牛卵泡发育相关基因筛选及SIRT1、INHBA基因功能研究
发布时间：2021-08-03 08:23
卵泡生长发育及闭锁退化是一个复杂而又高度协调的生理过程,不仅受下丘脑-垂体-性腺轴（HPG axis）的调控,也受卵泡内旁分泌/自分泌因子等的共同调节。为进一步揭示牛卵泡发育的分子机制,筛查调控卵泡发育关键基因,本研究以牛卵巢为材料,采用高通量IlluminaHiSeq测序平台对四组不同级别卵泡（直径<2mm,2-5mm,5-8mm,>8mm）进行转录组测序,将质控过的数据比对到参考基因组,筛选出差异表达基因并进行趋势分析。对趋势基因进行GO分类和KEGG注释,找到趋势基因的生物学功能富集和特异性代谢通路。分析牛卵泡基因表达过程中存在的可变剪接现象及出现的新转录本。对部分差异表达基因开展实时定量PCR验证,在此基础上进一步选取SIRT1和INHBA基因进行功能研究。本研究主要研究内容和结果如下:1.测序数据统计与分析四组样本测序过滤后Quality scores大于20,mapping准确度大于99%,可用于后续分析;四组样本（按照卵泡直径由小到大,分别以BF1-4表示）能够比对到参考序列上的对比率分别为90.0%、89.0%、90.0%和92.5%。2.差异表达基因筛选将...
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：112 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
哺乳动物卵泡发育过程
图 1.2 SIRT1 催化的酶促反应[66]Fig.1.2 The enzymatic reaction catalyzed by SIRT1[66]酸化导致 NAD+依赖性脱乙酰酶活性降低，SIRT1 在体与clinB）和细胞周期蛋白依赖性激酶 1（Cdk1）形成复合物酸（Thr）530 和丝氨酸（Ser）540 为其底物可以被磷酸化速细胞周期进程，进而促进细胞增殖[82]。在氧化应激条1）磷酸化 SIRT1，人类 SIRT1 在三个位点上被 JNK1 磷酸530，磷酸化后增加了 SIRT1 对其底物之一组蛋白 H3 的脱3 没有影响[83]。双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶(DYRK)过磷酸化 SIRT1 Thr522 促进细胞存活[84]。白藜芦醇一直剂，但白藜芦醇还作用于许多其他酶，具有很强的抗氧化的还是间接的仍然存在争议[86,87]。sirtinol 可直接与 Sirt1烟酰胺是另一种常用的 sirtuin 抑制剂，是 NAD+的天然前产物[88,89]。
磷脂酰肌醇（3，4，5）-三磷酸（PIP3）域与 PIP3 结合，就会发生构象变化，将，导致 T308 磷酸化和 Akt 活性增加 100T 活性的翻译后修饰是可逆乙酰化。在基，肝脏，脑和骨骼肌中被乙酰化，并且酸被鉴定为 K14 和 K20，两者都位于 A氨酸进行去乙酰化对于AKT与PIP3的结.3）。PDK1 的 PH 结构域被乙酰化也会脱乙酰化形式显示出相反的结果，表明乙蛋白活性的常见机制。胰岛素受体底物S2 是 IGF-1R 信号的受体相关下游效应 SIRT1 依赖性脱乙酰化提高其活性，由此化也是肝细胞中胰岛素受体（IR）激酶 SIRT1 在多个水平上调胰岛素信号传导
【参考文献】：
期刊论文
[1]抑制素对绵羊颗粒细胞雌激素和孕酮分泌及相关基因表达的影响[J]. 李婷,马爱团,刘月琴,高昆,张继伟,张英杰. 畜牧兽医学报. 2017(09)
[2]转录组测序技术研究进展[J]. 洪奇阳,毕行建,王大宁,李子真,俞海,夏宁邵,李少伟. 中国生化药物杂志. 2017(06)
[3]绵羊小卵泡与中卵泡转录组差异特征分析[J]. 吴阳升,林嘉鹏,汪立芹,陈莹,黄俊成. 江苏农业学报. 2016(04)
[4]Sirt1-线粒体途径介导的缺血再灌注损伤保护作用机制[J]. 胡明珠,周波,季永. 南通大学学报(医学版). 2016(03)
[5]基于RNA-Seq识别山羊肉品质候选基因[J]. 孟宪然,杜琛,王静,付绍印,郑竹清,张文广,李金泉. 畜牧兽医学报. 2015(08)
[6]人卵巢颗粒细胞FoxO基因和卵泡刺激素受体基因的表达及相关性研究[J]. 梁莹,米梅艳,李淑贤,周莉,吴晓茜,雷灵梅. 河北医科大学学报. 2014(10)
[7]基于RNA-Seq高通量测序技术的牦牛卵巢转录组研究:进一步完善牦牛基因结构及挖掘与繁殖相关新基因[J]. 兰道亮,熊显荣,位艳丽,徐通,钟金城,字向东,王永,李键. 中国科学:生命科学. 2014(03)
[8]Role of sirtuins in ischemia-reperfusion injury[J]. Eirini Pantazi,Mohamed Amine Zaouali,Mohamed Bejaoui,Emma Folch-Puy,Hassen Ben Abdennebi,Joan Roselló-Catafau. World Journal of Gastroenterology. 2013(43)
[9]猪卵巢颗粒细胞中SIRT1基因表达量与雌激素分泌的相关性[J]. 李碧侠,赵芳,付言峰,王学敏,方晓敏,涂枫,任守文,王金玉. 江苏农业学报. 2013(03)
[10]巴美肉羊INHA和INHBA基因多态性与产羔数关系研究[J]. 索峰,刘永斌,特日格勒,祁云霞,何小龙,韩有胜,张莉,李虎山,荣威恒. 华北农学报. 2012(03)
博士论文
[1]内蒙古绒山羊胎儿期毛囊发生发育相关基因的筛选与鉴定[D]. 王乐乐.内蒙古农业大学 2016
[2]LPS刺激的奶牛乳腺上皮细胞转录组和miRNA表达谱变化规律的研究[D]. 陈玲.西北农林科技大学 2016
[3]PI3K p110delta催化亚基在小鼠卵巢卵泡生长中的功能研究[D]. 李倩.南京医科大学 2013
[4]抑制素对小鼠卵泡发育和精子发生的分子和细胞调控机制研究[D]. 蔡开来.华中农业大学 2011
[5]抑制素和bcl-2基因免疫对小鼠繁殖和生长的影响[D]. 姜勋平.南京农业大学 2001
硕士论文
[1]鸡卵巢发育相关miRNA与基因的鉴定及特征分析[D]. 贾美婷.山东农业大学 2015
[2]基于高通量测序的济宁青山羊和莱芜黑山羊卵巢转录组研究[D]. 朱晓攀.中国农业科学院 2013
[3]抑制素α和βA亚基基因对巴美肉羊繁殖力影响的研究[D]. 索峰.内蒙古农业大学 2012
[4]抑制素被动免疫对羊生殖激素及卵泡颗粒细胞凋亡的影响[D]. 陈守云.四川农业大学 2008
本文编号：3319286
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：112 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
哺乳动物卵泡发育过程
图 1.2 SIRT1 催化的酶促反应[66]Fig.1.2 The enzymatic reaction catalyzed by SIRT1[66]酸化导致 NAD+依赖性脱乙酰酶活性降低，SIRT1 在体与clinB）和细胞周期蛋白依赖性激酶 1（Cdk1）形成复合物酸（Thr）530 和丝氨酸（Ser）540 为其底物可以被磷酸化速细胞周期进程，进而促进细胞增殖[82]。在氧化应激条1）磷酸化 SIRT1，人类 SIRT1 在三个位点上被 JNK1 磷酸530，磷酸化后增加了 SIRT1 对其底物之一组蛋白 H3 的脱3 没有影响[83]。双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶(DYRK)过磷酸化 SIRT1 Thr522 促进细胞存活[84]。白藜芦醇一直剂，但白藜芦醇还作用于许多其他酶，具有很强的抗氧化的还是间接的仍然存在争议[86,87]。sirtinol 可直接与 Sirt1烟酰胺是另一种常用的 sirtuin 抑制剂，是 NAD+的天然前产物[88,89]。
磷脂酰肌醇（3，4，5）-三磷酸（PIP3）域与 PIP3 结合，就会发生构象变化，将，导致 T308 磷酸化和 Akt 活性增加 100T 活性的翻译后修饰是可逆乙酰化。在基，肝脏，脑和骨骼肌中被乙酰化，并且酸被鉴定为 K14 和 K20，两者都位于 A氨酸进行去乙酰化对于AKT与PIP3的结.3）。PDK1 的 PH 结构域被乙酰化也会脱乙酰化形式显示出相反的结果，表明乙蛋白活性的常见机制。胰岛素受体底物S2 是 IGF-1R 信号的受体相关下游效应 SIRT1 依赖性脱乙酰化提高其活性，由此化也是肝细胞中胰岛素受体（IR）激酶 SIRT1 在多个水平上调胰岛素信号传导
【参考文献】：
期刊论文
[1]抑制素对绵羊颗粒细胞雌激素和孕酮分泌及相关基因表达的影响[J]. 李婷,马爱团,刘月琴,高昆,张继伟,张英杰. 畜牧兽医学报. 2017(09)
[2]转录组测序技术研究进展[J]. 洪奇阳,毕行建,王大宁,李子真,俞海,夏宁邵,李少伟. 中国生化药物杂志. 2017(06)
[3]绵羊小卵泡与中卵泡转录组差异特征分析[J]. 吴阳升,林嘉鹏,汪立芹,陈莹,黄俊成. 江苏农业学报. 2016(04)
[4]Sirt1-线粒体途径介导的缺血再灌注损伤保护作用机制[J]. 胡明珠,周波,季永. 南通大学学报(医学版). 2016(03)
[5]基于RNA-Seq识别山羊肉品质候选基因[J]. 孟宪然,杜琛,王静,付绍印,郑竹清,张文广,李金泉. 畜牧兽医学报. 2015(08)
[6]人卵巢颗粒细胞FoxO基因和卵泡刺激素受体基因的表达及相关性研究[J]. 梁莹,米梅艳,李淑贤,周莉,吴晓茜,雷灵梅. 河北医科大学学报. 2014(10)
[7]基于RNA-Seq高通量测序技术的牦牛卵巢转录组研究:进一步完善牦牛基因结构及挖掘与繁殖相关新基因[J]. 兰道亮,熊显荣,位艳丽,徐通,钟金城,字向东,王永,李键. 中国科学:生命科学. 2014(03)
[8]Role of sirtuins in ischemia-reperfusion injury[J]. Eirini Pantazi,Mohamed Amine Zaouali,Mohamed Bejaoui,Emma Folch-Puy,Hassen Ben Abdennebi,Joan Roselló-Catafau. World Journal of Gastroenterology. 2013(43)
[9]猪卵巢颗粒细胞中SIRT1基因表达量与雌激素分泌的相关性[J]. 李碧侠,赵芳,付言峰,王学敏,方晓敏,涂枫,任守文,王金玉. 江苏农业学报. 2013(03)
[10]巴美肉羊INHA和INHBA基因多态性与产羔数关系研究[J]. 索峰,刘永斌,特日格勒,祁云霞,何小龙,韩有胜,张莉,李虎山,荣威恒. 华北农学报. 2012(03)
博士论文
[1]内蒙古绒山羊胎儿期毛囊发生发育相关基因的筛选与鉴定[D]. 王乐乐.内蒙古农业大学 2016
[2]LPS刺激的奶牛乳腺上皮细胞转录组和miRNA表达谱变化规律的研究[D]. 陈玲.西北农林科技大学 2016
[3]PI3K p110delta催化亚基在小鼠卵巢卵泡生长中的功能研究[D]. 李倩.南京医科大学 2013
[4]抑制素对小鼠卵泡发育和精子发生的分子和细胞调控机制研究[D]. 蔡开来.华中农业大学 2011
[5]抑制素和bcl-2基因免疫对小鼠繁殖和生长的影响[D]. 姜勋平.南京农业大学 2001
硕士论文
[1]鸡卵巢发育相关miRNA与基因的鉴定及特征分析[D]. 贾美婷.山东农业大学 2015
[2]基于高通量测序的济宁青山羊和莱芜黑山羊卵巢转录组研究[D]. 朱晓攀.中国农业科学院 2013
[3]抑制素α和βA亚基基因对巴美肉羊繁殖力影响的研究[D]. 索峰.内蒙古农业大学 2012
[4]抑制素被动免疫对羊生殖激素及卵泡颗粒细胞凋亡的影响[D]. 陈守云.四川农业大学 2008
本文编号：3319286
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