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传染性支气管炎CK/CH/HD/190716株的分离鉴定与全基因组分析

发布时间:2021-11-07 21:29
  对河北某免疫鸡场采集疑似感染传染性支气管炎病毒(IBV)鸡的肺脏进行病毒分离,并通过鸡胚接种和全基因序列测定分析,对分离病毒进行鉴定和遗传变异分析。分离到1株IBV,命名为CK/CH/HD/190716,该病毒接种鸡胚后可产生IBV特征性的侏儒胚。该病毒基因组总长为27 680 bp,其中Ploy A尾含有16个A。将分离株基因序列与不同基因型的IBV毒株进行同源比对,构建遗传进化树进行基因分型,证实该毒株属于QX型。选取我国分离的14株QX型IBV与之比较同源性,发现该型病毒全基因组的同源性在93%~97%,但是5a基因的同源性最低,只有80%,表明IBV各基因之间的进化具有显著差异。随后通过多个重组软件分析证实,该毒株的1a基因部分区域由QX型野毒KX425847和KU317090重组产生。本试验揭示了我国流行的QX型IBV存在基因多样性,需要对该型病毒的遗传演化进行密切监测。 

【文章来源】:中国兽医杂志. 2020,56(06)北大核心

【文章页数】:7 页

【部分图文】:

传染性支气管炎CK/CH/HD/190716株的分离鉴定与全基因组分析


基于全基因组序列进化树分析

传染性支气管炎CK/CH/HD/190716株的分离鉴定与全基因组分析


CK/CH/HD/190716株致鸡胚病变

【参考文献】:
期刊论文
[1]1株QX基因型鸡传染性支气管炎病毒的致病性[J]. 潘力,于可响,李桂明,刘存霞,李玉峰,杨世发,万仁忠,李智勇,赵增成,林树乾.  中国兽医学报. 2019(08)
[2]2013~2017年鸡传染性支气管炎病毒分子流行病学分析[J]. 陈良珂,封柯宇,李鸿鑫,蔺文成,陈伟国,谢青梅.  中国家禽. 2018(15)
[3]浅谈鸡传染性支气管炎诊断和防治措施[J]. 黄清程.  中国畜禽种业. 2017(03)
[4]2012~2013年鸡传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因序列分析与血清型鉴定[J]. 张丽华,吴翠兰,张志鹏,何怡宁,李和鸣,秦丽莉,韦天超,磨美兰,韦平.  病毒学报. 2016(01)
[5]QX基因型鸡传染性支气管炎病毒致弱研究[J]. 霍亚飞,许传田,崔言顺,杨少华,黄庆华,张琳,黄艳艳,李建亮,胡北侠,张秀美.  中国预防兽医学报. 2015(03)
[6]鸡传染性支气管炎病毒的研究进展[J]. 李善臣.  中国畜禽种业. 2014(12)
[7]鸡传染性支气管炎病毒感染的分子机制[J]. 孙裴,施雷,魏建忠,李郁,王桂军.  动物医学进展. 2013(12)
[8]鸡传染性支气管炎病毒HH06分离株的鉴定及其S1基因的分子特征[J]. 马德星,潘龙,任晓峰,王金侠,李广兴.  中国兽医科学. 2007(11)
[9]鸡传染性支气管炎病毒中国分离株S1基因的序列分析[J]. 陈峰,周庆丰,廖秋生,吴孔兴,毕英佐,曹永长.  中国兽医科技. 2005(07)

硕士论文
[1]2012~2013年IBV广西分离株的基因序列分析和血清学鉴定[D]. 吴翠兰.广西大学 2015
[2]鸡传染性支气管炎病毒国内分离株LX4 5a、5b及N基因的研究[D]. 杜恩岐.西北农林科技大学 2003



本文编号:3482435

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