水貂杯状病毒SD1株的分离鉴定及序列分析

发布时间：2021-09-25 11:22

　　为分析水貂杯状病毒中国分离株的遗传特征,本研究于2018年在山东地区某水貂养殖场内感染圆环病毒死亡的水貂中分离到1株水貂杯状病毒（mink calicivirus, MCV）,命名为SD1株,本研究对其进行了PCR鉴定、电镜观察和遗传演化分析。结果显示,SD1株可在MDCK细胞上产生明显细胞病变。电镜观察可见病毒粒子表面成楔形杯状样凹陷,无囊膜,具有杯状病毒的形态特征。遗传演化分析显示,SD1株与2007年国内2株MCV的同源性分别为92.0%和91.2%,为水疮性病毒属新成员;RdRp基因编码的氨基酸序列比对分析显示其相对保守,蛋白变异不大,而vp1基因推导的氨基酸序列比对分析显示其变异较大,与国内分离株（MF677852）相比存在47处替换,该变异是否会引起病毒致病力的改变有待进一步解析。本研究为MCV流行株病原学研究提供参考,同时提示需重视MCV在水貂病毒感染中的作用。 

【文章来源】：中国兽医学报. 2020,40(11)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

病毒感染MDCK细胞产生的CPE(400×)

以提取的分离病毒RNA反转录的cDNA为模板,利用检测引物扩增MCV RdRp基因片段。结果显示,PCR产物与预期大小相符(图3)。以上述cDNA为模板,根据表1设计的5对引物分别扩增MCV基因组各片段,克隆于T载体中,将PCR鉴定为阳性的各重组质粒测序,并将获得的5段基因序列经Seqman软件拼接成全基因组序列,通过NCBI BLAST进行比对。结果显示,该序列与1株MCV全基因组序列同源性为92.0%,该结果表明分离病毒为MCV,并将其命名为SD1株。图3 分离病毒的PCR鉴定

图3 分离病毒的PCR鉴定


本文编号：3409638