Ⅱ型猪链球菌高致病性中国株转录组及毒力相关通路分析

发布时间：2021-09-29 17:04

　　Ⅱ型猪链球菌（S.suis2）是一种重要的人畜共患病原,感染人类后可导致脑膜炎、败血症、关节炎以及链球菌中毒性休克综合征等。目前,Ⅱ型猪链球菌的跨种传播和致病机制仍不清楚,其毒力因子研究尚不全面。为深入研究S.suis2的致病机制,本课题利用链特异性RNA-seq策略,获得了可感染人的两株中国高致病性S.suis2（05ZYH33和98HAH33）和不可感染人的参考株S.suis2（P1/7）在相同生长条件下的转录组图谱,并对致病菌基因表达特点进行了全面系统的分析。基于高通量转录组分析策略,研究发现在三株菌株同源基因中,两致病菌株同时与参考株差异表达的基因有120个,在致病菌中上调基因53个,主要富集在翻译／核糖体结构／生物合成等,上调最明显的基因编码表面锚定蛋白；在致病菌中下调基因66个,主要富集在磷酸转移酶系统（PTS）、碳水化合物转运和代谢、无机离子转运和代谢、糖酵解／糖质增生以及酪氨酸代谢等代谢通路；另外还有1个基因在05ZYH33中上调,而在98HAH33中下调,该基因的具体功能值得进一步探究。上述结果表明致病菌株与参考株能量代谢和糖转化存在差异,提示两者能量代谢的不同,其中... 

【文章来源】：中国科学院大学(中国科学院北京基因组研究所)北京市

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

细菌致病性机制概述（摘自Wilsonetal，Mechanismsofbacteria丨pathogenicity[ii])

009年推出了双末端（paired-end)测序方法，如图时，在两端的接头上都加上测序引物结合位点，在引导互补链在原位置再生和扩增，使得第二轮的的合成测序。上，^J i “

1绪论 精确。多数转录组分析集中在获取单个细菌在特定时间点的表达谱，或者在下的基因差异表达分析。最近，转录组分析逐渐扩展到对不同菌株在特定刺录组分析，这些研究能够阐明细菌在特定环境下菌株特异性转录情况，并且病菌中潜在的毒力因子，如图1.8171]。目前几乎所有转录组研究都是分析大方法不能解决不同亚群间的重要差异。然而，这些差异恰恰是解释调控通路键因素，不过随着单个细菌的全转录本扩增的出现单细胞细菌转录组也能。

【参考文献】：
期刊论文
[1]Tyrosine phosphorylation and bacterial virulence[J]. Sarah E Whitmore,Richard J Lamont.  International Journal of Oral Science. 2012(01)
[2]DNA测序技术发展及其展望[J]. 孙海汐,王秀杰.  科研信息化技术与应用. 2009(03)



本文编号：3414101