基于线粒体NAD1和COX1基因的大熊猫西氏贝蛔虫种群遗传结构研究

发布时间：2021-11-14 16:00

　　大熊猫（Ailuropoda melanoleuca）是世界公认的最为濒危物种之一。在历史进化过程中受气候变化、人类活动及其自身的生理局限等因素影响,大熊猫经两次显著地种群扩张和收缩后逐渐分化为了秦岭、岷山和邛崃·相岭·凉山三个遗传种群。宿主种群的扩张、收缩和迁移决定了寄生虫种群结构和遗传分化。西氏贝蛔虫（Baylisascaris schroederi）是大熊猫体内最常见且危害最为严重的寄生虫。在随大熊猫协同进化的过程中,西氏贝蛔虫种群的遗传结构是否发生分化目前尚未得知。为了给西氏贝蛔虫的流行病学、进化生物学和抗药机制提供一些基础资料,本研究分别使用线粒体NAD1和COXl基因作为分子标记,对来自秦岭、岷山和邛崃地理种群的西氏贝蛔虫进行了种群遗传结构研究。本论文主要的研究工作如下：1.基于线粒体NAD1基因对西氏贝蛔虫的种群遗传结构研究为了探究中国不同山系大熊猫西氏贝蛔虫种群遗传结构,本实验利用PCR技术扩增了三个地理种群的共计47个样本（岷山13个,邛崃26个,秦岭8个）的线粒体NAD1（873bp）基因全序列,并进行了种群遗传结构分析。三个地理种群的47个样本共分出了15个单倍型... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：47 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 文献综述
    一、种群遗传学
        1. 种群遗传学的概念
        2. 影响种群遗传结构的因素
        3. 种群遗传学的应用
    二、线虫的种群遗传学研究
        1. 基于SSCP技术对线虫群体遗传结构进行分析
        2. 基于RFLP,AFLP和RAPD方法对线虫群体遗传结构的研究
        3. 基因序列分析、等位酶标记和微卫星标记应用于寄生线虫遗传结构分析
    三、寄生虫与宿主间的相互种群影响
        1. 协同进化
        2. 寄生虫与宿主种群的相互调节
    四、展望
    五、本研究的目的及意义
第二部分 研究内容
    第一章 基于线粒体NAD1基因对西氏贝蛔虫种群遗传多态性的研究
        摘要
        引言
        1 试剂与方法
            1.1 试验材料
            1.2 试验方法
        2 实验结果
            2.1 序列特征
            2.2 遗传多样性
            2.3 系统发育树和单倍型网络图
            2.4 群体历史动态
            2.5 种群遗传分化
        3 讨论
            3.1 序列特征分析
            3.2 遗传多样性分析
            3.3 种群中性检验及历史动态
            3.4 遗传分化分析
    第二章 基于线粒体COX1基因对西氏贝蛔虫种群遗传结构的研究
        摘要
        引言
        1 材料与方法
            1.1 试验材料
            1.2 试验方法
        2 实验结果
            2.1 序列特征
            2.2 遗传多样性
            2.3 单倍型系统进化树和网络图
            2.4 群体历史动态
            2.5 群体遗传结构
        3. 讨论
            3.1 遗传多样性
            3.2 种群中性检验及历史动态
            3.3 遗传分化
第三部分 结论和创新点
    1. 结论
    2. 创新点
参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体CO2和ND4基因对四川省豆状带绦虫种群遗传多样性的分析[J]. 杨德英,任永军,聂华明,付彦,谢跃,陈林,农向,岩宁,古小彬,王淑贤,杨光友.  中国兽医学报. 2013(01)
[2]大熊猫等8种野生哺乳动物蛔虫的线粒体COXⅠ和COXⅡ基因的亲缘关系分析[J]. 牛李丽,陈世界,汪涛,古小彬,严玉宝,余华,邓家波,严慧娟,余星明,陈维刚,王淑贤,杨光友.  畜牧兽医学报. 2012(10)
[3]基于cytb基因对大熊猫等六种珍稀野生动物感染蛔虫的种系发育分析[J]. 牛李丽,李岩,古小彬,余华,邓家波,严慧娟,余星明,陈维刚,王淑贤,杨光友.  中国兽医科学. 2012(09)
[4]基于线粒体12S基因对青海地区细粒棘球蚴种群遗传多态性研究[J]. 延宁,聂华明,蒋忠荣,邓世金,余华,严玉宝,达瓦次仁,谢跃,付彦,杨德英,郝桂英,古小彬,杨光友.  畜牧兽医学报. 2012(06)
[5]基于线粒体细胞色素b基因的细颈囊尾蚴种群遗传多样性研究[J]. 郝桂英,杨光友,古小彬,阳爱国,杨应东,王淑贤.  畜牧兽医学报. 2012(01)
[6]线虫线粒体基因组全序列分析研究进展[J]. 贾万忠,闫鸿斌,倪兴维,曹平,娄忠子,付宝权,史万贵.  中国农业科学. 2011(06)
[7]中国近海小黄鱼遗传变异的细胞色素b序列分析[J]. 彭博,章群,赵爽,乐小亮.  广东农业科学. 2010(02)
[8]基于ND4基因部分片段探讨中国4个家驴品种的母系构成[J]. 陈建兴,孙玉江,沈伟,潘庆杰,闵令江.  青岛农业大学学报(自然科学版). 2009(04)
[9]大熊猫等八种野生珍稀动物蛔虫ITS-2基因的序列分析[J]. 何光志,牛李丽,杨光友,邓家波,王帅,余星明,汪涛,古小彬,陈维刚.  中国兽医科学. 2008(11)
[10]大熊猫西氏贝蛔虫与黑熊横走贝蛔虫成虫体内8种无机元素的分析[J]. 彭雪蓉,杨光友.  西华师范大学学报(自然科学版). 2007(03)

博士论文
[1]三种海洋鱼类分子系统地理学研究[D]. 韩志强.中国海洋大学 2008

硕士论文
[1]基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究[D]. 张勇.上海海洋大学 2011



本文编号：3494931