山羊胎盘中DNA甲基化与YY1共同抑制PHLDA2基因表达
发布时间：2021-08-12 20:35
山羊是最早被人类驯化的家畜之一。在茫茫的历史长河中,山羊的养殖记录可追溯到中国的夏商时代。经过劳动人民几千年的精心选择和繁育,中国已经成为世界上山羊品种和资源最为丰富的国家之一。山羊肉不仅是一种健康的食材,同时也是一种中药材。它不仅营养丰富,滋补功效出色,同时还能预防和缓解多种常见疾病。2019年,全国的猪牛羊禽肉产量相比上年减少了10.2%,但山羊肉的产量却增长了2.6%,这些数据表明山羊肉受到越来越多中国人的青睐,人们对于山羊肉的需求量也越来越大。但由于山羊繁殖率偏低导致其规模化养殖受限。因此,增强山羊繁殖率是目前畜牧业的重要课题之一。研究发现,胎盘是母体与胚胎之间氧气运输与营养供给的重要媒介,对于胎儿的生长发育至关重要,并且能够直接影响到出生后胎儿的存活率,是影响动物繁殖性能的重要因素之一。PHLDA2（pleckstrin homology-like domain,family A,member 2,又称为IPL或TSSC3）,是一个仅在胚胎或成体胚胎外母系等位基因表达的父源印迹基因,具有调节细胞信号、胞内运输等功能。研究结果显示,在PHLDA2基因功能缺失的胚胎中,胎盘不仅会...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
山羊胎盘不同妊娠时期PHLDA2基因表达量
结果与分析4.2山羊PHLDA2基因启动子活性分析4.2.1山羊启动子上游分析为了分析山羊PHLDA2基因启动子5’区域对其的调控表达，通过软件MethylPrimerExpressv1.0预测到从-631到+379bp范围内存在着CpG岛(islandsize>100,GCPercent>50.0,Obs/Exp>0.6)，说明启动子区域甲基化与PHLDA2基因可能存在相关性，可对此进行分析。同时通过http://jaspar.genereg.net/在线分析，发现在PHLDA2基因在启动子上游+20到-1842bp范围没有预测到CAAT和TATA框，但检测到nuclearfactorI-C(NIFC),thetranscriptionfactorETSproto-oncogene1(ETS1),arylhydrocarbonreceptor(AHR)andYing-yang1(YY1)等多个转录因子结合位点。（图4-3）预测到转录因子结合位点用红色斜体表示Potentialtranscriptionfactorbindingsitesareindicatedinreditalicletters.图4-3山羊PHLDA2启动子区域CpG岛以及转录因子结合位点预测Fig4-3PredicationofCpGisland(a)andtranscriptionfactorbindingsites(b)in5’flankingregionofgoatPHLDA2gene.32
结果与分析420bp到-1023bp启动子活性显著增加；使用在线软件jaspar分析发现，在这个区域预测到可能存在的转录因子结合位点，分别是两个YY1(分别命名为YY1-a和YY1-b),两个ETS1(分别命名为ETS1-a和ETS1-b)还有NFIC和AHR。(图4-5)图4-5PHLDA2基因5’缺失载体启动子双荧光素酶活性载体活性分析Fig4-5TherelativeluciferaseactivityofPHLDA2genepromotor5’deletionseriesreconstructions4.3山羊不同妊娠时期胎盘PHLDA2基因启动子甲基分析4.3.1PHLDA2基因启动子亚硫酸氢测序为了研究不同妊娠时期胎盘启动子区域CpG岛甲基化变化，使用软件MethylPrimerExpressv1.0设计亚硫酸氢盐测序引物，扩增区域位于-574到-225bp，共包括22个CpG位点，共349bp。使用在线QUMA(http://quma.cdb.riken.jp/)软件分析，得到不同山羊妊娠时期胎盘DNA甲基化状态如图4-6，统计得到不同妊娠时期山羊胎盘PHLDA2基因启动子区域CpG岛，不同妊娠时期甲基化如图4-7：30天(39.3%)、45天(19.6%)、60天(18.1%%)、90天(14.7%)。在妊娠45天时，山羊胎盘组织PHLDA2启动子区域CpG岛甲基化突然降低，而后随着妊娠时间增加缓慢下降。34
【参考文献】：
期刊论文
[1]组蛋白去乙酰化酶与肝细胞癌的研究进展[J]. 朱博兰,张裕,杨晓娟,吕宁芳,任瑞强,于晓辉. 华南国防医学杂志. 2019(12)
[2]启动子结构、功能预测和验证方法的研究进展[J]. 曾晓玲,赵昶灵,文国松,丁灿,张洪玲,徐率,古朝山. 分子植物育种. 2018(12)
[3]DNA甲基化检测中亚硫酸氢盐修饰方法的改进与评价[J]. 叶松山,刘先娟,侯俊然,毛秉豫,邱耕. 中国实验血液学杂志. 2016(02)
[4]印记基因:发育中的重要调节因子[J]. 吴瑜,冯旭,高岚,焦保卫. 遗传. 2016(06)
[5]大足黑山羊PHLDA2基因的克隆、组织表达与印记状况分析[J]. 苏鲁方,彭学强,蒋曹德. 中国农业科学. 2015(02)
[6]我国肉羊业现状及发展对策[J]. 张莉,杜立新,李捷. 草食家畜. 2014(03)
[7]染色质免疫共沉淀技术的应用和研究进展[J]. 李玲,杨鹏跃,朱本忠,傅达奇,田慧琴,罗云波. 中国食品学报. 2012(06)
[8]大足黑山羊种质特性[J]. 赵中权,张家骅,李周权,王贤海,陈长庚,徐恢仲. 中国畜牧杂志. 2008(15)
[9]染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用[J]. 王春雨,石建党,朱彦,张琚. 遗传. 2005(05)
[10]表观遗传学的相关概念和研究进展[J]. 董玉玮,侯进慧,朱必才,李培青,庞永红. 生物学杂志. 2005(01)
硕士论文
[1]大足黑山羊PHLDA2基因克隆、定位、组织表达、印记状况和甲基化分析[D]. 苏鲁方.西南大学 2014
本文编号：3339030
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
山羊胎盘不同妊娠时期PHLDA2基因表达量
结果与分析4.2山羊PHLDA2基因启动子活性分析4.2.1山羊启动子上游分析为了分析山羊PHLDA2基因启动子5’区域对其的调控表达，通过软件MethylPrimerExpressv1.0预测到从-631到+379bp范围内存在着CpG岛(islandsize>100,GCPercent>50.0,Obs/Exp>0.6)，说明启动子区域甲基化与PHLDA2基因可能存在相关性，可对此进行分析。同时通过http://jaspar.genereg.net/在线分析，发现在PHLDA2基因在启动子上游+20到-1842bp范围没有预测到CAAT和TATA框，但检测到nuclearfactorI-C(NIFC),thetranscriptionfactorETSproto-oncogene1(ETS1),arylhydrocarbonreceptor(AHR)andYing-yang1(YY1)等多个转录因子结合位点。（图4-3）预测到转录因子结合位点用红色斜体表示Potentialtranscriptionfactorbindingsitesareindicatedinreditalicletters.图4-3山羊PHLDA2启动子区域CpG岛以及转录因子结合位点预测Fig4-3PredicationofCpGisland(a)andtranscriptionfactorbindingsites(b)in5’flankingregionofgoatPHLDA2gene.32
结果与分析420bp到-1023bp启动子活性显著增加；使用在线软件jaspar分析发现，在这个区域预测到可能存在的转录因子结合位点，分别是两个YY1(分别命名为YY1-a和YY1-b),两个ETS1(分别命名为ETS1-a和ETS1-b)还有NFIC和AHR。(图4-5)图4-5PHLDA2基因5’缺失载体启动子双荧光素酶活性载体活性分析Fig4-5TherelativeluciferaseactivityofPHLDA2genepromotor5’deletionseriesreconstructions4.3山羊不同妊娠时期胎盘PHLDA2基因启动子甲基分析4.3.1PHLDA2基因启动子亚硫酸氢测序为了研究不同妊娠时期胎盘启动子区域CpG岛甲基化变化，使用软件MethylPrimerExpressv1.0设计亚硫酸氢盐测序引物，扩增区域位于-574到-225bp，共包括22个CpG位点，共349bp。使用在线QUMA(http://quma.cdb.riken.jp/)软件分析，得到不同山羊妊娠时期胎盘DNA甲基化状态如图4-6，统计得到不同妊娠时期山羊胎盘PHLDA2基因启动子区域CpG岛，不同妊娠时期甲基化如图4-7：30天(39.3%)、45天(19.6%)、60天(18.1%%)、90天(14.7%)。在妊娠45天时，山羊胎盘组织PHLDA2启动子区域CpG岛甲基化突然降低，而后随着妊娠时间增加缓慢下降。34
【参考文献】：
期刊论文
[1]组蛋白去乙酰化酶与肝细胞癌的研究进展[J]. 朱博兰,张裕,杨晓娟,吕宁芳,任瑞强,于晓辉. 华南国防医学杂志. 2019(12)
[2]启动子结构、功能预测和验证方法的研究进展[J]. 曾晓玲,赵昶灵,文国松,丁灿,张洪玲,徐率,古朝山. 分子植物育种. 2018(12)
[3]DNA甲基化检测中亚硫酸氢盐修饰方法的改进与评价[J]. 叶松山,刘先娟,侯俊然,毛秉豫,邱耕. 中国实验血液学杂志. 2016(02)
[4]印记基因:发育中的重要调节因子[J]. 吴瑜,冯旭,高岚,焦保卫. 遗传. 2016(06)
[5]大足黑山羊PHLDA2基因的克隆、组织表达与印记状况分析[J]. 苏鲁方,彭学强,蒋曹德. 中国农业科学. 2015(02)
[6]我国肉羊业现状及发展对策[J]. 张莉,杜立新,李捷. 草食家畜. 2014(03)
[7]染色质免疫共沉淀技术的应用和研究进展[J]. 李玲,杨鹏跃,朱本忠,傅达奇,田慧琴,罗云波. 中国食品学报. 2012(06)
[8]大足黑山羊种质特性[J]. 赵中权,张家骅,李周权,王贤海,陈长庚,徐恢仲. 中国畜牧杂志. 2008(15)
[9]染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用[J]. 王春雨,石建党,朱彦,张琚. 遗传. 2005(05)
[10]表观遗传学的相关概念和研究进展[J]. 董玉玮,侯进慧,朱必才,李培青,庞永红. 生物学杂志. 2005(01)
硕士论文
[1]大足黑山羊PHLDA2基因克隆、定位、组织表达、印记状况和甲基化分析[D]. 苏鲁方.西南大学 2014
本文编号：3339030
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