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伯恩山犬的眼线虫形态学鉴定与cox1基因分析

发布时间:2021-06-16 18:12
  为鉴定伯恩山犬感染的眼线虫种属关系,采用PCR扩增虫体线粒体细胞色素C氧化酶第1亚基(cox1)基因。将有效序列进行NCBI-BLAST在线比对,利用MEGA6.0构建遗传系统进化树。结果显示,伯恩山犬眼线虫cox1序列长度为446 bp,与结膜吸吮线虫同源性达99%,系统进化分析显示二者位于同一分支,由此确定,伯恩山犬感染的线虫为结膜吸吮线虫。 

【文章来源】:动物医学进展. 2020,41(10)北大核心

【文章页数】:5 页

【部分图文】:

伯恩山犬的眼线虫形态学鉴定与cox1基因分析


结膜吸吮线虫虫体

序列,结膜,线虫,昆明


利用MEGA6.0软件,用相邻法(Neighbor joining method)构建进化树。比较结果表明,昆明伯恩山犬眼线虫与基因库中的结膜吸吮线虫(Thelazia callipaeda)位于同一大分支,表明昆明伯恩山犬眼线虫为结膜吸吮线虫。6个昆明犬源分离株与AP017700均相聚在一个小分支内,再与广东犬源(KY908320.1)、日本犬源(AB538283.1)、郑州人源(JX069968.1)等分离株相聚,显示出地区差异性,所有结膜吸吮线虫分离株以100.0%的置信度聚成一支。昆明犬源结膜吸吮线虫cox1基因序列与进化树中其余6株结膜吸吮线虫cox1基因序列进行比较,6例昆明犬源结膜吸吮线虫cox1基因序列在426 bp处(C)不同于其余6株(T),在429 bp处(A)与其余6株碱基(T)不一致,在435 bp处(C)不同于其余6株(A)。图3 cox1基因片段进化树分析

进化树,基因,片段


cox1基因片段进化树分析

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3233548

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