云岭牛和夏南牛无角性状的分子鉴定及应用
发布时间:2021-06-24 17:21
角的发育是牛科家族中一个很普遍的现象,在形态结构上角是皮肤的衍生物。对牛无角基因的研究结果表明,PF表示荷斯坦牛起源的无角基因,它包含3个SNPs和2个Indels共5个候选突变形成一个单倍型块(PG1654405A、PC1655463T、PC1768587A、P5ID和P80kbID);起源于凯尔特文化区的牛无角基因被命名为PC,包含单倍型P202ID。因此可以利用这6个突变位点区分有角牛和无角牛。目前关于牛无角基因的研究仅限于欧美牛品种,缺乏对中国培育的肉牛品种的研究。本试验以263头云岭牛(250头无角云岭牛、13头有角云岭牛)和147头夏南牛(127头无角夏南牛、20头有角夏南牛)为研究对象,分析云岭牛和夏南牛无角性状的遗传学原因及无角基因的基因频率与基因型频率。由于所选云岭牛和夏南牛为核心牛群,血统来源清楚,无荷斯坦奶牛血统,说明云岭牛和夏南牛没有无角基因PF,只有无角基因P
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:48 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 夏南牛与云岭牛品种简介
1.2 牛角的形态发育
1.2.1 牛角的形态结构
1.2.2 牛角的发育
1.2.3 有角牛和无角牛的组织学差异
1.3 牛角性状的研究进展
1.4 牦牛无角基因的研究进展
1.5 绵羊无角基因的研究进展
1.6 山羊无角基因的研究进展
1.7 试验的目的与意义
第二章 云岭牛和夏南牛无角性状的分子鉴定
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验主要试剂和配制方法
2.1.3 主要仪器和设备
2.1.4 试验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 基因组DNA检测结果
2.2.2 单倍型P_(202ID)的扩增结果
2.3 讨论
第三章 全基因组分析云岭牛角形差异的遗传背景
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 全基因组测序
3.1.3 数据质量质控
3.1.4 reads比对
3.1.5 全基因组SNP的鉴定
3.1.6 SNP注释
3.1.7 P_(202ID)单倍型的鉴定
3.1.8 主成分分析
3.1.9 系统发育分析
3.2 结果与分析
3.2.1 reads质控统计
3.2.2 比对统计
3.2.3 SNP检测
3.2.4 P_(202ID)单倍型的鉴定
3.2.5 主成分分析
3.2.6 系统发育分析
3.3 讨论
第四章 无角性状分子鉴定技术在黄牛无角品系选育中的应用
4.1 黄牛无角品系的选育方案
4.1.1 不利用分子鉴定技术,制定黄牛无角品系的选育方案
4.1.2 利用分子鉴定技术,制定的黄牛无角品系的选育方案
4.2 云岭牛和夏南牛无角品系的扩群方案
第五章 结果与创新点
5.1 结论
5.2 创新点
参考文献
附录
致谢
作者简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]关中奶山羊PIS区域序列多态性分析[J]. 侯策,粟小平,王起恬,崔奎青,石德顺,刘庆友. 中国畜牧兽医. 2017(12)
[2]优良肉牛新品种云岭牛[J]. 夏嘉. 农村百事通. 2017(21)
[3]“云岭牛”通过国家畜禽遗传资源委员会的现场审定[J]. 李亚鸣. 农村实用技术. 2014(06)
[4]牦牛角的形态发生及Shh和β-catenin的时空表达[J]. 任强,郁枫,王旭强,赵云辉,李静. 西北农业学报. 2009(01)
[5]夏南牛与南阳牛的杂交后代牛同南阳牛的体重对比研究[J]. 王之保,祁兴磊,冯建华,孙秀玉,王伟. 中国牛业科学. 2008(05)
[6]夏南牛的培育[J]. 李鹏飞,茹宝瑞,祁兴磊,王之保. 中国牛业科学. 2008(03)
硕士论文
[1]无角间性奶山羊PISRT1、FOXL2基因及PIS区域研究[D]. 张宇.河北农业大学 2014
[2]无角间性奶山羊FOXL2基因及PIS区域变异研究[D]. 张晶晶.河北农业大学 2010
本文编号:3247519
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:48 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 夏南牛与云岭牛品种简介
1.2 牛角的形态发育
1.2.1 牛角的形态结构
1.2.2 牛角的发育
1.2.3 有角牛和无角牛的组织学差异
1.3 牛角性状的研究进展
1.4 牦牛无角基因的研究进展
1.5 绵羊无角基因的研究进展
1.6 山羊无角基因的研究进展
1.7 试验的目的与意义
第二章 云岭牛和夏南牛无角性状的分子鉴定
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验主要试剂和配制方法
2.1.3 主要仪器和设备
2.1.4 试验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 基因组DNA检测结果
2.2.2 单倍型P_(202ID)的扩增结果
2.3 讨论
第三章 全基因组分析云岭牛角形差异的遗传背景
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 全基因组测序
3.1.3 数据质量质控
3.1.4 reads比对
3.1.5 全基因组SNP的鉴定
3.1.6 SNP注释
3.1.7 P_(202ID)单倍型的鉴定
3.1.8 主成分分析
3.1.9 系统发育分析
3.2 结果与分析
3.2.1 reads质控统计
3.2.2 比对统计
3.2.3 SNP检测
3.2.4 P_(202ID)单倍型的鉴定
3.2.5 主成分分析
3.2.6 系统发育分析
3.3 讨论
第四章 无角性状分子鉴定技术在黄牛无角品系选育中的应用
4.1 黄牛无角品系的选育方案
4.1.1 不利用分子鉴定技术,制定黄牛无角品系的选育方案
4.1.2 利用分子鉴定技术,制定的黄牛无角品系的选育方案
4.2 云岭牛和夏南牛无角品系的扩群方案
第五章 结果与创新点
5.1 结论
5.2 创新点
参考文献
附录
致谢
作者简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]关中奶山羊PIS区域序列多态性分析[J]. 侯策,粟小平,王起恬,崔奎青,石德顺,刘庆友. 中国畜牧兽医. 2017(12)
[2]优良肉牛新品种云岭牛[J]. 夏嘉. 农村百事通. 2017(21)
[3]“云岭牛”通过国家畜禽遗传资源委员会的现场审定[J]. 李亚鸣. 农村实用技术. 2014(06)
[4]牦牛角的形态发生及Shh和β-catenin的时空表达[J]. 任强,郁枫,王旭强,赵云辉,李静. 西北农业学报. 2009(01)
[5]夏南牛与南阳牛的杂交后代牛同南阳牛的体重对比研究[J]. 王之保,祁兴磊,冯建华,孙秀玉,王伟. 中国牛业科学. 2008(05)
[6]夏南牛的培育[J]. 李鹏飞,茹宝瑞,祁兴磊,王之保. 中国牛业科学. 2008(03)
硕士论文
[1]无角间性奶山羊PISRT1、FOXL2基因及PIS区域研究[D]. 张宇.河北农业大学 2014
[2]无角间性奶山羊FOXL2基因及PIS区域变异研究[D]. 张晶晶.河北农业大学 2010
本文编号:3247519
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3247519.html