鸭肠炎病毒感染对鸭十二指肠转录组的影响

发布时间：2021-08-16 13:14

　　为探究鸭肠炎病毒（Duck enteritis virus,DEV）感染对鸭十二指肠黏膜组织不同时间段相关免疫基因的变化影响,采用DEV接种30日龄的健康樱桃谷鸭,在感染后72 h、96 h和120 h采集十二指肠,使用BGISEQ-500平台对3个试验组和对照组十二指肠组织测序,并筛选差异表达基因,用GO和KEGG数据库进行分析。结果显示,T72、T96和T120分别筛选出798、1 389和1 329差异表达基因;GO功能注释显示,差异基因主要参与到细胞因子活性、受体结合、细胞外基质、免疫系统过程、防御反应、钙离子结合、受体调节活性、受体配体活性、钠∶氨基酸转运体活性等;KEGG通路富集结果显示,差异表达基因主要涉及在细胞因子-细胞因子受体相互作用、NOD样受体信号通路、RIG-I样受体信号通路,抗原加工和呈递、Toll样受体信号通路、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、细胞溶质DNA传感途径、RIG-I样受体信号通路蛋白质消化吸收、细胞黏附分子（CAMs）、细胞色素P450对异生素的代谢、类固醇激素生物合成、PPAR信号通路Toll样受体信号通路、补体和凝血级联、IL... 

【文章来源】：动物医学进展. 2020,41(10)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

差异基因GO富集柱状图

差异基因KEGG Pathway富集柱状图

图2 差异基因KEGG Pathway富集柱状图T72、T96和T120筛选分别筛选出798、1 389和1 329个差异基因,将差异基因对比到GO和KEGG数据库,发现与病毒的复制和扩散及机体抵制病毒感染相关。表明在感染72 h和96 h,参与抵制DEV差异基因逐渐增多,这可能是因为病毒在机体内快速增殖,肠道基因调控更多基因抵制DEV,宿主与DEV的平衡还没有打破,机体还处于对峙时期。在感染120 h,DEV在体内大量复制扩散打破了两者之间的平衡,产生病理损伤和免疫抑制。

【参考文献】：
期刊论文
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[5]七星瓢虫滞育关联基因的转录组学分析[J]. 齐晓阳,任小云,安涛,陈红印,黄建,张礼生.  环境昆虫学报. 2016(02)
[6]新一代测序技术在植物转录组研究中的应用[J]. 梁烨,陈双燕,刘公社.  遗传. 2011(12)

博士论文
[1]高通量RNA-seq测序数据的基因表达水平分析研究[D]. 张礼.南京航空航天大学 2016
[2]鞘脂与PPAR相互作用及其对癌细胞凋亡调控的影响[D]. 王静.中国农业大学 2004

硕士论文
[1]基于RNA-Seq的DHAV-1感染雏鸭的组织转录组分析[D]. 张清瑞.华中农业大学 2013



本文编号：3345737