猪流行性腹泻病毒jiaozuo1012/2019株的分离鉴定及遗传进化分析

发布时间：2021-11-28 13:27

　　为确定2019年河南焦作某猪场哺乳仔猪发生腹泻的病因,本研究采用RT-PCR方法对该发病猪场送检的5份仔猪肠内容物样品进行仔猪腹泻相关病毒检测,对检测的猪流行性腹泻病毒（PEDV）阳性样品进行病毒分离,对分离的PEDV S基因和ORF3基因进行PCR扩增,并分析这两个基因与GenBank中的PEDV参考株相应基因的同源性及遗传进化分析。结果显示,送检的5份猪肠道内容物样品PEDV检测结果均为阳性,而猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）和猪轮状病毒（PoRV）的检测结果均为阴性;将随机选取的1份PEDV阳性样品接种Vero细胞并经传代培养,对培养5代的病毒经PCR检测表明分离到一株PEDV,并将其命名为jiaozuo1012/2019株;基于S基因同源性分析结果显示,该分离株与河南分离的PEDV CH/HNLH/2015株同源性最高,为99.3%,与近期河南分离株的同源性为96.4%～99.0%,与经典PEDV CV777株的同源性较低为93.4%。分离株S基因编码的氨基酸在aa59～aa62位存在4个氨基酸(⁵⁹QGVN⁶²)的插入,在aa140和... 

【文章来源】：中国预防兽医学报. 2020,42(09)北大核心CSCD

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

图1 分离病毒的IFA鉴定结果

利用1.2中引物对分离的PEDV进行S基因和ORF3基因的PCR扩增。结果显示，分别扩增出大小约4 000 bp、600 bp的目的基因，均与预期的S基因和ORF3基因大小一致（图2）；测序结果显示，分离的PEDV S基因全长为4 161 bp,ORF3基因全长为675 bp。表明，正确克隆了PEDV分离株的S基因和ORF3基因。2.4分离病毒S基因和ORF基因同源性及其遗传进化分析结果

本研究鉴定了2019年河南某猪场发生仔猪腹泻疫情的病原为PEDV，并利用Vero细胞分离获得了PEDV自然感染株（jiaozuo1012/2019）。分离株经S基因和ORF3基因的克隆、测序及分析，进一步证实该株PEDV与近年来河南地区PEDV流行株突变特征一致，为PEDV新的流行株[13]。本研究结果为深入探究PEDV新流行株的致病性和致病机理奠定了基础。

【参考文献】：
期刊论文
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[2]新发展理念视阈下的我国畜禽疫病防控[J]. 常帅,刘嘉,叶静,陈焕春,曹胜波.  中国科学院院刊. 2019(02)
[3]猪流行性腹泻病毒HeB10/2014株的分离与鉴定[J]. 王康,王鑫,杨德强,侯怡轩,谢春,虞凌雪,姜一峰,杨莘,高飞,李丽薇,黄勤峰,童光志,周艳君.  中国预防兽医学报. 2016(04)
[4]我国主要猪病毒病的危害及其综合防控[J]. 杜乐妍,刘文青,赵宝华.  畜牧与饲料科学. 2014(02)
[5]猪病毒性腹泻分子流行病学调查[J]. 刘云波,赵洪翠,王志成,武刚,何启盖.  中国畜牧兽医. 2013(02)



本文编号：3524509