应用高通量测序技术分析青海牦牛引进山东后瘤胃菌群的变化

发布时间：2021-07-03 06:47

　　试验旨在探讨不同的饲养环境及日粮结构对牦牛瘤胃菌群结构的影响,应用高通量测序技术分析了青海牦牛引进山东后的瘤胃菌群变化情况。结果表明,青海牦牛瘤胃液可见物种（Observed species）及Chao1指数（Chao1 index）与引进牦牛瘤胃液相比差异极显著（P<0.01）,ACE指数差异显著（P<0.05）;青海牦牛菌群丰度显著高于引进牦牛,说明青海牦牛引进山东后瘤胃菌群丰度发生了显著变化,而引进前后牦牛瘤胃液香浓指数（Shannon index）以及辛普森指数（Simpson index）差异不显著（P>0.05）,说明青海牦牛引进山东后瘤胃菌群多样性未显著改变。测序数据表明,牦牛瘤胃液中丰度较高的菌群依次是拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、疣微菌门、互养菌门、软壁菌门、纤维杆菌门;青海牦牛引进山东后菌群结构比例变化显著的门是浮霉菌门和装甲菌门（P<0.05）,变化显著的属是颤杆菌克属和帕匹杆菌属（P<0.05）。数据分析得出,拟杆菌和理研菌科在青海牦牛瘤胃液中起重要作用,而普雷沃氏菌科、琥珀酸弧菌科和产气单胞菌在引进山东牦牛瘤胃液中起主要的作用,推... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(07)北大核心

【文章页数】：12 页

【部分图文】：

样本16S rDNA基因S5-16SV45区域扩增结果

根据聚类得到的OTUs分析两组样本之间共有和特有OTUs,绘制成韦恩图(Venn diagram)。图中每个圈代表1组样本,圈和圈重叠部分的数字代表两组共有的OTUs个数。由图2可知,牦牛由青海迁至山东后瘤胃液菌群多样性降低。2.2.2 牦牛瘤胃液各样品物种丰度分析

基于OTU水平的PCA分析

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3262093