布鲁菌Rev.1疫苗株全基因组序列测定及分析

发布时间：2021-10-05 11:09

　　为了解布鲁菌Rev.1疫苗株基因组的基本信息,本研究利用PacBio平台对布鲁菌Rev.1疫苗株进行测序分析,结果表明,其基因组全长约3,299,187bp,GC含量约57.23%,其中染色体1的基因组全长约2,121,370,GC含量约57.15%;染色体2的基因组全长约1,177,817,GC含量约57.34%。预测编码基因个数为3,318个,总长度为2,857,932bp,平均长度861bp,GC含量约58.34%,占基因组全长的86.63%,共预测37个散在重复序列、89个串联重复序列、71个小卫星DNA、54个tRNA、9个rRNA、2个sRNA及10个基因岛序列。布鲁菌Rev.1疫苗株预测基因与各功能数据库比对结果显示,GO数据库注释基因数量为2,148个,KEGG数据库3,253个,COG数据库2,703个,NR数据库3,274个,TCDB数据库390个,PHI数据库223个,VFDB数据库228个,ARDB数据库1个,CARD数据库21个,共预测分泌蛋白158个,T3SS效应蛋白78个。将布鲁菌 Rev.1 疫苗株的 BLS、gmd、L7/L12、OMP25、OMP28... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２?Ｒｅｖ．?１疫苗株基因组测序读长分布

图３?Ｒｅｖ．?１疫苗株基因组测序质量分布??

Rev.1痊苗株染色体，全基因组图谱

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
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[7]WboA基因在布鲁菌S2株诱导机体免疫应答中的作用[D]. 戎瑞雪.河北大学 2014
[8]奶牛布鲁氏菌病流行病学调查及风险评估模型构建及应用[D]. 王亭.东北农业大学 2013
[9]人和动物布氏杆菌病疫情时空趋势分析及其相关性研究[D]. 朱素萍.西北民族大学 2013
[10]犬布氏杆菌分离鉴定及omp25基因分析[D]. 狄栋栋.内蒙古农业大学 2011



本文编号：3419615