山羊产羔性状候选基因的筛选及其多基因聚合效应的研究
发布时间：2021-08-30 11:00
产羔率低是制约优质高效养羊业发展的主要瓶颈,而从遗传本质上研究提高产羔率的育种方法是国内外养羊科技工作者努力寻求破解的技术难题。以分子标记为核心的多基因聚合育种技术能直接在DNA水平上对产羔性状的基因型进行选择,克服了常规育种耗时长,效果差的缺点,可快速提高育种效率。可见,寻找与产羔性状紧密连锁分子标记,研究目标基因的调控功能及表达水平,筛选调控产羔性状的功能基因,是实现现代分子育种技术与常规育种技术有机结合,集成创新多基因聚合育种技术体系的基础和前提。本研究以对动物繁殖性状有重要调控作用的KITLG、KIT、KISS1和NGF基因为研究对象,采用PCR-RFLP和DNA测序技术研究这4个基因在布尔山羊、西农萨能和关中奶山羊中的SNPs及其与产羔数的关联性；用实时定量PCR技术检测这4个基因在山羊10组织中的相对表达量；克隆山羊KITLG、KIT和NGF基因的CDS区,并进行生物信息学分析；用数量遗传学分析方法研究了KITLG、KIT和KISS1基因聚合效应对产羔数的影响,为集成创新山羊产羔性状的多基因聚合育种技术体系提供试验依据和理论依据。主要研究结果如下：1、KITLG基因的克隆、...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
目录
文献综述
第一章 生物技术的发展概况及在动物繁育中的应用
1.1 分子标记辅助选择在家畜育种中的应用
1.1.1 限制性酶切片段长度多态性(RFLP)
1.1.2 随机扩增多态性DNA
1.1.3 微卫星标记
1.1.4 单核苷酸多态性
1.1.5 多基因聚合育种技术
1.1.6 全基因组选择
1.2 生物信息学
第二章 影响山羊繁殖性状的重要功能基因的研究进展
2.1 GnRH和GnRHR基因的研究进展
2.2 FSH和FSHR基因的研究进展
2.3 KITLG和KIT基因的研究进展
2.4 KISS1和GPR54在动物生殖中的作用
2.5 NGF基因在动物生殖中的作用
2.6 本研究的目的意义
试验研究
第三章 KITLG基因的克隆、表达及其SNPs与产羔数的关联分析
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 试验动物
3.2.2 主要试剂
3.2.3 溶液的配置
3.2.4 仪器设备
3.2.5 基因组DNA的提取及检测
3.2.6 RNA的提取及检测
3.2.7 DNA的凝胶回收
3.2.8 DNA克隆
3.2.9 cDNA模板的制备
3.2.10 实时定量PCR
3.2.11 引物设计、PCR和酶切反应
3.2.12 酶切产物检测
3.2.13 核酸和蛋白序列分析
3.2.14 数据统计与分析
3.3 结果与分析
3.3.1 山羊基因组DNA的检测
3.3.2 山羊组织总RNA的检测
3.3.3 山羊KITLG基因的克隆及生物信息学分析
3.3.4 KITLG基因的实时定量PCR结果
3.3.5 KITLG基因的PCR扩增结果
3.3.6 山羊KITLG基因的SNPs检测
3.3.7 KITLG基因不同基因型的测序图
3.3.8 KITLG基因SNP位点的遗传结构
3.3.9 KITLG基因与山羊产羔数的相关分析
3.3.10 3'UTR突变对microRNA结合位点的影响
3.4 讨论
3.4.1 Real-time PCR
3.4.2 KITLG基因的组织表达
3.4.3 KITLG基因突变对繁殖性能的影响
3.5 小结
第四章 KIT基因的克隆、表达及其SNPs与产羔数的关联分析
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 引物设计、PCR和酶切反应
4.3 结果与分析
4.3.1 山羊KIT基因的克隆及生物信息学分析
4.3.2 KIT基因的实时定量PCR结果
4.3.3 KIT基因的PCR扩增结果
4.3.4 山羊KIT基因的SNPs检测
4.3.5 KIT基因不同基因型的测序图
4.3.6 KIT基因SNP位点的遗传结构
4.3.7 KIT基因与山羊产羔数的相关分析
4.3.8 3'UTR突变对microRNA结合位点的影响
4.4 讨论
4.5 小结
第五章 KISS1基因的表达及其SNPs与产羔数的关联分析
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 引物设计
5.3 结果与分析
5.3.1 KISS1基因的实时定量PCR结果
5.3.2 KISS1基因的PCR扩增结果
5.3.3 山羊KISS1基因的SNPs检测
5.3.4 KISS1基因不同基因型的测序图
5.3.5 转录因子结合位点的预测结果
5.3.6 KISS1基因SNP位点的遗传结构
5.3.7 KISS1基因与山羊产羔数的相关分析
5.4 讨论
5.5 小结
第六章 NGF基因的克隆、表达及其SNP与产羔数的关联分析
6.1 引言
6.2 材料与方法
6.2.1 引物设计
6.2.2 实时定量PCR
6.3 结果与分析
6.3.1 山羊NGF基因的克隆及生物信息学分析
6.3.2 NGF基因的实时定量PCR结果
6.3.3 NGF基因的PCR扩增结果
6.3.4 山羊NGF基因的SNP检测
6.3.5 NGF基因不同基因型的测序图
6.3.6 NGF基因SNP位点的遗传结构
6.3.7 NGF基因与山羊产羔数的关联分析
6.4 讨论
6.5 小结
第七章 KITLG、KIT和KISS1基因聚合对山羊产羔数的效应分析
7.1 引言
7.2 材料与方法
7.3 结果与分析
7.4 讨论
7.5 小结
结论
创新点
进一步研究的问题
参考文献
附录
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]母猪初情期全基因组关联分析和位置候选基因研究[J]. 李平华,李杰,杨竹青,张志燕,杨斌,陈从英. 中国农业科学. 2012(19)
[2]生物信息学研究现状及发展趋势[J]. 赵屹,谷瑞升,杜生明. 医学信息学杂志. 2012(05)
[3]德保矮马与哈萨克马KIT基因多态性分析[J]. 毛春春,孙伟,刘东花,徐苹,雷初朝. 家畜生态学报. 2012(03)
[4]FSHR基因第1外显子多态性及其与小梅山猪产仔数的关系[J]. 吴井生,张跟喜,戴国俊,叶兰,王金玉. 畜牧兽医学报. 2012(04)
[5]GPR54基因多态性与小梅山猪产仔数的关联分析[J]. 吴井生,张跟喜,戴国俊,叶兰,王金玉. 中国畜牧杂志. 2012(03)
[6]KiSS-1/GPR54系统在不同发情周期母羊下丘脑中的表达规律[J]. 王军,孙蕾,吕文发,娄玉杰. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2011(12)
[7]新疆多浪羊FecB突变检测及与产羔数的关系[J]. 史洪才,高志英,牛志刚,白杰,冯利君,李红波,贾斌,张扬. 农业生物技术学报. 2011(02)
[8]神经生长因子NGF及其受体TrkA在雌性水牛生殖器官的表达定位[J]. 朱晓玲,李成娇,侯晓峰,石德顺,刘庆友,周虚. 吉林农业大学学报. 2011(03)
[9]山羊GnRHR基因部分序列多态性及其与产羔数的关联性分析[J]. 张育军,胡敏兰,张子军,丁建平,任春环,杨玉敏,阮崇美. 中国草食动物. 2010(04)
[10]中国荷斯坦牛CVM的基因检测及其与产奶性状的关联分析[J]. 初芹,张毅,孙东晓,俞英,王雅春,张沅. 遗传. 2010(07)
博士论文
[1]鸡肌苷酸相关候选基因遗传效应及表达规律研究[D]. 束婧婷.扬州大学 2008
硕士论文
[1]安徽省4个地方鸡保种群遗传多样性及3个产蛋性状基因聚合效应分析[D]. 金明.安徽农业大学 2012
[2]基于基因聚合策略选育高产仔数大白猪新品系的研究[D]. 刘远.华中农业大学 2010
[3]ESR、RYR1基因多态对猪产活仔数影响的研究及四个基因SNP位点的检测[D]. 刘俊.华中农业大学 2006
[4]性发育相关基因调控区的多态性研究[D]. 甘晓红.华中师范大学 2006
本文编号：3372654
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
目录
文献综述
第一章 生物技术的发展概况及在动物繁育中的应用
1.1 分子标记辅助选择在家畜育种中的应用
1.1.1 限制性酶切片段长度多态性(RFLP)
1.1.2 随机扩增多态性DNA
1.1.3 微卫星标记
1.1.4 单核苷酸多态性
1.1.5 多基因聚合育种技术
1.1.6 全基因组选择
1.2 生物信息学
第二章 影响山羊繁殖性状的重要功能基因的研究进展
2.1 GnRH和GnRHR基因的研究进展
2.2 FSH和FSHR基因的研究进展
2.3 KITLG和KIT基因的研究进展
2.4 KISS1和GPR54在动物生殖中的作用
2.5 NGF基因在动物生殖中的作用
2.6 本研究的目的意义
试验研究
第三章 KITLG基因的克隆、表达及其SNPs与产羔数的关联分析
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 试验动物
3.2.2 主要试剂
3.2.3 溶液的配置
3.2.4 仪器设备
3.2.5 基因组DNA的提取及检测
3.2.6 RNA的提取及检测
3.2.7 DNA的凝胶回收
3.2.8 DNA克隆
3.2.9 cDNA模板的制备
3.2.10 实时定量PCR
3.2.11 引物设计、PCR和酶切反应
3.2.12 酶切产物检测
3.2.13 核酸和蛋白序列分析
3.2.14 数据统计与分析
3.3 结果与分析
3.3.1 山羊基因组DNA的检测
3.3.2 山羊组织总RNA的检测
3.3.3 山羊KITLG基因的克隆及生物信息学分析
3.3.4 KITLG基因的实时定量PCR结果
3.3.5 KITLG基因的PCR扩增结果
3.3.6 山羊KITLG基因的SNPs检测
3.3.7 KITLG基因不同基因型的测序图
3.3.8 KITLG基因SNP位点的遗传结构
3.3.9 KITLG基因与山羊产羔数的相关分析
3.3.10 3'UTR突变对microRNA结合位点的影响
3.4 讨论
3.4.1 Real-time PCR
3.4.2 KITLG基因的组织表达
3.4.3 KITLG基因突变对繁殖性能的影响
3.5 小结
第四章 KIT基因的克隆、表达及其SNPs与产羔数的关联分析
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 引物设计、PCR和酶切反应
4.3 结果与分析
4.3.1 山羊KIT基因的克隆及生物信息学分析
4.3.2 KIT基因的实时定量PCR结果
4.3.3 KIT基因的PCR扩增结果
4.3.4 山羊KIT基因的SNPs检测
4.3.5 KIT基因不同基因型的测序图
4.3.6 KIT基因SNP位点的遗传结构
4.3.7 KIT基因与山羊产羔数的相关分析
4.3.8 3'UTR突变对microRNA结合位点的影响
4.4 讨论
4.5 小结
第五章 KISS1基因的表达及其SNPs与产羔数的关联分析
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 引物设计
5.3 结果与分析
5.3.1 KISS1基因的实时定量PCR结果
5.3.2 KISS1基因的PCR扩增结果
5.3.3 山羊KISS1基因的SNPs检测
5.3.4 KISS1基因不同基因型的测序图
5.3.5 转录因子结合位点的预测结果
5.3.6 KISS1基因SNP位点的遗传结构
5.3.7 KISS1基因与山羊产羔数的相关分析
5.4 讨论
5.5 小结
第六章 NGF基因的克隆、表达及其SNP与产羔数的关联分析
6.1 引言
6.2 材料与方法
6.2.1 引物设计
6.2.2 实时定量PCR
6.3 结果与分析
6.3.1 山羊NGF基因的克隆及生物信息学分析
6.3.2 NGF基因的实时定量PCR结果
6.3.3 NGF基因的PCR扩增结果
6.3.4 山羊NGF基因的SNP检测
6.3.5 NGF基因不同基因型的测序图
6.3.6 NGF基因SNP位点的遗传结构
6.3.7 NGF基因与山羊产羔数的关联分析
6.4 讨论
6.5 小结
第七章 KITLG、KIT和KISS1基因聚合对山羊产羔数的效应分析
7.1 引言
7.2 材料与方法
7.3 结果与分析
7.4 讨论
7.5 小结
结论
创新点
进一步研究的问题
参考文献
附录
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]母猪初情期全基因组关联分析和位置候选基因研究[J]. 李平华,李杰,杨竹青,张志燕,杨斌,陈从英. 中国农业科学. 2012(19)
[2]生物信息学研究现状及发展趋势[J]. 赵屹,谷瑞升,杜生明. 医学信息学杂志. 2012(05)
[3]德保矮马与哈萨克马KIT基因多态性分析[J]. 毛春春,孙伟,刘东花,徐苹,雷初朝. 家畜生态学报. 2012(03)
[4]FSHR基因第1外显子多态性及其与小梅山猪产仔数的关系[J]. 吴井生,张跟喜,戴国俊,叶兰,王金玉. 畜牧兽医学报. 2012(04)
[5]GPR54基因多态性与小梅山猪产仔数的关联分析[J]. 吴井生,张跟喜,戴国俊,叶兰,王金玉. 中国畜牧杂志. 2012(03)
[6]KiSS-1/GPR54系统在不同发情周期母羊下丘脑中的表达规律[J]. 王军,孙蕾,吕文发,娄玉杰. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2011(12)
[7]新疆多浪羊FecB突变检测及与产羔数的关系[J]. 史洪才,高志英,牛志刚,白杰,冯利君,李红波,贾斌,张扬. 农业生物技术学报. 2011(02)
[8]神经生长因子NGF及其受体TrkA在雌性水牛生殖器官的表达定位[J]. 朱晓玲,李成娇,侯晓峰,石德顺,刘庆友,周虚. 吉林农业大学学报. 2011(03)
[9]山羊GnRHR基因部分序列多态性及其与产羔数的关联性分析[J]. 张育军,胡敏兰,张子军,丁建平,任春环,杨玉敏,阮崇美. 中国草食动物. 2010(04)
[10]中国荷斯坦牛CVM的基因检测及其与产奶性状的关联分析[J]. 初芹,张毅,孙东晓,俞英,王雅春,张沅. 遗传. 2010(07)
博士论文
[1]鸡肌苷酸相关候选基因遗传效应及表达规律研究[D]. 束婧婷.扬州大学 2008
硕士论文
[1]安徽省4个地方鸡保种群遗传多样性及3个产蛋性状基因聚合效应分析[D]. 金明.安徽农业大学 2012
[2]基于基因聚合策略选育高产仔数大白猪新品系的研究[D]. 刘远.华中农业大学 2010
[3]ESR、RYR1基因多态对猪产活仔数影响的研究及四个基因SNP位点的检测[D]. 刘俊.华中农业大学 2006
[4]性发育相关基因调控区的多态性研究[D]. 甘晓红.华中师范大学 2006
本文编号：3372654
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3372654.html
