广灵驴CAST基因的克隆与表达
发布时间:2021-11-27 20:47
对广灵驴钙蛋白酶抑制(CAST)基因进行克隆及序列分析,并用实时荧光定量PCR技术对其在心、肝、脾、肺、肾和背最长肌等6种组织中的表达水平进行分析,探究CAST基因对驴肉品质的影响.结果表明,广灵驴CAST基因的CDS编码区全长2 427 bp,共编码808个氨基酸,将测序序列提交至NCBI,得到的GenBank登录号为MN231002.广灵驴CAST蛋白的氨基酸序列与马、牛、人、猪、山羊、绵羊、小鼠、鸡的同源性分别为98.6%、77.1%、70.8%、77.5%、70.1%、60.9%、65.1%和41.5%;CAST基因在广灵驴6种组织中均存在表达,其中,表达量最高的组织为背最长肌.本试验成功获得了广灵驴的CAST基因,并发现其在背最长肌中高度表达,为进一步研究CAST基因在肌肉嫩度方面的表达调控功能提供参考.
【文章来源】:福建农林大学学报(自然科学版). 2020,49(05)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
广灵驴CAST基因的cDNA序列及编码蛋白序列
进一步对CAST基因编码的蛋白序列与GenBank中已提交的蛋白序列进行同源性比对,结果(图3)显示,广灵驴CAST蛋白氨基酸序列与马(XP_023473705.1 )、牛(NP_001025489.2)、人(BAA03747.1)、猪(NP_999232.1)、山羊(ADE58451.1)、绵羊(NP_001009788.1)、小鼠(BAA84768.1)、鸡(NP_001131122.1)的同源性分别为98.6%、77.1%、70.8%、77.5%、70.1%、60.9%、65.1%和41.5%.图3 广灵驴CAST蛋白序列与其他动物序列的多重比对
广灵驴CAST蛋白序列与其他动物序列的多重比对
【参考文献】:
期刊论文
[1]蛋白质糖基化修饰的研究进展[J]. 王晓龙,王秀然,卢天成. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[2]驴的产肉、理化指标及加工特性比较研究[J]. 周楠,韩国才,柴晓峰,孙宝忠,李海鹏,郑世学,谢鹏. 畜牧兽医学报. 2015(12)
[3]CAPN1和CAST基因在牦牛不同组织中的表达差异研究[J]. 姚慧,陈智华,钟金城,曾贤彬,柴志欣. 河南农业科学. 2014(03)
[4]蛋白质的二级结构预测研究进展[J]. 唐媛,李春花,张瑗,尚进,邹凌云,李立奇. 现代生物医学进展. 2013(26)
[5]钙蛋白酶抑制蛋白及CAST基因对肉品质及嫩度的影响[J]. 李婧,郭月英,任霆,靳烨. 食品工业. 2013(06)
[6]CAST基因研究进展[J]. 左北瑶,钱宏光. 中国草食动物. 2011(06)
[7]山羊CAST基因Ⅱ型转录本的克隆及在山羊不同组织中的表达[J]. 赵伯阳,汪代华,徐刚毅,赵文伯,郑程莉. 遗传. 2011(04)
[8]钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因在鸡不同组织和品种中的表达差异[J]. 刘安芳,朱庆,刘益平,张增荣. 中国农业科学. 2007(10)
[9]CAST基因及钙蛋白酶系统的研究进展[J]. 李静,朱庆. 安徽农业科学. 2007(15)
[10]猪钙蛋白酶抑制蛋白基因PCR-RFLP多态性与肉质性状及背膘厚间的关系分析[J]. 孙立彬,孟和,李婧,白春艳,潘玉春. 上海交通大学学报(农业科学版). 2005(01)
硕士论文
[1]绵羊CAPN1、CAST基因mRNA的发育性表达规律及其对肉品质的影响[D]. 燕凤.西北农林科技大学 2008
本文编号:3523019
【文章来源】:福建农林大学学报(自然科学版). 2020,49(05)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
广灵驴CAST基因的cDNA序列及编码蛋白序列
进一步对CAST基因编码的蛋白序列与GenBank中已提交的蛋白序列进行同源性比对,结果(图3)显示,广灵驴CAST蛋白氨基酸序列与马(XP_023473705.1 )、牛(NP_001025489.2)、人(BAA03747.1)、猪(NP_999232.1)、山羊(ADE58451.1)、绵羊(NP_001009788.1)、小鼠(BAA84768.1)、鸡(NP_001131122.1)的同源性分别为98.6%、77.1%、70.8%、77.5%、70.1%、60.9%、65.1%和41.5%.图3 广灵驴CAST蛋白序列与其他动物序列的多重比对
广灵驴CAST蛋白序列与其他动物序列的多重比对
【参考文献】:
期刊论文
[1]蛋白质糖基化修饰的研究进展[J]. 王晓龙,王秀然,卢天成. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[2]驴的产肉、理化指标及加工特性比较研究[J]. 周楠,韩国才,柴晓峰,孙宝忠,李海鹏,郑世学,谢鹏. 畜牧兽医学报. 2015(12)
[3]CAPN1和CAST基因在牦牛不同组织中的表达差异研究[J]. 姚慧,陈智华,钟金城,曾贤彬,柴志欣. 河南农业科学. 2014(03)
[4]蛋白质的二级结构预测研究进展[J]. 唐媛,李春花,张瑗,尚进,邹凌云,李立奇. 现代生物医学进展. 2013(26)
[5]钙蛋白酶抑制蛋白及CAST基因对肉品质及嫩度的影响[J]. 李婧,郭月英,任霆,靳烨. 食品工业. 2013(06)
[6]CAST基因研究进展[J]. 左北瑶,钱宏光. 中国草食动物. 2011(06)
[7]山羊CAST基因Ⅱ型转录本的克隆及在山羊不同组织中的表达[J]. 赵伯阳,汪代华,徐刚毅,赵文伯,郑程莉. 遗传. 2011(04)
[8]钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因在鸡不同组织和品种中的表达差异[J]. 刘安芳,朱庆,刘益平,张增荣. 中国农业科学. 2007(10)
[9]CAST基因及钙蛋白酶系统的研究进展[J]. 李静,朱庆. 安徽农业科学. 2007(15)
[10]猪钙蛋白酶抑制蛋白基因PCR-RFLP多态性与肉质性状及背膘厚间的关系分析[J]. 孙立彬,孟和,李婧,白春艳,潘玉春. 上海交通大学学报(农业科学版). 2005(01)
硕士论文
[1]绵羊CAPN1、CAST基因mRNA的发育性表达规律及其对肉品质的影响[D]. 燕凤.西北农林科技大学 2008
本文编号:3523019
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3523019.html