基于RNA-Seq挖掘玫瑰冠鸡与科宝鸡胚胎期胸肌组织差异表达基因

发布时间：2021-11-25 06:44

　　本研究旨在挖掘玫瑰冠鸡与科宝鸡胚胎期胸肌组织中差异表达基因,探讨2种鸡肌肉发育及肌内脂肪（IMF）沉积的分子遗传机理。本研究利用RNA-Seq技术对玫瑰冠鸡和科宝鸡胚胎期胸肌组织中差异表达基因（Differentially expressed genes, DEGs）进行筛选,通过GO富集和KEGG数据库对DEGs的功能进行注释与分析。结果显示:4个文库共鉴定到4 643个差异表达基因,其中玫瑰冠公鸡胸肌和科宝公鸡胸肌中有1 909个显著表达的基因,以科宝鸡为参照,929个上调,980个下调;玫瑰冠母鸡胸肌和科宝母鸡胸肌中有2 734个显著表达的基因,其中1 444个上调,1 290个下调。经荧光定量PCR验证,选取的12个差异基因的表达趋势与测序结果一致。GO富集结果表明,MYL2调控骨骼肌的生长发育,MYOG参与肌细胞的形成与分化;ACACA、ACOX2和ACOX3参与脂肪酸代谢过程;Notch1参与了胚胎发育及脂肪分化相关过程。此外,KEGG通路分析结果显示,能量代谢相关的信号通路（mTOR）与肌肉发育相关的信号通路相互作用影响肌纤维的发育。细胞连接相关通路（局部粘附、ECM-受... 

【文章来源】：江苏农业学报. 2020,36(05)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

样品间相关性分析

差异表达基因火山图

差异表达基因维恩图及聚类图


本文编号：3517611