FMDV感染对肠道菌群及Ⅰ型干扰素对FMDV感染的影响
发布时间：2021-06-06 19:52
口蹄疫（FMD）是由口蹄疫病毒感染引起猪、牛、羊等偶蹄动物的一种急性,烈性传染病,给我国畜牧业健康发展造成巨大威胁。目前,对于FMD大部分的研究主要集中于口蹄疫病理及病因上,而对宿主感染FMDV后肠道菌群的变化状况却鲜有报道。利用Illumina高通量测序技术,我们研究了口蹄疫病毒感染对乳鼠肠道菌群的影响。研究发现在门水平,与对照组相比,口蹄疫病毒感染显著提高了乳鼠肠道中Proteobacteria的丰度,而降低了Fusobacteria和Firmicutes的丰度。在属水平,与对照组相比,口蹄疫病毒感染显著降低了Fusobacterium的丰度。由此可见,口蹄疫病毒感染与乳鼠肠道微生物菌群多样性及物种丰度的变化存在关联性。为了进一步研究抗病毒状态下肠道菌群的情况,首先我们对I型干扰素的IFN-ε,δ,ω,αω亚型进行了研究。近几年的研究显示epsilon干扰素在病毒急性期感染期间并不会导致它的上调,它在FMDV感染的表达情况未见报道。首先我们通过建立检测小鼠epsilon干扰素的实时荧光定量方法,检测了乳鼠IFN-ε在感染前后及不同时间段的变化,发现IFN-εmRNA转录水平在乳鼠感...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
型干扰素的信号通路Figure1.TypeIInterferonSignalingPathway
分析软件对实验数据进行统计分析，显著性分析采用单因素方差有统计学意义。的分类学鉴定中共收集了 26 个粪便样品用于测序后续的分析，共产生 1相应的平均每个样本为 11612 条序列（范围从 7882 到 128每个样品序列长度分布见图 2.1。此外，稀释曲线基本达到检测到，并且测序量能够反应样品中绝大部分的微生物信息OTUs 划分为不同类别，包括门，类，聚，科和属水平。将至 OTU 用于后续的分析。根据获得的 OTU 数据来制作每个样覆盖率。在这些样品中共有 9 门，14 类，20 个目，39 个科
图 2.2 乳鼠肠道样本测序序列稀释曲线（相似度：97%）.2 Rarefaction curve of sequenced reads in feces of mice (similari肠道菌群在门类水平的变化情况 组中优势细菌的百分比为 80%的 Firmicutes，2.27%% Actinobacteria，而在 FF 组乳鼠中的百分比分别为对照组与病毒感染组肠道微生物中也主要由 Firmacteria 组成（图 2.4，2.5，2.6）。尽管如此，病毒异（图 2.4），例如在聚类水平上，口蹄疫病毒感染icutes 和 Fusobacteria 降低了。图 2.6 呈现了肠道微heatmap），结果表明 FF 组小鼠肠道微生物结构发
【参考文献】：
期刊论文
[1]小鼠干扰素limitin蛋白的表达及其鉴定[J]. 龚美娇,程翠翠,马炳,代军飞,张杰,王雯慧. 中国兽医科学. 2018(03)
[2]Pathological and therapeutic interactions between bacteriophages,microbes and the host in inflammatory bowel disease[J]. Janka Babickova,Roman Gardlik. World Journal of Gastroenterology. 2015(40)
[3]Inflammatory bowel disease in the dog:Differences and similarities with humans[J]. Matteo Cerquetella,Andrea Spaterna,Fulvio Laus,Beniamino Tesei,Giacomo Rossi,Elisabetta Antonelli,Vincenzo Villanacci,Gabrio Bassotti. World Journal of Gastroenterology. 2010(09)
本文编号：3215032
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
型干扰素的信号通路Figure1.TypeIInterferonSignalingPathway
分析软件对实验数据进行统计分析，显著性分析采用单因素方差有统计学意义。的分类学鉴定中共收集了 26 个粪便样品用于测序后续的分析，共产生 1相应的平均每个样本为 11612 条序列（范围从 7882 到 128每个样品序列长度分布见图 2.1。此外，稀释曲线基本达到检测到，并且测序量能够反应样品中绝大部分的微生物信息OTUs 划分为不同类别，包括门，类，聚，科和属水平。将至 OTU 用于后续的分析。根据获得的 OTU 数据来制作每个样覆盖率。在这些样品中共有 9 门，14 类，20 个目，39 个科
图 2.2 乳鼠肠道样本测序序列稀释曲线（相似度：97%）.2 Rarefaction curve of sequenced reads in feces of mice (similari肠道菌群在门类水平的变化情况 组中优势细菌的百分比为 80%的 Firmicutes，2.27%% Actinobacteria，而在 FF 组乳鼠中的百分比分别为对照组与病毒感染组肠道微生物中也主要由 Firmacteria 组成（图 2.4，2.5，2.6）。尽管如此，病毒异（图 2.4），例如在聚类水平上，口蹄疫病毒感染icutes 和 Fusobacteria 降低了。图 2.6 呈现了肠道微heatmap），结果表明 FF 组小鼠肠道微生物结构发
【参考文献】：
期刊论文
[1]小鼠干扰素limitin蛋白的表达及其鉴定[J]. 龚美娇,程翠翠,马炳,代军飞,张杰,王雯慧. 中国兽医科学. 2018(03)
[2]Pathological and therapeutic interactions between bacteriophages,microbes and the host in inflammatory bowel disease[J]. Janka Babickova,Roman Gardlik. World Journal of Gastroenterology. 2015(40)
[3]Inflammatory bowel disease in the dog:Differences and similarities with humans[J]. Matteo Cerquetella,Andrea Spaterna,Fulvio Laus,Beniamino Tesei,Giacomo Rossi,Elisabetta Antonelli,Vincenzo Villanacci,Gabrio Bassotti. World Journal of Gastroenterology. 2010(09)
本文编号：3215032
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