陇东肉牛A-FABP和SCD1基因多态性及其与肉质性状的相关性研究

发布时间：2021-05-09 05:28

　　早胜牛在长期的适应性驯化及杂交改良过程中，形成了具有耐粗饲、生长发育快和产肉性能优良的陇东肉牛群体，其中包括分布在庆阳、平凉的早胜牛及被南德温、西门塔尔和秦川牛杂交改良类群。为进一步研究陇东肉牛肉品质及其遗传基础，挖掘地方品种潜在的遗传资源优势，促进甘肃地区肉牛产业，本试验以5个早胜牛类群（庆阳类群、平凉类群、南德温与庆阳类群杂种、西门塔尔与平凉类群杂种、秦川牛与平凉类群杂种）为研究对象，采用PCR-SSCP技术、DNA测序和DNA序列分析技术检测了A-FABP基因第2、3、4外显子和SCD1基因第5外显子的多态性，分析了肉牛群体的遗传结构和多样性。采用最小二乘法（SAS9.3，Cary，NC，USA）模型研究了A-FABP基因和SCD1基因的遗传突变位点与试验肉牛群体胴体品质和肉质性状的相关性，旨在寻找对该肉牛类群的胴体和肉质性状有显著影响的功能基因或分子标记，为陇东肉牛的主要经济性状分子标记辅助选择（MAS）及类群选育提供参考依据。试验主要结果如下：1.20A-FABP基因外显子2和3分别存在c.280A>G和c.408G>C突变，并分别形成了3种基因型。SCD1基因外... 

【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Summary
第一部分 文献综述
    1.前言
    2.候选基因的研究进展
        2.1 脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因
            2.1.1 A-FABP 的结构和生物学特性
            2.1.2 A-FABP 的功能
            2.1.3 A-FABP 基因的研究进展
        2.2 硬脂酰辅酶 A 去饱和酶Ⅰ（SCD1）基因
            2.2.1 SCD1 的结构和生物学特性
            2.2.2 SCD1 的功能
            2.2.3 SCD1 基因的研究进展
    3.家畜分子遗传标记技术
        3.1 直接测序
        3.2 DNA 芯片
        3.3 单链构象多态性
    4.本研究目的及意义
第二部分 材料与方法
    1 试验材料
        1.1 试验动物
        1.2 实验药品与试剂
        1.3 溶液与缓冲液的配置
        1.4 主要仪器设备
    2 试验方法
        2.1 试验技术路线
        2.2 试验样品采集
            2.2.1 血样肉样来源
            2.2.2 牛肉品质的测定
        2.3 基因组 DNA 的提取方法
        2.4 基因组DNA浓度和纯度的检测、纯化及稀释
            2.4.1 基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳检测
            2.4.2 基因组 DNA 的分光光度计检测
        2.5 检测位点引物设计
        2.6 最佳 PCR 反应体系及扩增条件
        2.7 扩增结果检测
        2.8 扩增产物的 PCR-SSCP 分析
            2.8.1 聚丙烯酰胺凝胶组成
            2.8.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳
            2.8.3 银染过程
    3.数据统计及分析
        3.1 基因频率、基因型频率的计算
        3.2 多态信息含量
        3.3 纯合度、杂合度和有效等位基因数
        3.4 统计分析模型
第三部分 试验结果与讨论
    1 肉牛基因组 DNA 检测结果
    2 PCR 检测和遗传特性分析
        2.1 A-FABP 基因外显子 2 PCR-SSCP 结果
            2.1.1 A-FABP 基因外显子 2 PCR 扩增结果
            2.1.2 A-FABP 基因外显子 2 的 SSCP 电泳结果及测序分析
            2.1.3 A-FABP 基因外显子 2 遗传多态性分析
            2.1.4 基因型与胴体、肉质性状的相关性分析
        2.2 A-FABP 基因外显子 3 PCR-SSCP 结果
            2.2.1 A-FABP 基因外显子 3 PCR 扩增结果
            2.2.2 A-FABP 基因外显子 3 SSCP 电泳结果及测序分析
            2.2.3 A-FABP 基因外显子 3 遗传多态性分析
            2.2.4 基因型与胴体、肉质性状的相关性分析
        2.3 A-FABP 基因外显子 4 PCR-SSCP 结果
            2.3.1 A-FABP 基因外显子 4 PCR 扩增结果
            2.3.2 A-FABP 基因外显子 4 的 SSCP 电泳结果
        2.4 SCD1 基因 PCR-SSCP 结果
            2.4.1 SCD1 基因 PCR 扩增结果
            2.4.2 SCD1 基因 SSCP 电泳结果及测序分析
            2.4.3 SCD1 基因遗传多态性分析
            2.4.4 基因型与胴体、肉质性状的相关性分析
    3 讨论
        3.1 基因的遗传特性
            3.1.1 A-FABP 基因遗传多态性分析
            3.1.2 SCD1 基因遗传多态性分析
        3.2 基因多态性与肉质性状的关系
            3.2.1 A-FABP 基因相关性分析
            3.2.2 SCD1 基因相关性分析
第四部分 结论
参考文献
附录 1
附录 2
致谢
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本文编号：3176712