TYR、TYRP1基因与朝鲜鹌鹑羽色相关性研究

发布时间：2021-09-15 12:36

　　朝鲜鹌鹑广泛分布于中国，并且具有复杂的羽色多样性。羽色作为重要的遗传标记，在确定品种纯度和系统发育中起着至关重要的作用。而酪氨酸酶（TYR）和酪氨酸酶相关蛋白1（TYRP1）在鸟类羽色的形成过程中起着关键作用。本研究以朝鲜鹌鹑（栗羽）及其突变系黑羽和白羽为研究对象，通过实时荧光定量PCR技术、PCR-SSCP和真核表达等方法，主要探讨了TYR、TYRP1基因与朝鲜鹌鹑羽色的相关性。研究结果如下：朝鲜鹌鹑TYR基因全长编码区编码的蛋白由529个氨基酸残基组成，该蛋白被称为酪氨酸酶。它的分子量为60078.9Da，等电点为5.94。此外，带负电荷残基数为54，而带正电荷残基数为46。通过计算得到该蛋白的不稳定系数为58.15，因此被归类为不稳定蛋白。另外，通过氨基酸序列比对，发现与朝鲜鹌鹑TYR氨基酸序列相似度从高到低依次为：禽类96%；哺乳类73.9%⁷0.9%；两栖类67.9%和鱼类60.7%。朝鲜鹌鹑TYRP1基因编码区编码的蛋白由391个氨基酸残基组成。它的分子量为44727.8Da，等电点为9.22。此外，带负电荷残基数为20，而带正电荷残基数为32。通过计... 

【文章来源】：河南科技大学河南省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
符号表
第1章 文献综述
    1.1 鹌鹑羽色遗传
        1.1.1 种类及分布
        1.1.2 形态特征
        1.1.3 经济价值
        1.1.4 羽色多样性
    1.2 鹌鹑羽色的形成机理
        1.2.1 色素细胞的起源
        1.2.2 色素细胞的种类
        1.2.3 黑色素的种类
        1.2.4 黑色素的理化性质
        1.2.5 黑色素的生物合成过程
    1.3 鹌鹑羽色相关基因的研究进展
        1.3.1 TRP 基因家族
        1.3.2 MC1R 基因
        1.3.3 ASIP 基因
        1.3.4 MITF 基因
        1.3.5 EDNRB 基因
        1.3.6 KIT 基因
        1.3.7 SLC45A2 基因
    1.4 相关试验技术
        1.4.1 生物信息学分析
        1.4.2 实时荧光定量 PCR
        1.4.3 PCR-SSCP
    1.5 试验目的及意义
第2章 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 主要试验试剂
        2.1.3 主要试验设备
        2.1.4 引物的设计与合成
        2.1.5 分析软件
    2.2 试验方法
        2.2.1 主要试剂配制
        2.2.2 朝鲜鹌鹑基因组 DNA 的提取
        2.2.3 朝鲜鹌鹑总 RNA 的提取
        2.2.4 逆转录反应
        2.2.5 朝鲜鹌鹑 TYR、TYRP1 基因的扩增及测序
        2.2.6 生物信息学分析
        2.2.7 实时荧光定量分析
        2.2.8 PCR-SSCP 分析
        2.2.9 真核表达研究
第3章 结果与分析
    3.1 生物信息学分析
        3.1.1 朝鲜鹌鹑 TYR 基因的生物信息学分析
        3.1.2 朝鲜鹌鹑 TYRP1 基因的生物信息学分析
    3.2 TYR、TYRP1 基因在三种羽色（黑羽、栗羽和白羽）朝鲜鹌鹑皮肤组织中的表达研究
    3.3 朝鲜鹌鹑 TYR、TYRP1 基因多态性研究
        3.3.1 朝鲜鹌鹑 TYR 基因多态性研究
        3.3.2 朝鲜鹌鹑 TYRP1 基因多态性研究
    3.4 朝鲜鹌鹑 TYR 基因真核表达研究
        3.4.1 重组真核表达载体 pcDNA3.1（+）-TYR 的鉴定
        3.4.2 朝鲜鹌鹑胚胎中 pcDNA3.1（+）-TYR 的表达
第4章 讨论
    4.1 生物信息学分析
        4.1.1 TYR 基因生物信息学分析
        4.1.2 TYRP1 基因生物信息学分析
    4.2 相对表达量分析
        4.2.1 TYR 基因相对表达量分析
        4.2.2 TYRP1 基因相对表达量分析
    4.3 多态性分析
        4.3.1 TYR 基因多态性分析
        4.3.2 TYRP1 基因多态性分析
    4.4 真核表达分析
第5章 结论
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间的研究成果


【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3396090