马、驴Y-STR与Y-CNV遗传变异及其睾丸组织转录组研究

发布时间：2021-07-04 12:39

　　线粒体DNA与Y染色体微卫星（Y-STR）、Y染色体单核苷酸多态性（Y-SNP）标记是研究动物母系与父系遗传变异与起源进化的重要工具。利用常染色体微卫星标记和线粒体基因组分析马、驴遗传多样性、起源进化的研究很多,但利用Y染色体雄性特异区Y-STR和Y染色体拷贝数变异（Y-CNV）研究马属动物遗传变异的报道甚少。Y-CNV可以揭示动物Y染色体雄性特异区基因的拷贝数变异,该变异与雄性繁殖力性状密切相关。许多物种的Y染色体基因拷贝数已被鉴定,但马和驴Y染色体基因的拷贝数变异未见报道。睾丸组织是精子发生的场所,了解公畜睾丸组织基因差异表达及microRNAs的表达对提高雄性繁殖力非常重要。隐睾症是单侧或双侧睾丸未下降至阴囊的先天性畸形,会降低动物繁殖力。因此,研究马正常睾丸与隐睾间的差异表达基因,对揭示动物隐睾的遗传机理及导致繁殖力下降的原因十分重要。本研究利用荧光微卫星方法分析了马、驴Y染色体遗传多样性与父系起源;利用实时荧光定量方法鉴定了马、驴Y染色体基因的拷贝数变异;利用RNA-seq和生物信息学方法分析了马正常睾丸和隐睾的差异表达基因和microRNAs表达差异,中国地方驴睾丸组织的差... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：185 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

MSY常染色质序列分子进化途径

不同颜色区分 X 基因在 Y 染色体上同源基因的类（蓝色）；X-转座基因（粉色）。图中四个黄色矩形代表 4 Skaletsky et al. 2003）。 Ks versus X-linked gene order for 31 X–Y gene (or gene/pseudo-linked gene names indicates whether Y homologues are X-degenX-transposed (pink). Within the plot, four yellow rectangles denofined ‘evolutionary strata’ (Adapted from Skaletsky et al. 2003).

锁基因及其 Ks。不同颜色区分 X 基因在 Y 染色体上同源基因的类型：基因（蓝色）；X-转座基因（粉色）。图中四个黄色矩形代表 4 个进化Skaletsky et al. 2003）。 Plot of Ks versus X-linked gene order for 31 X–Y gene (or gene/pseudogene) g of X-linked gene names indicates whether Y homologues are X-degenerate (ue) or X-transposed (pink). Within the plot, four yellow rectangles denote foudefined ‘evolutionary strata’ (Adapted from Skaletsky et al. 2003).

【参考文献】：
期刊论文
[1]马基因组研究进展[J]. 杨虹,马月辉,李蓓,芒来.  遗传. 2010(03)
[2]应用微卫星标记分析23个中国地方马种的遗传多样性[J]. 凌英会,成月娇,王艳萍,关伟军,韩建林,傅宝玲,赵倩君,何晓红,浦亚斌,马月辉.  生物多样性. 2009(03)
[3]中国8个地方驴种遗传多样性和系统发生关系的微卫星分析[J]. 朱文进,张美俊,葛慕湘,关学敏,苏咏梅,姜玉锁,张桂贤,郭传甲.  中国农业科学. 2006(02)



本文编号：3264803