国美利奴羊(新疆型)主要经济性状的影响[J]. 侯芳,臧长江,王连群,赵冰茹,艾则孜·司马义,卡哈尔·卡迪尔,黄锡霞,田可川.  中国畜牧兽医. 2018(06)
[3]不同动物模型对高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的比较[J]. 张剑搏,袁超,岳耀敬,郭健,牛春娥,王喜军,王丽娟,吕会芹,杨博辉.  中国农业科学. 2018(06)
[4]三个绵羊品种BMPR-IB基因CDS区1113位点的多态性与产羔数的相关性分析[J]. 杜丽,张利平,张筱艳,朱韶华,马晓明.  农业生物技术学报. 2017(12)
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[8]骨形态发生蛋白15基因与绵羊繁殖性能关系的研究进展[J]. 程俐芬,姬爱国,王清祥.  中国畜牧兽医. 2017(08)
[9]论高山美利奴羊新品种的价值和意义[J]. 杨博辉.  甘肃畜牧兽医. 2017(04)
[10]香猪FSHR基因外显子10的多态性及其与产仔数间的关联分析[J]. 许瑶,刘畅,牛熙,冉雪琴,王嘉福.  中国畜牧兽医. 2017(03)

博士论文
[1]陆地棉TM-1参考基因组构建及比较基因组分析[D]. 陈杰丹.南京农业大学 2016
[2]青海细毛羊封闭与开放核心群育种规划效果评估[D]. 王鹏宇.内蒙古农业大学 2012
[3]敖汉细毛羊遗传参数估计及核心群育种效果分析研究[D]. 赵晓平.内蒙古农业大学 2008

硕士论文
[1]三个家马品种泌乳相关基因多态性及其与伊犁马产奶量的关联研究[D]. 于农淇.西北农林科技大学 2017
[2]天祝白牦牛FSH、FSHR基因多态性分析与双胎性状的关联研究[D]. 邢耀潭.甘肃农业大学 2011



本文编号：3168487