猪抑胃肽/葡萄糖依赖性促胰岛素释放肽(GIP)基因的克隆与组织表达分析
发布时间:2021-08-05 17:34
本研究采用RT-PCR方法,克隆长白猪(Landrace)GIP基因全长cDNA序列,并对其在家猪组织中的表达情况进行分析.结果显示:长白猪GIP(pGIP)cDNA全长435bp,编码144个氨基酸GIP的前体蛋白;该前体蛋白含有信号肽序列,经蛋白酶水解后产生GIP成熟肽.与人、小鼠GIP表达图谱类似,GIP mRNA也在长白猪小肠及肾脏中有较高水平表达.
【文章来源】:四川大学学报(自然科学版). 2017,54(01)北大核心CSCD
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
图1猪pGIP基因cDNA扩增Fig.1AmplificationofpGIPcDNA
72.22%、69.44%.猪GIP成熟肽与人、小鼠、大鼠以及牛的GIP成熟肽的氨基酸序列一致性分别为95.24%、97.62%、95.24%、97.62%.图2猪GIP基因结构方框及数字代表外显子区及其编号;横线表示内含子区.Fig.2Exon-intronorganizationofpigGIPgeneTheboxrepresentsexonandisnumberedaccordingly;dashlinesrepresentsintrons.图3猪GIP前体蛋白序列比对分析信号肽序列用双向箭头标示.阴影示GIP成熟肽序列.pGIP代表本文克隆到的猪GIP前体蛋白肽链序列;hGIP代表人(Homosapiens)的GIP前体蛋白;mGIP代表小鼠(Musmusculus)的GIP前体蛋白;rGIP代表大鼠(Rattusnorvegicus)的GIP前体蛋白;bGIP代表牛(Bostaurus)的GIP前体蛋白.箭头标记出内含子插入位点.Fig.3AminoacidsequencealignmentoftheGIPprecursorproteinsfromdifferentspeciesThesignalpeptideisannotatedbyanarrow;ThematureGIPpeptideisshaded;pGIP,pigGIPprecursorpro-tein.hGIP,humanGIPprecursorprotein;mGIP,mouseGIPprecursorprotein;rGIP
12号染色体上,pGIP基因包含6个外显子和5个内含子,编码区cDNA序列长435bp,分布于5个外显子上,编码含有144个氨基酸残基的GIP前体蛋白.pGIP与人hGIP(NM_004123.2)、小鼠mGIP(NM_008119.2)、大鼠rGIP(NM_019630.3)、牛bGIP(NM_001166605.1)的序列一致性分别为82.77%、76.23%、75.66%、89.10%.图1猪pGIP基因cDNA扩增Fig.1AmplificationofpGIPcDNAfromsmallintestinepGIP基因由6个外显子构成,因此,本文将其依序命名为exon1(E1)、exon2(E2)、exon3(E3)、exon4(E4)、exon5(E5)、exon6(E6).经比对发现,E1为GIP基因5′端非编码区;翻译起始位点位于E2上,E2主要负责编码信号肽序列及部分N端肽;E3主要编码GIP成熟肽序列;翻译终止密码子位于E6上(图2).3.2pGIP基因序列分析家猪pGIP基因可编码一个含有144个氨基酸残基的前体蛋白.猪GIP前体蛋白和其他哺乳动物的GIP前体蛋白一级结构氨基酸序列中均含有信号肽序列(图3);它与人hGIP前体蛋白(NP_163
【参考文献】:
期刊论文
[1]猪Smad7和Smad9基因克隆、序列分析与组织表达图谱探究[J]. 陈巧容,李娟,王亚军. 四川大学学报(自然科学版). 2015(01)
[2]猪Akt1、Akt2基因克隆与组织表达图谱分析[J]. 钟宇,王亚军,李娟. 四川大学学报(自然科学版). 2014(02)
本文编号:3324173
【文章来源】:四川大学学报(自然科学版). 2017,54(01)北大核心CSCD
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
图1猪pGIP基因cDNA扩增Fig.1AmplificationofpGIPcDNA
72.22%、69.44%.猪GIP成熟肽与人、小鼠、大鼠以及牛的GIP成熟肽的氨基酸序列一致性分别为95.24%、97.62%、95.24%、97.62%.图2猪GIP基因结构方框及数字代表外显子区及其编号;横线表示内含子区.Fig.2Exon-intronorganizationofpigGIPgeneTheboxrepresentsexonandisnumberedaccordingly;dashlinesrepresentsintrons.图3猪GIP前体蛋白序列比对分析信号肽序列用双向箭头标示.阴影示GIP成熟肽序列.pGIP代表本文克隆到的猪GIP前体蛋白肽链序列;hGIP代表人(Homosapiens)的GIP前体蛋白;mGIP代表小鼠(Musmusculus)的GIP前体蛋白;rGIP代表大鼠(Rattusnorvegicus)的GIP前体蛋白;bGIP代表牛(Bostaurus)的GIP前体蛋白.箭头标记出内含子插入位点.Fig.3AminoacidsequencealignmentoftheGIPprecursorproteinsfromdifferentspeciesThesignalpeptideisannotatedbyanarrow;ThematureGIPpeptideisshaded;pGIP,pigGIPprecursorpro-tein.hGIP,humanGIPprecursorprotein;mGIP,mouseGIPprecursorprotein;rGIP
12号染色体上,pGIP基因包含6个外显子和5个内含子,编码区cDNA序列长435bp,分布于5个外显子上,编码含有144个氨基酸残基的GIP前体蛋白.pGIP与人hGIP(NM_004123.2)、小鼠mGIP(NM_008119.2)、大鼠rGIP(NM_019630.3)、牛bGIP(NM_001166605.1)的序列一致性分别为82.77%、76.23%、75.66%、89.10%.图1猪pGIP基因cDNA扩增Fig.1AmplificationofpGIPcDNAfromsmallintestinepGIP基因由6个外显子构成,因此,本文将其依序命名为exon1(E1)、exon2(E2)、exon3(E3)、exon4(E4)、exon5(E5)、exon6(E6).经比对发现,E1为GIP基因5′端非编码区;翻译起始位点位于E2上,E2主要负责编码信号肽序列及部分N端肽;E3主要编码GIP成熟肽序列;翻译终止密码子位于E6上(图2).3.2pGIP基因序列分析家猪pGIP基因可编码一个含有144个氨基酸残基的前体蛋白.猪GIP前体蛋白和其他哺乳动物的GIP前体蛋白一级结构氨基酸序列中均含有信号肽序列(图3);它与人hGIP前体蛋白(NP_163
【参考文献】:
期刊论文
[1]猪Smad7和Smad9基因克隆、序列分析与组织表达图谱探究[J]. 陈巧容,李娟,王亚军. 四川大学学报(自然科学版). 2015(01)
[2]猪Akt1、Akt2基因克隆与组织表达图谱分析[J]. 钟宇,王亚军,李娟. 四川大学学报(自然科学版). 2014(02)
本文编号:3324173
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3324173.html