河南省部分地区猪腹泻类冠状病毒流行病学调查及PEDV遗传进化分析
发布时间：2021-07-06 17:58
目前调查研究表明,猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）和猪δ冠状病毒（PDCoV）是导致猪病毒性腹泻的常见病原,它们都可使不同生长阶段猪群发生急性水样腹泻、呕吐,严重时脱水致死,尤其在哺乳仔猪中有较高的感染率。由于这三种病原在临床症状中难以区分,因而对猪病毒性腹泻疑似病例进行病原检测尤为重要。为探究猪病毒性腹泻在河南省地区的流行情况,本研究拟对河南省部分地区的猪群腹泻冠状病毒（PDCoV、TGEV和PEDV）的感染情况进行调查,并对其中的25份PEDV阳性病料进行了ORF3、N、M基因的扩增及序列测定,还对其中18株PEDV阳性病料S基因进行了扩增及序列测定,并且与经典毒株CV777及国内外流行毒株基因序列进行了遗传进化分析。1.河南省部分地区猪群腹泻类冠状病毒的流行病学调查对来自河南省部分地区猪场的2017年至2018年期间采集的255份腹泻病料进行RTPCR检测,以分析PDCoV、PEDV和TGEV在河南地区猪群中的流行情况。结果显示255份腹泻病料中,PEDV阳性病料达115份,占45.10%,TGEV阳性病料有68份,阳性率占26.67%,PDCoV阳性...
【文章来源】：河南农业大学河南省
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
PEDV、PDCoV和TGEV目的片段的RT-PCR扩增结果
18C D图1-3 河南省不同地区猪场检测腹泻情况分布Fig.1-3 Diarrhea distribution in pig farms in different areas of Henan province.A：检测样品阳性分布；B：检测PDCoV阳性分布；C: 检测PEDV阳性分布；D: 检测TGEV阳性分布；A: positive distribution of test samples; B: detection of PDCoV positive distribution; C: detection of PEDVpositive distribution; D: detection of TGEV positive distribution;2.4 不同时间PEDV、TGEV 和PDCoV检测结果根据不同时间检测腹泻冠状病毒感染情况如表1-6和图1-4，运用RT-PCR方法在7-8月份PDCoV、TGEV和PEDV均未检测到，PEDV在一月份检出率最高达96.43%；PDCoV在一月份检出率最高达82.14%。而PEDV、PDCoV和TGEV在春冬季节感染相对较高，其中PEDV在冬季的检出率高达85.48%，PDCoV和TGEV在春季的检出率分别为14.39%和45.45%。显示腹泻冠状病毒的感染受季节变化影响，在较低环境中容易发生腹泻冠状病毒的感染。
2017.12 16 12(75) 1(6.25) 5(31.25)2018.1 28 27(96.43) 0(0) 23(82.14)图1-4 不同时间猪场腹泻检测阳性率分布情况Fig.1-4 Distribution of positive rates of diarrhea in pig farms at different times2.5 不同生长阶段PEDV、PDCoV和TGEV检测结果运用RT-PCR方法进行PEDV、PDCoV和TGEV病原核酸检测，按照不同生长阶段进行比较，结果见表1-7和图1-5，河南省不同猪群中哺乳仔猪感染PEDV阳性率为75.90%，PDCoV的阳性率为48.19%，而TGEV在哺乳仔猪阶段的阳性率为13.25%。在母猪阶段PEDV的感染也相对较高为27.59%，而PDCoV较低为2.59%。从整体来看，猪群感染腹泻类冠状病毒大多处于哺乳仔猪阶段。
【参考文献】：
期刊论文
[1]2013-2014年黑龙江地区猪流行性腹泻病毒检测及M基因的遗传进化分析[J]. 刘佳丽,王梓,赵莉,王瑞翀,李一经,王丽,唐丽杰,徐义刚,刘敏,乔薪瑗. 中国兽医杂志. 2017(08)
[2]猪Delta冠状病毒和猪流行性腹泻病毒双重RT-PCR诊断方法的建立及初步应用[J]. 韩丽,周雍,李炳晓,曹贝贝,梁青青,张利卫,胡慧. 中国兽医科学. 2017(05)
[3]猪δ冠状病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用[J]. 张利卫,曹贝贝,张云飞,张君涛,韦学雷,兰培英,胡慧. 农业生物技术学报. 2017(06)
[4]2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析[J]. 吴旺霞,王一成,吴润,袁秀芳,徐丽华,李军星,苏菲. 浙江农业学报. 2017(03)
[5]猪德尔塔冠状病毒RT-PCR检测方法的建立及应用[J]. 郑丽,王利丽,路超,杨春蕾,李富强,张莉,鄢明华. 中国兽医科学. 2017(03)
[6]猪δ冠状病毒检测方法研究进展[J]. 龙云凤,王毅谦,姜珊,苏志同,李寒玲,吴绍强,姜焱. 畜牧与兽医. 2017(03)
[7]猪德尔塔冠状病毒病的综合防治措施[J]. 张永香,陈海南. 兽医导刊. 2017(01)
[8]新发PDCoV和TGEV双重RT-PCR检测方法的建立及初步应用[J]. 刘玲玲,曹贝贝,张利卫,韩丽,韦学雷,兰培英,胡慧,王亚宾. 农业生物技术学报. 2016(12)
[9]以原核表达的猪δ冠状病毒N蛋白为包被抗原的间接ELISA方法的建立[J]. 张帆帆,宋德平,郭楠楠,叶昱,周信荣,李安琪,张敏,彭棋,陈燕君,黄冬艳,唐玉新. 中国预防兽医学报. 2016(10)
[10]新发现的冠状病毒属——丁型冠状病毒[J]. 王逸雯,黄耀伟. 生命的化学. 2016(04)
博士论文
[1]河南省猪流行性腹泻病毒遗传进化分析及免疫学检测方法的建立[D]. 李任峰.西北农林科技大学 2016
硕士论文
[1]中东呼吸综合征冠状病毒受体结合的分子机制研究[D]. 胡亚伟.安徽大学 2014
[2]猪传染性胃肠炎病毒膜蛋白亲和多肽的筛选与鉴定[D]. 邹昊.东北农业大学 2013
[3]猪流行性腹泻病毒S、M、ORF3基因的克隆和序列分析[D]. 李衡.华中农业大学 2013
[4]猪传染性胃肠炎病毒的分离鉴定及结构基因重组杆状病毒的构建[D]. 冷勇.西南大学 2013
[5]携PEDV M、N基因的减毒沙门氏菌株构建及其免疫原性研究[D]. 任玉鹏.四川农业大学 2012
[6]两种猪肠道冠状病毒诊断方法的建立和国内新分离毒株主要结构蛋白基因克隆与序列分析[D]. 杨群.南京农业大学 2005
[7]三株猪流行性腹泻病毒的Envelope（Small Membrane，sM）编码基因的序列测定比较[D]. 刘春艳.中国农业科学院 2003
本文编号：3268708
【文章来源】：河南农业大学河南省
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
PEDV、PDCoV和TGEV目的片段的RT-PCR扩增结果
18C D图1-3 河南省不同地区猪场检测腹泻情况分布Fig.1-3 Diarrhea distribution in pig farms in different areas of Henan province.A：检测样品阳性分布；B：检测PDCoV阳性分布；C: 检测PEDV阳性分布；D: 检测TGEV阳性分布；A: positive distribution of test samples; B: detection of PDCoV positive distribution; C: detection of PEDVpositive distribution; D: detection of TGEV positive distribution;2.4 不同时间PEDV、TGEV 和PDCoV检测结果根据不同时间检测腹泻冠状病毒感染情况如表1-6和图1-4，运用RT-PCR方法在7-8月份PDCoV、TGEV和PEDV均未检测到，PEDV在一月份检出率最高达96.43%；PDCoV在一月份检出率最高达82.14%。而PEDV、PDCoV和TGEV在春冬季节感染相对较高，其中PEDV在冬季的检出率高达85.48%，PDCoV和TGEV在春季的检出率分别为14.39%和45.45%。显示腹泻冠状病毒的感染受季节变化影响，在较低环境中容易发生腹泻冠状病毒的感染。
2017.12 16 12(75) 1(6.25) 5(31.25)2018.1 28 27(96.43) 0(0) 23(82.14)图1-4 不同时间猪场腹泻检测阳性率分布情况Fig.1-4 Distribution of positive rates of diarrhea in pig farms at different times2.5 不同生长阶段PEDV、PDCoV和TGEV检测结果运用RT-PCR方法进行PEDV、PDCoV和TGEV病原核酸检测，按照不同生长阶段进行比较，结果见表1-7和图1-5，河南省不同猪群中哺乳仔猪感染PEDV阳性率为75.90%，PDCoV的阳性率为48.19%，而TGEV在哺乳仔猪阶段的阳性率为13.25%。在母猪阶段PEDV的感染也相对较高为27.59%，而PDCoV较低为2.59%。从整体来看，猪群感染腹泻类冠状病毒大多处于哺乳仔猪阶段。
【参考文献】：
期刊论文
[1]2013-2014年黑龙江地区猪流行性腹泻病毒检测及M基因的遗传进化分析[J]. 刘佳丽,王梓,赵莉,王瑞翀,李一经,王丽,唐丽杰,徐义刚,刘敏,乔薪瑗. 中国兽医杂志. 2017(08)
[2]猪Delta冠状病毒和猪流行性腹泻病毒双重RT-PCR诊断方法的建立及初步应用[J]. 韩丽,周雍,李炳晓,曹贝贝,梁青青,张利卫,胡慧. 中国兽医科学. 2017(05)
[3]猪δ冠状病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用[J]. 张利卫,曹贝贝,张云飞,张君涛,韦学雷,兰培英,胡慧. 农业生物技术学报. 2017(06)
[4]2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析[J]. 吴旺霞,王一成,吴润,袁秀芳,徐丽华,李军星,苏菲. 浙江农业学报. 2017(03)
[5]猪德尔塔冠状病毒RT-PCR检测方法的建立及应用[J]. 郑丽,王利丽,路超,杨春蕾,李富强,张莉,鄢明华. 中国兽医科学. 2017(03)
[6]猪δ冠状病毒检测方法研究进展[J]. 龙云凤,王毅谦,姜珊,苏志同,李寒玲,吴绍强,姜焱. 畜牧与兽医. 2017(03)
[7]猪德尔塔冠状病毒病的综合防治措施[J]. 张永香,陈海南. 兽医导刊. 2017(01)
[8]新发PDCoV和TGEV双重RT-PCR检测方法的建立及初步应用[J]. 刘玲玲,曹贝贝,张利卫,韩丽,韦学雷,兰培英,胡慧,王亚宾. 农业生物技术学报. 2016(12)
[9]以原核表达的猪δ冠状病毒N蛋白为包被抗原的间接ELISA方法的建立[J]. 张帆帆,宋德平,郭楠楠,叶昱,周信荣,李安琪,张敏,彭棋,陈燕君,黄冬艳,唐玉新. 中国预防兽医学报. 2016(10)
[10]新发现的冠状病毒属——丁型冠状病毒[J]. 王逸雯,黄耀伟. 生命的化学. 2016(04)
博士论文
[1]河南省猪流行性腹泻病毒遗传进化分析及免疫学检测方法的建立[D]. 李任峰.西北农林科技大学 2016
硕士论文
[1]中东呼吸综合征冠状病毒受体结合的分子机制研究[D]. 胡亚伟.安徽大学 2014
[2]猪传染性胃肠炎病毒膜蛋白亲和多肽的筛选与鉴定[D]. 邹昊.东北农业大学 2013
[3]猪流行性腹泻病毒S、M、ORF3基因的克隆和序列分析[D]. 李衡.华中农业大学 2013
[4]猪传染性胃肠炎病毒的分离鉴定及结构基因重组杆状病毒的构建[D]. 冷勇.西南大学 2013
[5]携PEDV M、N基因的减毒沙门氏菌株构建及其免疫原性研究[D]. 任玉鹏.四川农业大学 2012
[6]两种猪肠道冠状病毒诊断方法的建立和国内新分离毒株主要结构蛋白基因克隆与序列分析[D]. 杨群.南京农业大学 2005
[7]三株猪流行性腹泻病毒的Envelope（Small Membrane，sM）编码基因的序列测定比较[D]. 刘春艳.中国农业科学院 2003
本文编号：3268708
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