宁夏荷斯坦青年母牛全基因组选择与BLUP选种效果分析
发布时间：2021-08-12 18:06
本研究以宁夏地区荷斯坦青年母牛为研究对象,利用全基因组选择的方法,对五批次2511头青年母牛进行育种值计算;选择参加全基因组测定的989头青年母牛的产奶的四个性状（305d产奶量,乳脂率,乳蛋白以及体细胞评分）数据,利用BLUP法对其进行了遗传评估,通过秩相关对全基因组和BLUP法的计算结果进行相关性分析,及两种方法遗传进展的对比。结果表明:宁夏地区荷斯坦青年母牛五批基因组选择奶牛GCPI均值从第一批的283.32上升到第五批910.46,呈逐批上升的趋势,其中,产奶量的基因组育种值均值最大的是第四批为576.54;乳脂率、乳蛋白、乳房、肢蹄和体型基因组育种值均值都为第五批为最大值;体细胞评分基因组育种值均值五批次呈现逐渐下降的趋势,第四、五批均值最小,为3.00。七个性状五批次的基因组育种值估计准确性的均值在0.44到0.75之间,其中最大的为第四批泌乳系统的估计准确性为0.75,最小的为第三批体细胞评分的估计准确性为0.44。最终选取989头奶牛多胎次产奶数据的四个性状运用DMU软件进行计算,得到育种值与估计准确性均低于基因组选择数据。根据育种值与其他遗传参数计算得到CPI2指数,...
【文章来源】：宁夏大学宁夏回族自治区 211工程院校
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１技术路线??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ??１２??
高通量测序法进行测序，标记ＳＮＰ的基因型，再进行统计分析，然后再根据测得的候选个体??芯片的标记信息，结合ＧＳ技术平台的每个标记的效应值，最终计算出候选个体的性状基因??组育种（ＧＥＢＶ），如图２－２所示。??｜?ＤＮＡ高通置测序｜??基因组肓种ｉｉ￣｜＜?＾统计分析卜（＇?｜??＾?．７?’??图２－２青年母牛基因组选择过程图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ｇｅｎｏｍｅ?ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｍａｐ?ｏｆ?ｈｅｉｆｅｒ??本研宂借助中国荷斯坦牛ＧＳ技术平台进行估计标记效应，该技术平台是中国农业大??学张沅教授和张勤教授课题组率先在提出，并在国内开展了基因组选择的理论和方法研宄，??掌握了关键技术，建立了高密度ＳＮＰ效应估计和基因组育种计算分析平台，同时由本课题??组提出育种值估计的ＴＡＢＬＵＰ方法，并组建了中国荷斯坦牛参考群体。通过该参考群体可??１５??
性状的基因组育种值和估计准确性，根据各性状的基因组育种值计算得到ＧＣＰＩ指数。??分别对五批次基因组选择的青年母牛ＧＣＰＩ指数和各性状的基因组育种值结果进行对??比，通过表３－７和图３－１可以看出，ＧＣＰＩ值逐渐升高，最高的是第五批为９１０．４６；产奶量??基因组育种值均值最高的是第四批为５７６．５４；乳脂率基因组育种值均值在第四、第五批次??提升为正数，最高值为第五批的０．０９；乳蛋白率、乳房和肢蹄评分的基因组育种值均值最高??２８??
【参考文献】：
期刊论文
[1]2017年奶牛产业技术发展报告[J]. 李胜利,姚琨,曹志军,刘长全,张胜利,刘建新,李建喜,王加启,张和平. 中国畜牧杂志. 2018(03)
[2]宁夏地区青年荷斯坦母牛基因组育种值分析[J]. 田佳,李委奇,刘丽元,邵怀峰,脱征军,张伟新,王琨,温万. 中国奶牛. 2018(02)
[3]动物遗传育种学科百年发展历程与研究前沿[J]. 杨宁,姜力. 农学学报. 2018(01)
[4]关于宁夏规模奶牛养殖模式的探讨[J]. 丑天才,杨波. 中国畜牧兽医文摘. 2017(08)
[5]DMU、GBS和Herdsman 3个软件育种值估计的比较[J]. 张越,杨宇泽,张金鑫,张锁宇,邱小田,唐韶青,丁向东. 中国畜牧杂志. 2017(07)
[6]宁夏地区荷斯坦奶牛遗传参数估计[J]. 李欣,周靖航,温万,邵怀峰,脱征军,田佳,马金香,顾亚玲. 中国畜牧兽医. 2017(06)
[7]用随机回归模型估计宁夏地区荷斯坦牛头胎测定日产奶量遗传参数[J]. 任小丽,刘澳星,李想,张旭,王雅春,邵怀峰,秦春华,王瑜,温万,张胜利. 中国农业科学. 2017(10)
[8]家畜基因组选择研究进展[J]. 李宏伟,王瑞军,王志英,李学武,王振宇,张燕军,苏蕊,刘志红,李金泉. 遗传. 2017(05)
[9]2016年奶牛产业技术发展报告[J]. 李胜利,姚琨,曹志军,刘长全,张胜利,刘建新,李建喜,王加启,张和平. 中国畜牧杂志. 2017(01)
[10]加速优秀基因传递 开辟动物遗传育种新时代[J]. 方美英,刘剑锋,张勤,吴常信. 中国农村科技. 2016(06)
硕士论文
[1]应用随机回归测定日模型估计山东地区荷斯坦奶牛生产性状遗传参数[D]. 吕湾.河北工程大学 2019
[2]宁夏地区荷斯坦牛遗传评估及选择指数构建[D]. 李欣.宁夏大学 2017
[3]中国肉用西门塔尔牛育种目标的选择及优化育种规划的研究[D]. 薛景龙.吉林农业大学 2016
[4]武汉地区荷斯坦奶牛产奶和繁殖性状遗传分析[D]. 赵占龙.华中农业大学 2015
[5]基于加性显性模型的基因组选择应用于西门塔尔牛的初步研究[D]. 王延晖.中国农业科学院 2014
[6]全球增暖背景下中国四季的划分及与夏季降水的关系[D]. 张世轩.兰州大学 2013
[7]西门塔尔牛部分屠宰和肉质性状基因组选择初步研究[D]. 朱淼.中国农业科学院 2013
[8]缺失数据对内蒙古绒山羊估计育种值准确性的影响[D]. 梁永厚.内蒙古农业大学 2007
本文编号：3338810
【文章来源】：宁夏大学宁夏回族自治区 211工程院校
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１技术路线??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ??１２??
高通量测序法进行测序，标记ＳＮＰ的基因型，再进行统计分析，然后再根据测得的候选个体??芯片的标记信息，结合ＧＳ技术平台的每个标记的效应值，最终计算出候选个体的性状基因??组育种（ＧＥＢＶ），如图２－２所示。??｜?ＤＮＡ高通置测序｜??基因组肓种ｉｉ￣｜＜?＾统计分析卜（＇?｜??＾?．７?’??图２－２青年母牛基因组选择过程图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ｇｅｎｏｍｅ?ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｍａｐ?ｏｆ?ｈｅｉｆｅｒ??本研宂借助中国荷斯坦牛ＧＳ技术平台进行估计标记效应，该技术平台是中国农业大??学张沅教授和张勤教授课题组率先在提出，并在国内开展了基因组选择的理论和方法研宄，??掌握了关键技术，建立了高密度ＳＮＰ效应估计和基因组育种计算分析平台，同时由本课题??组提出育种值估计的ＴＡＢＬＵＰ方法，并组建了中国荷斯坦牛参考群体。通过该参考群体可??１５??
性状的基因组育种值和估计准确性，根据各性状的基因组育种值计算得到ＧＣＰＩ指数。??分别对五批次基因组选择的青年母牛ＧＣＰＩ指数和各性状的基因组育种值结果进行对??比，通过表３－７和图３－１可以看出，ＧＣＰＩ值逐渐升高，最高的是第五批为９１０．４６；产奶量??基因组育种值均值最高的是第四批为５７６．５４；乳脂率基因组育种值均值在第四、第五批次??提升为正数，最高值为第五批的０．０９；乳蛋白率、乳房和肢蹄评分的基因组育种值均值最高??２８??
【参考文献】：
期刊论文
[1]2017年奶牛产业技术发展报告[J]. 李胜利,姚琨,曹志军,刘长全,张胜利,刘建新,李建喜,王加启,张和平. 中国畜牧杂志. 2018(03)
[2]宁夏地区青年荷斯坦母牛基因组育种值分析[J]. 田佳,李委奇,刘丽元,邵怀峰,脱征军,张伟新,王琨,温万. 中国奶牛. 2018(02)
[3]动物遗传育种学科百年发展历程与研究前沿[J]. 杨宁,姜力. 农学学报. 2018(01)
[4]关于宁夏规模奶牛养殖模式的探讨[J]. 丑天才,杨波. 中国畜牧兽医文摘. 2017(08)
[5]DMU、GBS和Herdsman 3个软件育种值估计的比较[J]. 张越,杨宇泽,张金鑫,张锁宇,邱小田,唐韶青,丁向东. 中国畜牧杂志. 2017(07)
[6]宁夏地区荷斯坦奶牛遗传参数估计[J]. 李欣,周靖航,温万,邵怀峰,脱征军,田佳,马金香,顾亚玲. 中国畜牧兽医. 2017(06)
[7]用随机回归模型估计宁夏地区荷斯坦牛头胎测定日产奶量遗传参数[J]. 任小丽,刘澳星,李想,张旭,王雅春,邵怀峰,秦春华,王瑜,温万,张胜利. 中国农业科学. 2017(10)
[8]家畜基因组选择研究进展[J]. 李宏伟,王瑞军,王志英,李学武,王振宇,张燕军,苏蕊,刘志红,李金泉. 遗传. 2017(05)
[9]2016年奶牛产业技术发展报告[J]. 李胜利,姚琨,曹志军,刘长全,张胜利,刘建新,李建喜,王加启,张和平. 中国畜牧杂志. 2017(01)
[10]加速优秀基因传递 开辟动物遗传育种新时代[J]. 方美英,刘剑锋,张勤,吴常信. 中国农村科技. 2016(06)
硕士论文
[1]应用随机回归测定日模型估计山东地区荷斯坦奶牛生产性状遗传参数[D]. 吕湾.河北工程大学 2019
[2]宁夏地区荷斯坦牛遗传评估及选择指数构建[D]. 李欣.宁夏大学 2017
[3]中国肉用西门塔尔牛育种目标的选择及优化育种规划的研究[D]. 薛景龙.吉林农业大学 2016
[4]武汉地区荷斯坦奶牛产奶和繁殖性状遗传分析[D]. 赵占龙.华中农业大学 2015
[5]基于加性显性模型的基因组选择应用于西门塔尔牛的初步研究[D]. 王延晖.中国农业科学院 2014
[6]全球增暖背景下中国四季的划分及与夏季降水的关系[D]. 张世轩.兰州大学 2013
[7]西门塔尔牛部分屠宰和肉质性状基因组选择初步研究[D]. 朱淼.中国农业科学院 2013
[8]缺失数据对内蒙古绒山羊估计育种值准确性的影响[D]. 梁永厚.内蒙古农业大学 2007
本文编号：3338810
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