鸭MEF2D基因编码区克隆及其微卫星多态与屠宰性能的关联分析

发布时间：2021-06-24 19:40

　　肌细胞增强因子2 （Myocyte enhancer factor2, MEF2）是转录调节因子MADS-box家族成员之一。在脊椎动物中该基因家族有4个成员：MEF2A、 MEF2B、MEF2C和MEF2D。MEF2家族基因在动物机体组织中分布广泛,目前在心肌细胞、骨骼肌细胞以及神经细胞中均可检测到MEF2家族成员的表达,在肌肉组织发生、发育和再生调控中扮演重要角色。MEF2D基因作为MEF2家族成员之一,已证明了其对心脏、骨骼肌和神经元的形成和发育都具有重要的生理作用。本课题组前期研究发现鸭MEF2D基因第9外显子区域存在一个以CAG为重复的微卫星序列。本研究拟采用分子克隆技术获得鸭MEF2D基因编码区全序列,进一步鉴定CAG重复序列是否存在多态性,以及分析该微卫星位点的多态性对北京鸭和建昌鸭屠宰性状的可能影响。主要研究结果如下：（1）克隆获得了鸭MEF2D基因编码区全序列,该序列全长1578bp,可编码525个氨基酸残基,分子式为C2471H3954N732O809S13,分子量为57277.7Da。获得的鸭MEF2D基因含有MADS-box区域和MEF2结构域特征,其中MADS... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
引言
1 文献综述
    1.1 肌肉发生和发育的调控因子
        1.1.1 MRFs家族
        1.1.2 MEF2家族
        1.1.3 TGF-β家族
        1.1.4 Pax家族
        1.1.5 LIM蛋白
    1.2 MEF2基因家族的结构和功能
        1.2.1 MEF2基因的定位
        1.2.2 MEF2的结构
        1.2.3 MEF2基因的功能
        1.2.4 MEF2基因的表达特性
    1.3 MEF2基因家族的多态性研究
        1.3.1 MEF2基因的SNP研究
        1.3.2 MEF2的微卫星多态研究
    1.4 本研究的目的和意义
2 材料和方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 试剂和药品
        2.1.3 试验仪器、设备
        2.1.4 主要溶液、试剂的配制
    2.2 试验方法
        2.2.1 取样方法
        2.2.2 总RNA的提取
        2.2.3 RNA的检测
        2.2.4 RNA的反转录
        2.2.5 总DNA的提取
        2.2.6 DNA的检测
        2.2.7 克隆引物的设计
        2.2.8 PCR扩增
        2.2.9 DNA片段的克隆测序
        2.2.10 多态位点的检测
        2.2.11 数据处理与统计分析
3 结果与分析
    3.1 鸭MEF2D基因的克隆
        3.1.1 总RNA提取效果检测
        3.1.2 鸭MEF2D基因的克隆、测序
    3.2 鸭MEF2D基因CAG重复的鉴定
        3.2.1 鉴定方法
        3.2.2 鸭MEF2D基因CAG重复数的检测
    3.3 MEF2D基因CAG重复多态信息统计
        3.3.1 不同基因型在两个鸭群体中的分布
        3.3.2 遗传特性分析
    3.4 MEF2D基因的结构、功能分析
        3.4.1 MEF2D基因编码蛋白的一级结构分析
        3.4.2 MEF2D蛋白的理化性质分析
        3.4.3 MEF2D基因编码蛋白的二级结构分析
        3.4.4 MEF2D蛋白的疏水性分析
        3.4.5 MEF2D蛋白的磷酸化位点分析
        3.4.6 MEF2D蛋白糖基化位点分析
        3.4.7 MEF2D基因编码蛋白的亚细胞定位分析
        3.4.8 MEF2D蛋白结构域分析
    3.5 MEF2D基因的分子进化分析
        3.5.1 MEF2D基因的同源性分析
        3.5.2 基于MEF2D基因的分子进化树构建
    3.6 鸭MEF2D基因CAG重复多态性与屠宰性能相关性分析
4 讨论
    4.1 鸭MEF2D基因编码区序列变异特点
    4.2 鸭MEF2D编码区微卫星CAG位点存在多态性
    4.3 鸭MEF2D编码区微卫星多态可能对胸肌重有贡献
5 结果及结论
6 参考文献
致谢
附录
    附录1 鸭MEF2D基因氨基酸同源性比对(1)
    附录2 鸭MEF2D基因氨基酸同源性比对(2)
    附录3 参与的科研项目与发表的论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]TGF-β/Myostatin在骨骼肌再生与纤维化中的作用[J]. 王荣国,肖诚,王云亭.  中国中医基础医学杂志. 2012(05)
[2]斑马鱼心脏再生的研究[J]. 孙彬,马鹏程,陈桂来,王祥川,李云.  生命的化学. 2011(02)
[3]MEF2A与肝星状细胞活化的关系研究[J]. 李善高,刘军,胡华军,吕宾,孟立娜,蔡利军.  中国病理生理杂志. 2010(02)
[4]优质鸡MEF2A基因的SNPs检测及其与屠体性状的相关研究[J]. 周艳,刘益平,蒋小松,杜华锐,朱庆.  畜牧兽医学报. 2009(08)
[5]多重荧光PCR-毛细管电泳进行微卫星不稳定性分析中的常见问题[J]. 潘菲,宋坤,盛弘强,来茂德.  临床与实验病理学杂志. 2008(05)
[6]肌肉发生相关基因的网络调控研究[J]. 张宇,李海,孔建铭,韩登桥,连正兴.  黑龙江畜牧兽医. 2007(10)
[7]MEF2A基因CAG三联核苷酸重复序列与冠状动脉粥样硬化性心脏病的相关研究[J]. 戴大鹏,何青,周晓阳,肖尧,张志欣,钱贻简,蔡剑平.  中华老年心脑血管病杂志. 2006(10)
[8]中国人群MEF2A基因与冠状动脉疾病的易感性（英文）[J]. 袁洪,闾宏伟,胡靖,陈淑华,阳国平,黄志军.  中南大学学报(医学版). 2006(04)
[9]微卫星DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）银染法的改良[J]. 张志峰,史洪才,武坚,简子健.  生物技术. 2005(03)
[10]鸟类适应于飞翔的构造和机能[J]. 蒋维.  化石. 2004(04)

博士论文
[1]新生小鼠心肌再生机制的研究[D]. 王振华.北京协和医学院 2013

硕士论文
[1]山羊MEF2基因家族的克隆及其组织表达规律的研究[D]. 程波.四川农业大学 2012
[2]凉山半细毛羊Mef2A、Mef2C基因克隆与组织时空表达[D]. 吴忠海.四川农业大学 2010
[3]鸭MEF2家族的克隆及组织表达研究[D]. 司建民.四川农业大学 2009
[4]猪MEF2A基因的克隆及表达规律的研究[D]. 杨龙.东北农业大学 2008
[5]猪骨骼肌卫星细胞的培养、鉴定及猪MEF2B和MEF2C基因的初步研究[D]. 何波.华中农业大学 2006



本文编号：3247712