鸭痘的诊断和一株鸭痘病毒部分基因的序列分析

发布时间：2021-08-06 08:59

　　为了了解广西地区鸭痘病毒的流行情况,试验采用实时荧光定量PCR、基因克隆和序列分析的方法,对采自广西河池市宜州某养鸭场患病鸭的痘斑组织进行病原学检测。结果表明:从痘斑组织中检测出的病毒为鸭痘病毒,将其命名为Hechi株。用自行设计的引物P1/P2扩增出大小约为577 bp的Popr基因片段,与预期大小一致。经MEGA 6.0软件分析,Hechi株属于基因5.1亚群;与国内鸡痘疫苗株（282E4）、广西大新株（daxin）、鹅源毒株（YNE）、鸭源毒株（YNY）的氨基酸位点比较有11个氨基酸位点发生改变,与国外参考株相比有5个氨基酸位点改变较大;与YNE、YNY、282E4、daxin株的核苷酸序列同源性分别为87.4%、87.6%、87.6%和99.8%,氨基酸序列同源性分别为91.9%、92.4%、92.4%和100%。说明目前广西地区流行的鸭痘病毒很可能来源于YNY、282E4这2株毒株。 

【文章来源】：黑龙江畜牧兽医. 2020,(15)北大核心

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【部分图文】：

实时荧光定量PCR检测结果

应用PCR方法对鸭痘阳性样品进行Popr基因片段扩增,琼脂糖凝胶电泳检测结果见图2,获得的目的片段大小为577 bp,与预期大小相符,且阴性对照和阳性对照成立。2.3 序列分析

鸭痘病毒Hechi株与YNY、YNE、282E4株核苷酸序列同源性分别为87.4%、87.6%和87.6%,与daxin株核苷酸序列同源性为99.8%。鸭痘病毒Hechi株与YNY、YNE、282E4株氨基酸序列同源性分别为91.9%、92.4%和92.4%,与daxin株氨基酸序列同源性为100%。同源性比较结果见图4。图4 核苷酸和氨基酸序列同源性比较结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]鹅源禽痘病毒的鉴定和基因分析[J]. 张红云,郑敏,罗满林,曹慧慧,孙文超,韦显凯,闭璟珊.  病毒学报. 2017(06)
[2]鸭痘病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 曹慧慧,孙文超,郑敏,韦显凯,苏姣秀,梁晟,郑列丰,李军,刘棋.  中国畜牧兽医. 2015(10)



本文编号：3325479