牦牛和犏牛MEISETZ基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2021-10-26 06:49

　　为探讨MEISETZ基因与犏牛雄性不育可能性关系,克隆测序牦牛、犏牛MEISETZ基因CDS区,运用生物信息学软件对其编码区作序列分析、蛋白结构与功能预测。结果表明,牦牛、犏牛MEISETZ基因CDS区长度均为688 bp,编码222个氨基酸残基;牦牛、犏牛MEISETZ蛋白均为偏碱性蛋白,不稳定指数高于阈值,蛋白结构不稳定,均无跨膜结构域,无信号肽,属非分泌型蛋白,二三级结构均以无规卷曲为主,均含有SET超家族结构域。系统进化分析显示,犏牛与牦牛聚为一类,亲缘关系最密切,序列高度保守。牦牛与犏牛核苷酸序列相比,共有4处发生碱基变异,相似性为99.4%;牦牛MEISETZ蛋白氨基酸序列与犏牛相比,144位（A→G）、204位（P→Q）2个位点发生变异,同源性为99.1%,研究为牦牛、犏牛MEISETZ基因结构与功能特别是犏牛雄性不育后续研究提供基础数据。 

【文章来源】：东北农业大学学报. 2020,51(07)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

重组子鉴定结果

将提取的重组质粒pGEM-T Vector-MEISETZ用限制性内切酶Eco RⅠ、HindⅢ酶切消化，消化产物电泳结果如图2B所示，得到2 692 bp载体序列和目的片段，说明目的片段正向插入p GEM-T载体，成功构建重组质粒。图2 重组子鉴定结果

使用软件ExPASy-ProtParam预测牦牛、犏牛MEISETZ蛋白理化性质。牦牛和犏牛MEISETZ基因分子质量分别为25.081和25.098 ku；蛋白等电点均为5.66，为偏酸性蛋白；带负电荷氨基酸残基（Asp+Glu）均为30个，正电荷氨基酸残基（Arg+Lys）均为24个，其中丝氨酸（Ser）数量最多，均为23个，占比10.4%，甲硫氨酸（Met）含量最少，均为1个，且除丙氨酸（Ala）、甘氨酸（Gly）、谷氨酰胺（Gln）、脯氨酸（Pro）含量有差别外，其余氨基酸含量均相同；不稳定指数分别为48.21、47.68，高于阈值40，表明牦牛和犏牛MEISETZ蛋白结构不稳定；脂肪系数分别为65.9、65.45，说明牦牛、犏牛该蛋白流动性好；总平均亲水系数（GRAVY）为-0.829、-0.848，结合ExPASy-ProtScale预测结果，牦牛、犏牛MEISETZ蛋白中大多数氨基酸为亲水性，属于亲水性蛋白。图4 MEISETZ基因系统进化树

【参考文献】：
期刊论文
[1]牦牛、犏牛TB-RBP基因克隆及在睾丸组织中的表达[J]. 柴志欣,王会,王吉坤,王嘉博,钟金城.  华北农学报. 2020(01)
[2]牦牛、犏牛和黄牛组织中TSPY基因表达水平研究[J]. 官久强,蒋小兵,杨平贵,安添午,谢荣清,赵洪文,罗晓林.  黑龙江畜牧兽医. 2017(11)
[3]犏牛主要经济性状的研究进展[J]. 杨德彬,张燕,金天虎,谢荣清.  四川畜牧兽医. 2015(11)
[4]山羊FAM134B基因克隆、序列分析及其mRNA表达与肌内脂肪含量的相关性[J]. 朱武政,江明锋,唐璐,王永.  农业生物技术学报. 2014(10)
[5]精氨酸对动物的营养生理及免疫作用[J]. 孙红暖,杨海明,王志跃,张得才,张芬芬,杨芷.  动物营养学报. 2014(01)
[6]牦牛及杂种后代犏牛的TSPY基因克隆分析[J]. 张利亚,陈智华,钟金城,姜雪鸥,李娜.  家畜生态学报. 2013(02)
[7]公牛精母细胞减数分裂与精子发生的研究[J]. 赵振民,杨世柱.  黄牛杂志. 1998(01)

博士论文
[1]甘氨酸对仔猪生长及肠道功能影响的研究[D]. 王薇薇.中国农业大学 2014



本文编号：3459045