哈萨克绵羊DRB1基因外显子1和4多态性与布鲁氏菌病的相关性研究

发布时间：2021-05-11 08:36

　　试验旨在对哈萨克绵羊DRB1基因外显子1和4多态性与布鲁氏菌病的相关性进行研究。使用虎红平板凝集试验（RBPT）对试羊的血清进行血清学检测,参考GenBank中绵羊MHC ClassⅡ区DRB1基因序列（登录号:NC₀40271.1）,对其外显子1和4片段设计引物,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对230只哈萨克绵羊的DRB1基因进行多态性检测,分析其多态位点与哈萨克绵羊布鲁氏菌易感性之间的关系。RBPT检测发现66只哈萨克绵羊为布鲁氏菌感染阳性,阳性检出率为28.7%。外显子1片段存在一个SNP位点（F1-G22A）,测序确定两种基因型（GG、GA）,优势等位基因和基因型分别为G、GG,F1-G22A多态位点的易感基因型为GA。卡方检验表明,哈萨克绵羊DRB1基因F1-G22A多态位点与布鲁氏菌易感性的相关性不显著（P>0.05）。通过生物信息学在线软件分析得出,F1-G22A多态位点导致了RNA二级结构的改变和最小自由能的降低,引起了蛋白质二级结构的改变。DRB1基因外显子4片段未发现SNPs。由此得出,哈萨克绵羊DRB1基因F1-G22A多态位点与... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(12)北大核心

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 样品来源
        1.1.2 主要试剂和仪器
    1.2 方法
        1.2.1 布鲁氏菌病检测
        1.2.2 哈萨克绵羊基因组DNA的提取及PCR扩增
        1.2.3 哈萨克绵羊DRB1基因的SSCP分析
        1.2.4 测序分析
        1.2.5 统计分析及生物信息学分析
2 结 果
    2.1 布鲁氏菌病检测
    2.2 哈萨克绵羊DRB1基因外显子1、外显子4 PCR扩增
    2.3 哈萨克绵羊DRB1基因外显子1和外显子4多态性分析
    2.4 哈萨克绵羊DRB1基因外显子1多态位点F1-G22A与布鲁氏菌易感性的相关性分析
    2.5 F1-G22A多态位点生物信息学分析
    2.6 易感布鲁氏菌哈萨克绵羊DRB1基因外显子1 F1-G22A基因型分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]布鲁氏菌BP26蛋白的原核表达及鉴定[J]. 鲁友铭,李俊萱,吴胜昔,曾政,黄恒,李令臣,侯力嘉.  重庆理工大学学报(自然科学). 2019(10)
[2]新疆畜间布鲁氏菌病免疫评估与防控模式研究[J]. 刘文进,何成武,宁多武,宋焕堂,李艳.  家畜生态学报. 2019(10)
[3]哈萨克羊DRB1基因外显子3多态性及生物信息学分析[J]. 王元元,严国,罗成,齐江姣,周光普,谭君,高剑峰.  中国畜牧兽医. 2018(03)
[4]改良试管凝集试验和虎红平板凝集试验检测羊布鲁氏菌病结果比较[J]. 冯华.  中国草食动物科学. 2017(04)
[5]甘肃高山细毛羊DRB1基因内含子2微卫星多态性与生长速度的关联分析[J]. 成述儒,王华,樊庆山,王欣荣,张利平,吴建平.  浙江农业学报. 2016(12)
[6]贵州白山羊DRA和DRB1基因的表达差异分析[J]. 黄兰,徐伟,封竣淇,刘彬,康建兵,钱成,蔡惠芬,罗卫星.  基因组学与应用生物学. 2016(08)
[7]中国美利奴羊OLA-DQB1基因exon 2遗传多态性与布鲁氏菌病易感性的关联分析[J]. 王文文,许万云,胡梦薇,李建华,刘朋涛,高剑峰.  中国畜牧兽医. 2015(06)
[8]绵羊和人主要组织相容性复合体DRB1基因外显子2多态性及生物信息学分析[J]. 陈月娥,李建华,苟亚峰,王文文,朱军保,高剑峰.  中国畜牧兽医. 2014(04)
[9]羊布鲁氏菌病的危害与防治[J]. 张广俊.  四川畜牧兽医. 2013(01)
[10]藏绵羊MHC-DRB1基因第3外显子的PCR-SSCP检测及其序列分析[J]. 徐飞,成述儒,刘秀,王继卿,胡江,罗玉柱.  农业生物技术学报. 2011(05)

博士论文
[1]吉林省布鲁氏菌流行株种属鉴定及其耐药分子机制的研究[D]. 孙丽媛.吉林大学 2011

硕士论文
[1]中国美利奴羊MHC-DRB1 exon2单倍型构建及与布鲁氏菌病易感性关联性[D]. 陈月娥.石河子大学 2014
[2]甘肃高山细毛羊微卫星亲子鉴定及DRB1基因第3外显子多态性研究[D]. 李洁.甘肃农业大学 2013



本文编号：3181101