五指山猪肌肉组织lncRNA和mRNA的鉴定与分析

发布时间：2021-07-28 16:17

　　为了鉴定和分析五指山猪背最长肌和半腱肌中差异表达的lncRNA和mRNA,试验以6月龄五指山猪阉割公猪为试验动物,在无菌状态下逐头采集背最长肌和半腱肌样品,采用RNA-Seq文库和生物信息学方法对五指山猪肌肉组织中的lncRNA和mRNA进行分析筛选,运用DESeq软件鉴定背最长肌和半腱肌中差异表达的lncRNA和mRNA,并对差异表达的lncRNA进行靶基因预测分析。结果表明:在五指山猪肌肉组织中共鉴定出4 086个lncRNA,其中正义型2 203个、反义型197个、内含子型130个、基因间型1 556个。对比测序获得的lncRNA和mRNA发现,lncRNA和mRNA的长度都主要分布在600～1 200 nt之间和3 000 nt以上。在背最长肌与半腱肌间,存在82个差异表达的mRNA,其中前10位分别为ZIC4、ZIC1、PITX1、SIM1、PVALB、SEC14L5、SERPINB11、PRXL2B、ZNF862、MYBPH;存在32个差异表达的lncRNA,其中2个仅在背最长肌中表达,1个仅在半腱肌中表达,29个在两种肌肉组织中共表达;获得差异表达的lncRNA靶基因共7... 

【文章来源】：黑龙江畜牧兽医. 2020,(07)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

lncRNA的鉴定与分类

五指山猪肌肉组织lncRNA和mRNA长度特征的比对结果

差异表达IncRNA和mRNA的热图

【参考文献】：
期刊论文
[1]猪牛羊肌肉组织质构特性差异比较及肌纤维分析[J]. 王亮,张宝善,李林强,刘永锋.  中国牛业科学. 2016(03)
[2]海南五指山猪Myf5基因克隆与序列分析[J]. 晁哲,王峰,魏立民,孙瑞萍,黄丽丽,郑心力.  黑龙江畜牧兽医. 2014(09)

硕士论文
[1]ZIC1基因联合苦参碱对人乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖、迀移及凋亡的影响研究[D]. 于民.江苏大学 2016



本文编号：3308235