基于RNA-seq筛选不同饲养模式下肉鸡肌肉发育代谢相关差异基因

发布时间：2021-10-05 01:00

　　为发掘饲养模式影响肌肉发育代谢的相关关键基因,本研究分别在笼养和地面平养2种饲养模式中随机选取5只42日龄Ross 308肉鸡进行屠宰,提取腿肌RNA,通过RNA-seq技术筛选出与肌肉发育代谢相关的差异基因,并利用qPCR进行验证。随后分离、鉴定并构建了鸡骨骼肌卫星细胞增殖分化模型,对关键差异基因PHGDH在鸡骨骼肌细胞中的表达模式进行检测。结果显示:在2种饲养模式中共筛选出3个差异表达基因（ASNS、JPH2、PHGDH）,qPCR验证结果与RNA-Seq测序结果一致,差异基因均在平养模式鸡腿肌肌肉中高表达;在鸡骨骼肌细胞增殖期间,PHGDH表达逐渐上调,但在分化第2天至第6天,表达水平逐渐下降;EdU细胞增殖检测结果显示,抑制PHGDH的表达可显著抑制鸡骨骼肌细胞的增殖。以上结果表明,PHGDH可能在鸡骨骼肌形成过程中发挥重要作用。 

【文章来源】：中国畜牧杂志. 2020,56(05)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

2种饲养模式下肉鸡日增重

图4显示，3个差异表达基因在不同饲养模式下的表达水平均存在显著或极显著的差异，而随机选取的2个任意基因差异不显著。表明荧光定量PCR验证的结果与RNA-Seq中基因表达检测的结果一致。图3 差异基因表达火山图

差异基因表达火山图


本文编号：3418683