家兔POMC和UCP2基因对生长性状、屠体性状和部分肉质性状的遗传效应研究

发布时间：2021-08-31 16:28

　　家兔的体重和生长速度取决于采食和能量消耗之间的平衡,同时,出栏体重与生长速度对胴体质量和兔肉品质具有显著影响,因此,涉及采食和能量消耗两大生理生化过程的基因有可能与家兔生长性状、屠体性状和肉质性状相关联。减食欲神经肽阿黑皮素原基因（Pro-opiomelanocortin,POMC）和解偶联蛋白2基因（uncoupling protein 2,UCP2）分别涉及采食和能量消耗两大过程。本试验以伊拉兔、香槟兔、天府黑兔、新西兰兔和欧洲大白兔共计797个样本为材料（其中,伊拉兔、香槟兔和天府黑兔测定生长性状、屠体性状和肉质性状,新西兰兔和欧洲大白兔只测定生长性状）,以POMC和UCP2为候选基因,采用直接测序法寻找两个基因编码区的遗传变异,研究候选SNPs与家兔部分生产性状的关联性,并对UCP2基因mRNA相对表达量进行了分析,研究结果如下：1.在POMC基因外显子2上检测到一个同义突变c.498 T>G,在内含子1上检测到一个突变位点c.112-12 G>T。多态性分析表明,c.498 T>G在伊拉兔、香槟兔和天府黑兔三个品种中均只检测到GT和GG两种基因型,且表现为低... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
1. 文献综述
    1.1 概述
    1.2 应用候选基因法寻找分子遗传标记
        1.2.1 候选基因法
        1.2.2 候选基因的选择
    1.3 阿黑皮素原(Pro-opiomelanocortin,POMC)
        1.3.1 POMC调节食欲的作用机制
        1.3.2 POMC基因的定位、结构及蛋白质翻译加工过程
        1.3.3 POMC基因多态性研究进展
    1.4 解偶联蛋白(uncoupling proteins,UCPs)
        1.4.1 UCP2蛋白及其介导质子漏的机制
        1.4.2 UCP2基因的结构及分布
        1.4.3 UCP2基因多态性研究进展
    1.5 质谱(mass spectrometry,MS)技术在基因分型中的应用
    1.6 研究目的及试验方案
        1.6.1 研究目的
        1.6.2 试验方案
2. 试验材料和方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 样品采集
    2.2 主要仪器设备和试剂
        2.2.1 主要仪器设备
        2.2.2 主要试剂及试剂盒
        2.2.3 主要试剂的配制
    2.3 试验方法
        2.3.1 生产性能测定
        2.3.2 基因组DNA的提取及检测
        2.3.3 引物的设计与合成
        2.3.4 DNA水平上SNPs位点的检测
        2.3.5 对候选SNPs位点进行基因分型
        2.3.6 组织总RNA的提取
        2.3.7 cDNA的合成
        2.3.8 mRNA相对表达量研究
    2.4 数据分析
        2.4.1 主要分子生物学软件
        2.4.2 数据处理
3. 结果与分析
    3.1 基因组DNA与肝脏组织总RNA抽提结果
    3.2 POMC基因对家兔生产性状的遗传效应分析
        3.2.1 POMC基因变异位点的检测
        3.2.2 POMC基因变异位点的遗传多态性
        3.2.3 POMC基因多态性对家兔生产性状的遗传效应
    3.3 UCP2基因对家兔生产性状的遗传效应分析
        3.3.1 UCP2基因变异位点的检测结果
        3.3.2 候选SNP位点的分析筛选
A位点遗传多态性">        3.3.3 UCP2基因c.72 G>A位点遗传多态性
        3.3.4 UCP2基因多态性对生产性状的遗传效应
    3.4 UCP2基因mRNA相对表达量分析
        3.4.1 标准曲线的绘制
        3.4.2 UCP2基因在不同生长阶段的mRNA表达差异
        3.4.3 UCP2基因不同基因型的mRNA相对表达量分析
4. 讨论
    4.1 POMC和UCP2基因在家兔中的遗传多态性分析
        4.1.1 POMC基因遗传多态性分析
        4.1.2 UCP2基因遗传多态性分析
    4.2 POMC基因多态性对家兔生产性状的遗传效应分析
    4.3 UCP2基因多态性对家兔生产性状的遗传效应分析
    4.4 UCP2基因mRNA相对表达量分析
        4.4.1 不同生长阶段UCP2基因mRNA相对表达量分析
A位点对UCP2基因mRNA表达量的影响">        4.4.2 c.72 G>A位点对UCP2基因mRNA表达量的影响
5. 结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文


【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]动物肌肉生长调控因子基因和猪脂肪沉积调控基因的研究[D]. 刘丑生.甘肃农业大学 2003

硕士论文
[1]西门塔尔牛饲料转化效率分子遗传标记的研究[D]. 陈翠.中国农业科学院 2012
[2]猪解耦联蛋白基因（UCP2和UCP3）遗传变异研究[D]. 李艳华.中国农业大学 2005



本文编号：3375224