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牛诺如病毒的分子检测和基因组研究

发布时间:2021-10-16 07:08
  牛诺如病毒(Bovine Norovirus,BNoV)是一种引起犊牛腹泻的病原,并已经在意大利,韩国和中国等19个国家报道检出。BNoV属于GIII,进一步可细分为GIII.1和GIII.2两种基因亚型。2017年,本实验室证明了BNoV在我国的存在,但BNoV在国内的流行情况和基因组尚无研究,本研究的目的是调查我国BNoV的流行情况及基因组特征,取得以下成果:1首次证明BNoV在我国奶犊牛中广泛流行,并具有独特的进化特征牛诺如病毒是一种引起犊牛腹泻的病原,本研究旨在调查该病毒在国内部分地区BNoV的流行情况及分子特征。采用RT-PCR对采自国内6省的25个养殖场的265份奶犊牛粪便样本进行BNoV检测,其中有211份腹泻粪便样本和54份健康粪便样本。结果显示:腹泻样本中BNoV检出率为20.4%(43/211),显著高于健康粪便样本中9.26%的检出率(P<0.01),证明该病毒与犊牛腹泻息息相关;四川省、辽宁省、河南省、新疆维吾尔自治区和山东省的腹泻样本中BNoV检出率分别为34.8%(8/23),53.2%(25/47),11.1%(3/27),6.9%(6/87)和9.... 

【文章来源】:西南民族大学四川省

【文章页数】:74 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

牛诺如病毒的分子检测和基因组研究


BNoV基因组结构示意图

牛诺如病毒的分子检测和基因组研究


NoVRdRp的结构

结构域,晶体结构,病毒,毒株


牛诺如病毒的分子流行病学和基因组特征7图3P结构域的晶体结构Figure3X-raycrystalstructureofPdomain1.3.4ORF3及其编码蛋白ORF3编码次要衣壳蛋白(VP2),是基因组中的高变区,其可以起到维持NoV病毒颗粒的稳定性的作用(Lin,Fengling,Lianzhu,Yuxiu,&Yanhua,2014)。关于NoVVP2的研究较少,尚未见关于BNoVVP2的结构与功能相关报道。1.4牛诺如病毒的重组NoV具有高的遗传变异性,并且能够进行重组,重组被认为是NoV进化的主要驱动因素之一(White,2014)。目前,在BNoV中报道的重组事件存在三种重组类型,分别为GIII.P1/GIII.2、GIII.P2/GIII.1和GIII.P2/GIII.4,重组位点位于ORF1/ORF2连接起点上游的9-19个核苷酸(DiFeliceetal.,2016)。2004年,Oliver等人在英国鉴定了第一个BNoV重组毒株Bo/Thirsk10/00/UK,该毒株具有

【参考文献】:
期刊论文
[1]牛冠状病毒RT-PCR检测方法的建立及应用[J]. 何琪富,郭紫晶,李然,周军,岳华,张斌,汤承.  畜牧兽医学报. 2018(10)
[2]川藏地区牦牛牛病毒性腹泻病毒分子流行病学调查及分离鉴定[J]. 陈新诺,肖敏,阮文强,覃思楠,岳华,汤承,张斌.  畜牧兽医学报. 2018(03)
[3]牦牛轮状病毒VP6基因序列分析及RT-PCR检测方法的建立与应用[J]. 周芳,岳华,张斌,李凡,陈曦,汤承.  畜牧兽医学报. 2016(07)



本文编号:3439385

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