免疫应激断奶仔猪胸腺相关miRNAs筛选及分析
发布时间:2021-07-22 01:39
随着现代养猪业的快速发展,仔猪的早期断奶已经成为国内外集约化养猪生产的关键技术。然而,断奶仔猪由于免疫系统发育不完善,容易受饲养环境中各种病原体的侵袭,导致免疫应激,使用于生长和骨骼肌蛋白质沉积的养分转而用于维持机体免疫应答,导致其代谢行为发生改变,进而引起生长发育缓慢和生产效率降低,给畜牧业带来严重经济损失,直接影响到猪场的生产水平和经济利益。免疫应激严重影响胸腺的发育,胸腺做为中枢免疫器官在免疫调控中发挥重要作用,目前的研究主要集中在蛋白质编码基因,miRNA介导的转录后水平为免疫应激分子机制提供了新的视角。本研究通过建立断奶仔猪的免疫应激模型,从胸腺中筛选相关差异表达miRNA,并对其进行鉴定和生物信息分析,其研究结果有利于进一步阐明断奶仔猪免疫应激的分子机制,也为利用miRNA及其靶基因信息来降低断奶仔猪免疫应激提供新的思路。本研究主要结果如下:1.将6头大约克夏断奶仔猪(21天断奶)按胎次相同、出生体重相近、随机分为试验组和对照组,每个组别各3头猪。试验组注射100μg/kg BW的LPS,对照组注射等量的生理盐水,3h后,采集断奶仔猪胸腺及其他各种组织。检测试验组和对照组仔...
【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词表
文献综述
1 免疫应激对断奶仔猪生长发育的影响
1.1 免疫应激的概念
1.2 断奶仔猪易发生免疫应激的原因
1.2.1 营养因素
1.2.2 环境因素
1.2.3 人为因素
1.2.4 心理因素
1.3 免疫应激对断奶仔猪生长发育的影响
1.3.1 免疫应激对断奶仔猪采食量的影响
1.3.2 免疫应激对断奶仔猪生产性能和发育的影响
1.4 免疫应激对断奶仔猪营养代谢的影响
1.4.1 免疫应激对断奶仔猪营养需求的影响
1.4.2 免疫应激对断奶仔猪蛋白质代谢的影响
1.4.3 免疫应激对断奶仔猪脂肪代谢的影响
1.4.4 免疫应激对断奶仔猪糖代谢的影响
1.4.5 免疫应激对断奶仔猪矿物代谢的影响
1.5 免疫应激对断奶仔猪免疫功能的影响
1.6 断奶仔猪免疫应激的缓解方法
1.6.1 保证断奶仔猪的营养
1.6.2 改善饲养环境
1.6.3 加强断奶仔猪保健
1.6.4 严控疫苗质量和免疫程序
2 MIRNA对免疫的调控
2.1 miRNA概述
2.2 miRNA的生成和作用机制
2.3 miRNA对免疫的调控作用
2.3.1 miRNA影响免疫细胞分化
2.3.2 miRNA对固有免疫的调控
2.3.3 miRNA与适应性免疫
3 SOLEXA高通量测序技术为猪新MIRNA发掘提供了有效途径
4 免疫应激模型建立
5 本研究的目的和意义
试验
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 主要试剂与设备
1.3 方法
1.3.1 动物试验
1.3.2 样品采集
1.3.3 血浆炎性细胞因子和生长激素水平检测
1.3.4 胸腺RNA提取及检测
1.3.5 小RNA文库的建立和测序
1.3.6 Solexa数据处理
1.3.7 差异miRNA的QPCR鉴定
1.3.8 差异miRNA的组织表达谱分析
1.4 试验数据处理和分析
1.4.1 靶基因的预测
1.4.2 差异表达miRNA的靶基因功能分析
1.4.3 KEGG通路分析
1.4.4 SPSS统计分析
2 结果与分析
2.1 血浆炎性细胞因子和生长激素水平检测结果
2.2 断奶仔猪胸腺免疫应激相关miRNA测序结果分析
2.2.1 RNA质量检测
2.2.2 solexa测序结果分析
2.2.3 仔猪胸腺中已知miRNAs的分析
2.2.4 己知miRNAs差异表达谱的分析
2.3 Q-PCR验证
2.4 组织表达谱分析
2.5 差异表达miRNAs的靶基因预测和WEGO功能分析
2.6 KEGG通路分析
3 讨论
3.1 LPS与断奶仔猪免疫应激
3.2 solexa测序结果和差异miRNAs的鉴定
3.3 miRNA的组织表达谱分析
3.4 miRNA靶基因预测和WEGO功能分析
3.5 miRNA的KEGG通路分析
4 结论
参考文献
附录
致谢
本文编号:3296183
【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词表
文献综述
1 免疫应激对断奶仔猪生长发育的影响
1.1 免疫应激的概念
1.2 断奶仔猪易发生免疫应激的原因
1.2.1 营养因素
1.2.2 环境因素
1.2.3 人为因素
1.2.4 心理因素
1.3 免疫应激对断奶仔猪生长发育的影响
1.3.1 免疫应激对断奶仔猪采食量的影响
1.3.2 免疫应激对断奶仔猪生产性能和发育的影响
1.4 免疫应激对断奶仔猪营养代谢的影响
1.4.1 免疫应激对断奶仔猪营养需求的影响
1.4.2 免疫应激对断奶仔猪蛋白质代谢的影响
1.4.3 免疫应激对断奶仔猪脂肪代谢的影响
1.4.4 免疫应激对断奶仔猪糖代谢的影响
1.4.5 免疫应激对断奶仔猪矿物代谢的影响
1.5 免疫应激对断奶仔猪免疫功能的影响
1.6 断奶仔猪免疫应激的缓解方法
1.6.1 保证断奶仔猪的营养
1.6.2 改善饲养环境
1.6.3 加强断奶仔猪保健
1.6.4 严控疫苗质量和免疫程序
2 MIRNA对免疫的调控
2.1 miRNA概述
2.2 miRNA的生成和作用机制
2.3 miRNA对免疫的调控作用
2.3.1 miRNA影响免疫细胞分化
2.3.2 miRNA对固有免疫的调控
2.3.3 miRNA与适应性免疫
3 SOLEXA高通量测序技术为猪新MIRNA发掘提供了有效途径
4 免疫应激模型建立
5 本研究的目的和意义
试验
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 主要试剂与设备
1.3 方法
1.3.1 动物试验
1.3.2 样品采集
1.3.3 血浆炎性细胞因子和生长激素水平检测
1.3.4 胸腺RNA提取及检测
1.3.5 小RNA文库的建立和测序
1.3.6 Solexa数据处理
1.3.7 差异miRNA的QPCR鉴定
1.3.8 差异miRNA的组织表达谱分析
1.4 试验数据处理和分析
1.4.1 靶基因的预测
1.4.2 差异表达miRNA的靶基因功能分析
1.4.3 KEGG通路分析
1.4.4 SPSS统计分析
2 结果与分析
2.1 血浆炎性细胞因子和生长激素水平检测结果
2.2 断奶仔猪胸腺免疫应激相关miRNA测序结果分析
2.2.1 RNA质量检测
2.2.2 solexa测序结果分析
2.2.3 仔猪胸腺中已知miRNAs的分析
2.2.4 己知miRNAs差异表达谱的分析
2.3 Q-PCR验证
2.4 组织表达谱分析
2.5 差异表达miRNAs的靶基因预测和WEGO功能分析
2.6 KEGG通路分析
3 讨论
3.1 LPS与断奶仔猪免疫应激
3.2 solexa测序结果和差异miRNAs的鉴定
3.3 miRNA的组织表达谱分析
3.4 miRNA靶基因预测和WEGO功能分析
3.5 miRNA的KEGG通路分析
4 结论
参考文献
附录
致谢
本文编号:3296183
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3296183.html