鸡腺病毒12个血清型代表毒株Penton蛋白基因分析
发布时间：2021-07-03 05:57
为了解鸡腺病毒（fowl adenovirus,FAdV）Penton基因的遗传进化规律,试验根据GenBank中已公布的各基因型序列设计特异性引物,通过PCR技术分别扩增12个血清型毒株的Penton基因,连接至pEASY-Blunt Simple Cloning Vector上进行序列测定,并将12个血清型毒株Penton蛋白的核苷酸序列与NCBI上已公布的标准毒株的核苷酸序列使用ClustalW法进行分析比对,绘制遗传进化树。结果显示,12种血清型Penton蛋白核苷酸序列与各血清型标准毒株同源性均在99.2%以上,其中FAdV-1、FAdV-2、FAdV-3、FAdV-4、FAdV-6、FAdV-7、FAdV-8a、FAdV-8b、FAdV-10、FAdV-11与对应标准株同源性高达100%,这进一步证实了实验室保存毒株与世界相应标准毒株的一致性。Penton蛋白虽然保守性较高,但不同种之间仍存在明显差异。FAdV-A1与其他种毒株同源性为70.6%～73.3%;FAdV-B5与其他种毒株同源性为70.6%～77.9%;FAdV-C同种不同血清型之间核苷酸同源性为99.6%,F...
【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(11)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
Penton基因核苷酸序列同源性比对
图4 Penton基因核苷酸序列同源性比对表3 12种血清型毒株BLAST结果Table 3 BLAST results of 12 serotype strains % 基因型Genotypes 血清型Serotypes 基因型Genotypes A B C D E A FAdV-1 99.03～100.00 78.30 75.11～75.25 75.45～76.21 77.23～77.58 B FAdV-5 \\ 99.02～99.20 76.09～76.45 79.44～80.45 82.00～82.70 C FAdV-4 98.49 \\ 98.86～100.00 76.06～76.26 77.97～78.24 FAdV-10 98.61 \\ 98.99～100.00 76.11～76.31 78.07～78.31 D FAdV-2 \\ 80.03～80.24 76.26～76.47 95.54～100.00 83.80～84.82 FAdV-3 \\ 79.87～80.08 75.47～75.68 95.62～100.00 84.01～84.98 FAdV-9 \\ 79.44～79.72 75.74～75.88 95.48～99.94 83.83～85.05 FAdV-11 \\ 80.10～80.31 76.09～76.31 95.54～100.00 84.32～85.18 E FAdV-6 \\ 82.42～82.43 78.05～78.35 84.39～85.05 97.83～100.00 FAdV-7 76.48～76.86 81.93～81.94 77.25～78.61 83.76～84.62 97.42～100.00 FAdV-8a \\ 81.93～82.08 78.37～78.58 83.86～84.70 97.72～100.00 FAdV-8b \\ 82.35～82.36 78.34～78.55 84.58～85.31 97.71～100.00 \，无此项\，There is no such item
以各血清型毒株DNA为模板,使用设计的5对引物扩增Penton基因,得到各血清型的Penton基因长度约为1 831、1 899、1 691、1 794和1 774 bp(图1),均与预期片段大小一致。2.2 不同毒株之间Penton基因的遗传进化分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]禽腺病毒W株Hexon基因的分子特征及其致鸡胚侏儒化研究[J]. 陈田田,刘琳,赵玉杰,刘建勋,王赛楠,何春辉,李新生. 畜牧与兽医. 2019(09)
[2]Ⅰ群禽腺病毒hexon基因分型与序列分析[J]. 朱小甫,吴旭锦. 动物医学进展. 2018(10)
[3]新型鸡心包炎—包涵体肝炎病毒的分离及鉴定[J]. 汪凯,蔡骁垚,叶建强,刘红梅,张泉,刘芹防,李泽君,陈鸿军. 中国动物传染病学报. 2016(04)
本文编号：3262008
【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(11)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
Penton基因核苷酸序列同源性比对
图4 Penton基因核苷酸序列同源性比对表3 12种血清型毒株BLAST结果Table 3 BLAST results of 12 serotype strains % 基因型Genotypes 血清型Serotypes 基因型Genotypes A B C D E A FAdV-1 99.03～100.00 78.30 75.11～75.25 75.45～76.21 77.23～77.58 B FAdV-5 \\ 99.02～99.20 76.09～76.45 79.44～80.45 82.00～82.70 C FAdV-4 98.49 \\ 98.86～100.00 76.06～76.26 77.97～78.24 FAdV-10 98.61 \\ 98.99～100.00 76.11～76.31 78.07～78.31 D FAdV-2 \\ 80.03～80.24 76.26～76.47 95.54～100.00 83.80～84.82 FAdV-3 \\ 79.87～80.08 75.47～75.68 95.62～100.00 84.01～84.98 FAdV-9 \\ 79.44～79.72 75.74～75.88 95.48～99.94 83.83～85.05 FAdV-11 \\ 80.10～80.31 76.09～76.31 95.54～100.00 84.32～85.18 E FAdV-6 \\ 82.42～82.43 78.05～78.35 84.39～85.05 97.83～100.00 FAdV-7 76.48～76.86 81.93～81.94 77.25～78.61 83.76～84.62 97.42～100.00 FAdV-8a \\ 81.93～82.08 78.37～78.58 83.86～84.70 97.72～100.00 FAdV-8b \\ 82.35～82.36 78.34～78.55 84.58～85.31 97.71～100.00 \，无此项\，There is no such item
以各血清型毒株DNA为模板,使用设计的5对引物扩增Penton基因,得到各血清型的Penton基因长度约为1 831、1 899、1 691、1 794和1 774 bp(图1),均与预期片段大小一致。2.2 不同毒株之间Penton基因的遗传进化分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]禽腺病毒W株Hexon基因的分子特征及其致鸡胚侏儒化研究[J]. 陈田田,刘琳,赵玉杰,刘建勋,王赛楠,何春辉,李新生. 畜牧与兽医. 2019(09)
[2]Ⅰ群禽腺病毒hexon基因分型与序列分析[J]. 朱小甫,吴旭锦. 动物医学进展. 2018(10)
[3]新型鸡心包炎—包涵体肝炎病毒的分离及鉴定[J]. 汪凯,蔡骁垚,叶建强,刘红梅,张泉,刘芹防,李泽君,陈鸿军. 中国动物传染病学报. 2016(04)
本文编号：3262008
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