影响山羊产羔数lncRNA的筛选及功能分析

发布时间：2021-12-09 15:37

　　旨在分析高、低繁殖力川中黑山羊卵巢组织中长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）的表达谱,探讨lncRNA与山羊生殖调控的关系,为解释lncRNA在山羊繁殖调控中的分子机制提供理论依据。本研究选择3胎以上的10头健康川中母羊（3.5～4.5岁）,将其分为高繁组和低繁组。高繁组为每胎产羔数在2头以上的母羊（n=6）,低繁组为每胎产羔数为1头的母羊（n=4）。同期发情后,采集高繁和低繁山羊的卵巢样品,并从中提取总RNA构建测序文库,通过HigSeq X ten平台进行测序,筛选出差异lncRNAs,通过对差异显著的lncRNAs与mRNAs位置关系以及结合能的判定预测顺式作用的靶基因,并对其进行GO和KEGG通路分析。最后,随机抽取6个差异lncRNAs进行实时荧光定量验证。结果表明,本研究共鉴定出168个差异表达lncRNAs,其中,163个lncRNAs在高繁组卵巢显著上调,5个lncRNAs在低繁组卵巢显著上调。筛选出的差异表达lncRNAs可能为调控山羊繁殖力的候选lncRNAs,包括ENSCHIG00000001479、ENSCHIG000000... 

【文章来源】：畜牧兽医学报. 2020,51(08)北大核心CSCD

【文章页数】：13 页

【部分图文】：

差异表达lncRNAs的火山图

差异表达lncRNAs聚类图

差异表达lncRNAs的qRT-PCR验证

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
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[2]miR-26b-5p调节CDH2对大鼠卵巢颗粒细胞凋亡作用的研究[D]. 杜波.锦州医科大学 2018
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[4]超排卵周期中卵泡不同反应组及多囊卵巢综合征患者中钙粘素的表达研究[D]. 张峥程.浙江大学 2012



本文编号：3530886