猪不同肌纤维类型中转录组差异表达的miRNAs生物学功能研究
发布时间：2021-06-22 12:09
MicroRNA（miRNA）是一类内源性的长约21-23 nt的非编码小RNA分子,主要通过其5’种子区域（2-8 nt）与靶基因的3’非编码区互补配对结合来抑制靶基因的转录或者使得靶基因降解,作为关键的转录后调控因子调控真核生物的基因表达。骨骼肌是一种高度异质性的组织,由不同的肌纤维组成,结合其功能、形态特征以及肌球蛋白重链比例,可以将其分为红肌、中间型和白肌。最近研究发现在红肌和白肌之间存在差异表达的miRNAs,这些差异的miRNA主要跟骨骼肌发育、代谢等功能相关。然而,在3种肌纤维类型（红肌、中间型和白肌）中的miRNA转录组差异有待进一步研究。猪作为重要的农业经济动物和生物医学研究模型,本实验以猪不同骨骼肌为研究对象,主要通过荧光定量和高通量测序方法检测不同类型肌肉中的miRNAs转录组差异,结果如下：1本实验采集了猪不同部位的15种骨骼肌,用Sanger sequencing验证过的特异肌球蛋白重链引物来定量在这15种骨骼肌中的肌球蛋白重链表达量,根据肌球蛋白重链比例的聚类分析显示,可以聚成红肌、中间型和白肌三大类。进一步定量线粒体拷贝数和酵解酶（乳酸脱氢酶的A,LDHA...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１各种骨骼肉的特征??Ｆｉｇ．?１?Ｔｈｅ?ｃｈａｒａｃｔｅｒｉ之ａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｖａｒｉｏｕｓ?ｓｋｅｌｅ化?１?ｍｕｓｃｌｅｓ??
如氧化、酵解。为了进一步区分不同的肌纤维代谢能力的差异Ｗ及证明??这１５种肌肉的分类结果，本实验同时还检测线粒体拷贝数和Ｌ公化４的相对表达水??平。如图２Ｂ所示，红肌类肌肉中的ｍｔＤＮＡ的拷贝数极涅著高于中间型和白肌纤??维，中间型肌肉中的ｍｔＤＮＡ的拷贝数极显著高于白肌，白肌纤维中ｍｔＤＮＡ的拷??贝数最化。如图２Ｃ所示，红肌类肌肉中的ＩＸ估４表达量极显著低于中间型和白肌??纤维，中间型肌肉中的王。化４表达量显著高于红肌类肌肉但是低于白肌类纤维，白??肌纤维中ＬＤ化４表达量极显著高于中间型和红肌纤维。并且线粒体拷贝数和么０化４??在不同肌纤维类型内的肌肉中表达差异不大，从图２Ｂ和２Ｃ中可Ｗ明显看出分为了??３大类。综上所述，根据氧化、酵解氧化能力也将肌肉很显著分成了红肌、白肌和??中间型，证明我们之前用ＭｙＨＣ亚型的比值进行肌肉分型的正确性。??为了节约实验成本，本实验从这１５种肌肉组织中选择３种具有典型的每种肌??纤维特征的肌肉代这红肌、白肌和中间型纤维。在纽肌纤维类型中
共表达高丰度的猪已知ｍｉＲＮＡｓ的用于下面的功能分析。为了验证深度测序结果的??可靠性，本实验随机选择了?２０个ｍｉＲＮＡｓ用ｑＲＴ－ＰＣ艮进行验证。结果显示小ＲＮＡ??测序数据与ｑＲＴ－ＰＣＲ结果呈极显著显著的正相关护＝０．７８０，?ｆ?＜?１０气（图３巧，再??次验证了深度测序方法的可靠性。??２２??
【参考文献】：
期刊论文
[1]降解组测序技术在植物miRNA研究中的应用[J]. 董淼,黄越,陈文铎,徐涛,郎秋蕾. 植物学报. 2013(03)
[2]骨骼肌卫星细胞对肉品质的影响及其分化调控[J]. 沈林園,张顺华,吴泽辉,郑梦月,李学伟,朱砺. 遗传. 2013(09)
[3]MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J]. Wen Luo,,Qinghua Nie,Xiquan Zhang. 遗传学报. 2013(03)
[4]hper1基因3′端UTR区双荧光素酶报告系统构建[J]. 赵溪岩,成姝婷,勾洵,王正荣,肖静,郭慧玲,汪宇辉. 四川生理科学杂志. 2013(01)
[5]猪miR-369靶基因肿瘤坏死抑制因子-α（TNF-α）的鉴定[J]. 母治平,邓娟,王滔,李明洲,李学伟. 农业生物技术学报. 2012(08)
硕士论文
[1]荣昌猪和长白猪MyHC基因的表达模式及其与肉质性状的相关性研究[D]. 冉彪.四川农业大学 2009
本文编号：3242808
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１各种骨骼肉的特征??Ｆｉｇ．?１?Ｔｈｅ?ｃｈａｒａｃｔｅｒｉ之ａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ｖａｒｉｏｕｓ?ｓｋｅｌｅ化?１?ｍｕｓｃｌｅｓ??
如氧化、酵解。为了进一步区分不同的肌纤维代谢能力的差异Ｗ及证明??这１５种肌肉的分类结果，本实验同时还检测线粒体拷贝数和Ｌ公化４的相对表达水??平。如图２Ｂ所示，红肌类肌肉中的ｍｔＤＮＡ的拷贝数极涅著高于中间型和白肌纤??维，中间型肌肉中的ｍｔＤＮＡ的拷贝数极显著高于白肌，白肌纤维中ｍｔＤＮＡ的拷??贝数最化。如图２Ｃ所示，红肌类肌肉中的ＩＸ估４表达量极显著低于中间型和白肌??纤维，中间型肌肉中的王。化４表达量显著高于红肌类肌肉但是低于白肌类纤维，白??肌纤维中ＬＤ化４表达量极显著高于中间型和红肌纤维。并且线粒体拷贝数和么０化４??在不同肌纤维类型内的肌肉中表达差异不大，从图２Ｂ和２Ｃ中可Ｗ明显看出分为了??３大类。综上所述，根据氧化、酵解氧化能力也将肌肉很显著分成了红肌、白肌和??中间型，证明我们之前用ＭｙＨＣ亚型的比值进行肌肉分型的正确性。??为了节约实验成本，本实验从这１５种肌肉组织中选择３种具有典型的每种肌??纤维特征的肌肉代这红肌、白肌和中间型纤维。在纽肌纤维类型中
共表达高丰度的猪已知ｍｉＲＮＡｓ的用于下面的功能分析。为了验证深度测序结果的??可靠性，本实验随机选择了?２０个ｍｉＲＮＡｓ用ｑＲＴ－ＰＣ艮进行验证。结果显示小ＲＮＡ??测序数据与ｑＲＴ－ＰＣＲ结果呈极显著显著的正相关护＝０．７８０，?ｆ?＜?１０气（图３巧，再??次验证了深度测序方法的可靠性。??２２??
【参考文献】：
期刊论文
[1]降解组测序技术在植物miRNA研究中的应用[J]. 董淼,黄越,陈文铎,徐涛,郎秋蕾. 植物学报. 2013(03)
[2]骨骼肌卫星细胞对肉品质的影响及其分化调控[J]. 沈林園,张顺华,吴泽辉,郑梦月,李学伟,朱砺. 遗传. 2013(09)
[3]MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J]. Wen Luo,,Qinghua Nie,Xiquan Zhang. 遗传学报. 2013(03)
[4]hper1基因3′端UTR区双荧光素酶报告系统构建[J]. 赵溪岩,成姝婷,勾洵,王正荣,肖静,郭慧玲,汪宇辉. 四川生理科学杂志. 2013(01)
[5]猪miR-369靶基因肿瘤坏死抑制因子-α（TNF-α）的鉴定[J]. 母治平,邓娟,王滔,李明洲,李学伟. 农业生物技术学报. 2012(08)
硕士论文
[1]荣昌猪和长白猪MyHC基因的表达模式及其与肉质性状的相关性研究[D]. 冉彪.四川农业大学 2009
本文编号：3242808
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