新疆南疆部分地区蜱种鉴定及斑点热群立克次体流行病学调查
发布时间：2021-07-17 15:35
为了解新疆南疆部分地区不同蜱种携带斑点热群立克次体（spotted fever group Rickettsia,SFGR）情况,采用PCR技术扩增16S rDNA基因和SFGR外膜蛋白A（OmpA）基因,进行蜱种鉴定及SFGR检测。对测序阳性样本进行BLAST序列分析,应用DNAStar和Mega 6.0软件构建遗传进化树。结果显示:从新疆南疆9个县市共采集蜱1 340只,其种类包括3属4种,分别为图兰扇头蜱、边缘革蜱、银盾革蜱、亚洲璃眼蜱;在随机挑选的90份蜱DNA样本中共检测出57份SFGR阳性样本,其中阿拉尔市十一团、七连地区的阳性样本均来自犬体表寄生蜱,其余地区的阳性样本均来自绵羊体表寄生蜱。序列分析及遗传进化树显示,此次检测的亚洲璃眼蜱、边缘革蜱携带的SFGR与GenBank公布的SFGR疆内株Candidatus R.barbariae（登录号为MG668832.1）亲缘关系最近,处于同一分支;图兰扇头蜱携带的SFGR也同疆内株R.massiliae、R.conorii、Candidatus R.barbariae（MG668831.1、KP214024.1、MG6688...
【文章来源】：中国兽医学报. 2020,40(04)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
蜱线粒体16S rDNA 基因PCR扩增
图1 蜱线粒体16S rDNA 基因PCR扩增表3 新疆南疆不同地区蜱内SFGR体感染率 采样地点 蜱数量/只 检测数/只 阳性数/只 感染率/% 阿瓦提县 500 12 10 83.33 乌什县 80 12 2 16.67 沙雅县 459 37 24 64.86 库车县 100 10 5 50.00 新和县 20 2 2 100.00 阿拉尔市十团 110 10 9 90.00 阿拉尔市八团 30 2 2 100.00 阿拉尔市十一团 40 4 2 50.00 阿拉尔市七连 1 1 1 100.00 合计 1 340 90 57 63.33
90份蜱线粒体16S rDNA基因序列经BLAST比对,结果显示与GenBank中已公布的图兰扇头蜱、银盾革蜱、边缘革蜱、亚洲璃眼蜱基因序列同源性高达99%以上,选取部分序列构建遗传进化树(图3)。57份SFGR OmpA基因序列与GenBank公布的蜱SFGR OmpA基因序列比对发现,存在4种不同的SFGR基因型(图4)。图4 SFGR OmpA基因系统进化树
【参考文献】：
期刊论文
[1]内蒙古锡林郭勒盟地区优势蜱种及其基因多样性分析[J]. 黄芳,黄天鹏,贺海燕,吴咪,朝木丽格,王云冲,格日勒图. 中国兽医学报. 2019(03)
[2]新疆部分地区优势种革蜱携带绵羊无浆体的检测及其进化关系[J]. 闻秀秀,王宁,苏布赛,刘世芳,许正茂,吾力江·卡马力,巴音查汗. 中国兽医学报. 2018(09)
[3]东北地区蜱携带的肝原虫分子检测[J]. 李忠宇,刘欢欢,刘全,马宏宇,魏峰. 中国兽医学报. 2018(09)
[4]新疆地区扇头蜱中Candidatus Rickettsia barbariae的检测与序列分析[J]. 孙响,张桂林,郑重,刘然,邱尔臣. 寄生虫与医学昆虫学报. 2017 (03)
[5]新发蜱传病原体——劳氏立克次体的研究现状[J]. 闻静,焦丹,鞠文东,黄玉明,王悦,王建华,时晓杰,成洪艳,程成,孙毅. 中国人兽共患病学报. 2015(04)
[6]《新英格兰医学杂志》:蜱媒传染病领域连获两项重大发现[J]. 现代生物医学进展. 2014(04)
[7]西安地区首次分离4株鼠型斑疹伤寒病原体[J]. 魏涧民,范明远. 西安交通大学学报(医学版). 1986(02)
硕士论文
[1]新疆南疆图兰扇头蜱鉴定及其携带部分病原检测[D]. 李飞.塔里木大学 2017
[2]新疆边境地区蜱种、蜱传立克次体分布规律及分子特征研究[D]. 郭利萍.石河子大学 2017
本文编号：3288451
【文章来源】：中国兽医学报. 2020,40(04)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
蜱线粒体16S rDNA 基因PCR扩增
图1 蜱线粒体16S rDNA 基因PCR扩增表3 新疆南疆不同地区蜱内SFGR体感染率 采样地点 蜱数量/只 检测数/只 阳性数/只 感染率/% 阿瓦提县 500 12 10 83.33 乌什县 80 12 2 16.67 沙雅县 459 37 24 64.86 库车县 100 10 5 50.00 新和县 20 2 2 100.00 阿拉尔市十团 110 10 9 90.00 阿拉尔市八团 30 2 2 100.00 阿拉尔市十一团 40 4 2 50.00 阿拉尔市七连 1 1 1 100.00 合计 1 340 90 57 63.33
90份蜱线粒体16S rDNA基因序列经BLAST比对,结果显示与GenBank中已公布的图兰扇头蜱、银盾革蜱、边缘革蜱、亚洲璃眼蜱基因序列同源性高达99%以上,选取部分序列构建遗传进化树(图3)。57份SFGR OmpA基因序列与GenBank公布的蜱SFGR OmpA基因序列比对发现,存在4种不同的SFGR基因型(图4)。图4 SFGR OmpA基因系统进化树
【参考文献】：
期刊论文
[1]内蒙古锡林郭勒盟地区优势蜱种及其基因多样性分析[J]. 黄芳,黄天鹏,贺海燕,吴咪,朝木丽格,王云冲,格日勒图. 中国兽医学报. 2019(03)
[2]新疆部分地区优势种革蜱携带绵羊无浆体的检测及其进化关系[J]. 闻秀秀,王宁,苏布赛,刘世芳,许正茂,吾力江·卡马力,巴音查汗. 中国兽医学报. 2018(09)
[3]东北地区蜱携带的肝原虫分子检测[J]. 李忠宇,刘欢欢,刘全,马宏宇,魏峰. 中国兽医学报. 2018(09)
[4]新疆地区扇头蜱中Candidatus Rickettsia barbariae的检测与序列分析[J]. 孙响,张桂林,郑重,刘然,邱尔臣. 寄生虫与医学昆虫学报. 2017 (03)
[5]新发蜱传病原体——劳氏立克次体的研究现状[J]. 闻静,焦丹,鞠文东,黄玉明,王悦,王建华,时晓杰,成洪艳,程成,孙毅. 中国人兽共患病学报. 2015(04)
[6]《新英格兰医学杂志》:蜱媒传染病领域连获两项重大发现[J]. 现代生物医学进展. 2014(04)
[7]西安地区首次分离4株鼠型斑疹伤寒病原体[J]. 魏涧民,范明远. 西安交通大学学报(医学版). 1986(02)
硕士论文
[1]新疆南疆图兰扇头蜱鉴定及其携带部分病原检测[D]. 李飞.塔里木大学 2017
[2]新疆边境地区蜱种、蜱传立克次体分布规律及分子特征研究[D]. 郭利萍.石河子大学 2017
本文编号：3288451
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