肉鸡CMTR2基因分子特征及其表达谱分析

发布时间：2021-07-21 01:49

　　【目的】分析肉鸡加帽甲基转移酶基因（CMTR2）分子特征及其表达谱,为后续开展鸡CMTR2基因结构及生物学功能研究打下基础。【方法】以艾拔益加（AA）肉鸡为研究对象,利用RT-PCR克隆CMTR2基因,使用DNAMAN、ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、TMHMM 2.0和SignalP 3.0等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测分析其表达特征。【结果】肉鸡CMTR2基因编码区（CDS）序列全长为2350 bp（登录号MN296490）,其开放阅读框（ORF）为2292 bp,编码763个氨基酸残基;肉鸡CMTR2氨基酸序列与原鸡CMTR2氨基酸序列的相似性为99.74%,只有2个氨基酸残基差异,与火鸡CMTR2氨基酸序列的亲缘关系较近（相似性为95.94%）。肉鸡CMTR2蛋白分子量为86855.48 Da,理论等电点（p I）为6.08,在哺乳动物网织红细胞体外表达的半衰期为30 h,在酵母体内表达的半衰期大于20 h,在大肠杆菌体内表达的半衰期大于10 h。肉鸡CMTR2蛋白为不稳定的亲水性蛋白,无信号肽和跨膜区域,包含61个磷酸化位点、... 

【文章来源】：南方农业学报. 2020,51(08)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

鸡CMTR2基因PCR扩增电泳结果

实时荧光定量PCR检测结果显示，CMTR2基因在42日龄AA肉鸡8种组织中的相对表达量排序为脾脏>肺脏>胸肌>腹脂>肝脏>肾脏>腿肌>心脏，以在脾脏中的相对表达量最高，显著高于在其他组织中的相对表达量（P<0.05，下同），而在心脏中的相对表达量显著低于在其他组织中的相对表达量（图10-A）。肉鸡CMTR2基因的时空表达变化趋势显示，在21日龄时的相对表达量最高，极显著高于其他日龄；在14日龄的相对表达量最低，而在28～42日龄的相对表达量呈逐渐上升趋势（图10-B）。图3 肉鸡CMTR2蛋白信号肽预测结果

肉鸡CMTR2蛋白信号肽预测结果

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3294052