藏仔猪粪便真菌菌群多样性分析

发布时间：2021-11-08 04:14

　　为探究西藏地区藏仔猪粪便中真菌菌群结构,本研究采用ITS1序列分析新生藏仔猪和断奶藏仔猪新鲜粪便中真菌的多样性。结果表明:从5头新生藏仔猪新鲜粪便中,共鉴定出5个门、13个纲、25个目、33个科和38个属的真菌;从5头断奶藏仔猪新鲜粪便中,共鉴定出5个门、12个纲、20个目、24个科和28个属的真菌。子囊菌门和担子菌门为优势门,占门级分类的86.35%;布勒担菌科、虫草科、丛赤壳科、曲霉科、丝孢酵母菌科、肉杯菌科、酵母菌科和毕赤酵母菌科为优势科,占科级分类的54.38%。随着藏仔猪的生长,其粪便中真菌菌群的数量和优势真菌的相对丰度均发生变化,这说明不同生长发育阶段会影响藏仔猪粪便中真菌的多样性。 

【文章来源】：菌物学报. 2020,39(07)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

各试验组样品稀疏曲线图A：新生藏仔猪；B：断奶藏仔猪.下同

对获得的序列按97%的相似度进行归并和OTU划分，在门、纲、目、科、属5个分类水平下所获得的OTU数见图2。A组中共鉴定出5个门、13个纲、25个目、33个科和38个属；B组中共鉴定出5个门、12个纲、20个目、24个科和28个属。由各分类水平的微生物类群数统计结果可知，随着藏仔猪逐渐生长，其粪便真菌在各分类水平的类群统计数均减少。由藏仔猪粪便中真菌菌落的Venn图可知，共计获得627个OTUs,A组共有342个OTUs、B组共有488个OTUs,A组和B组的共有OTUs为203个，占总OTUs的32.37%，由此推断，A组和B组中藏仔猪粪便真菌菌群结构的差异性较大（图3）。图3 不同试验组藏仔猪粪便中真菌菌落在属水平下的Venn图

不同试验组藏仔猪粪便中真菌菌落在属水平下的Venn图

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3482983