SH2B1和TBC1D1基因多态性与家兔生长性状以及部分屠宰和肉质性状的关联分析

发布时间：2021-10-08 01:53

　　SH2B1和TBC1D1是胰岛素信号通路上具有生物学作用的信号因子,在胰岛素信号通路调节葡萄糖摄取的过程中发挥关键作用。本试验通过直接测序技术检测SH2B1部分mRNA序列和TBC1D1基因编码区序列的SNPs位点,采用HRM技术、RFLP技术和生物质谱技术对5个家兔品种共722个样本的候选SNPs位点进行基因分型；应用最小二乘法对SH2B1和TBC1D1基因SNPs位点与家兔多个生产性状进行关联分析；采用实时荧光定量技术检测35日龄,56日龄,70日龄肝脏组织中SH2B1基因mRNA相对表达量,分析不同发育阶段以及不同基因型mRNA相对表达量的关联性。试验结果如下：（1）SH2B1基因mRNA的3’UTR区检测到2个SNPs位点,分别为r.*464T>C和r.*749 G>A; TBC1D1基因检测到12个SNPs位点,其中7个同义突变SNPs位于TBC1D1的TBC结构域（c.2451G>A, c.2514A>G, c.2535G>A, c.2589G>A, c.2763T>C, c.2844T>C, c.2937G>T）,4个... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 胰岛素信号通路研究进展
        1.1.1 胰岛素通路刺激的葡萄糖转运
        1.1.2 胰岛素信号通路
    1.2 SH2B1研究进展
        1.2.1 SH2B1基因结构及生物学功能
        1.2.2 SH2B1基因SNPs位点的相关研究进展
    1.3 TBC1D1研究进展
        1.3.1 TBC1D1基因结构及生物学功能
        1.3.2 TBC1D1基因SNPs位点的相关研究进展
    1.4 研究的意义及主要内容
        1.4.1 研究的意义
        1.4.2 研究内容
2 试验材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物与样本采集
        2.1.2 屠宰指标性状测定
        2.1.3 主要仪器设备
        2.1.4 试验主要试剂及配置
    2.2 试验方法
        2.2.1 全基因组DNA提取
        2.2.2 全基因组DNA检测
        2.2.3 肝脏组织总RNA的提取
        2.2.4 肝脏组织总RNA检测
        2.2.5 cDNA的合成
        2.2.6 目的基因扩增
        2.2.7 SH2B1和TBC1D1基因SNPs位点分型
        2.2.8 实时荧光定量PCR
        2.2.9 数据分析
3 结果与分析
    3.1 SH2B1和TBC1D1基因SNPs筛选
        3.1.1 全基因组DNA和肝脏组织总RNA提取结果
        3.1.2 PCR扩增结果
        3.1.3 SNPs测序结果
        3.1.4 SNP对应蛋白质位置预测分析
        3.1.5 SNPs筛选
    3.2 SH2B1和TBC1D1基因分型结果
        3.2.1 SH2B1基因酶切结果
        3.2.2 TBC1D1基因HRM分型结果
        3.2.3 SH2B1基因和TBC1D1基因质谱分型结果
    3.3 SH2B1和TBC1D1基因遗传结构分析结果
C位点遗传结构分析结果">        3.3.1 SH2B1基因r.~*464 T>C位点遗传结构分析结果
A位点遗传结构分析结果">        3.3.2 TBC1D1基因c.214G>A位点遗传结构分析结果
    3.4 SH2B1和TBC1D1基因与家兔生产性状关联分析结果
C位点与家兔生长性状关联分析结果">        3.4.1 SH2B1基因r.~*464 T>C位点与家兔生长性状关联分析结果
C位点与家兔部分屠宰和肉质性状关联分析结果">        3.4.2 SH2B1基因r.~*464 T>C位点与家兔部分屠宰和肉质性状关联分析结果
A位点与家兔生长性状关联分析结果">        3.4.3 TBC1D1基因c.214G>A位点与家兔生长性状关联分析结果
A位点与伊拉兔生长性状,部分屠宰和肉质性状关联分">        3.4.4 TBC1D1基因c.214G>A位点与伊拉兔生长性状,部分屠宰和肉质性状关联分
    3.5 SH2B1基因mRNA相对表达量结果分析
        3.5.1 标准曲线的绘制
        3.5.2 实时荧光定量PCR表达结果
        3.5.3 SH2B1基因mRNA在不同日龄的相对表达量
        3.5.4 SH2B1基因mRNA不同基因型的相对表达量
4 讨论
    4.1 SH2B1和TBC1D1基因SNPs位点分析
    4.2 HRM分型
    4.3 SH2B1和TBC1D1基因与家兔生产性状的关联分析
        4.3.1 SH2B1基因与家兔生产性状的关联分析
        4.3.2 TBC1D1基因与家兔生产性状的关联分析
    4.4 SH2B1基因mRNA相对表达量分析
        4.4.1 SH2B1基因mRNA在不同日龄相对表达量分析
        4.4.2 SH2B1基因mRNA不同基因型相对表达量分析
5 结论
展望
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]胰岛素信号传导及其调节机制[J]. 唐伟,朱剑,武晓泓,刘超.  实用糖尿病杂志. 2005(03)



本文编号：3423199