2株云南H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因序列分析

发布时间：2021-12-17 04:03

　　在2019年1月-2019年6月对云南出现呼吸道疫病的57个鸡场进行H9亚型禽流感检测的基础上,选取石林和楚雄2个H9亚型禽流感阳性样品进行病毒分离。从分离的H9N2亚型禽流感病毒感染鸡胚尿囊液中提取总RNA,采用特异性引物经反转录PCR分别扩增HA和NA基因,PCR产物纯化后进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明,云南2株H9N2毒株HA基因核苷酸序列同源性为94.2%,NA基因核苷酸序列同源性为93.6%,系统进化分析表明云南H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因均属于欧亚谱系中的类ADKHKY28097分支（Y280-like）,ACKYN12019和ACKYN72019 HA基因之间的同源性为94.3%,与参考毒株ACKJX2448的同源性最高,为95.6%～98.5%,与中国流行的H9N2代表株和疫苗株同源性较低。HA蛋白333-340位裂解位点为PSRSSR↓GLF,具有低致病性禽流感病毒分子特征,受体结合位点均发生E198T和Q234L的突变,具有人样受体结合特征,在29、141、298、305、313、492位氨基酸有6个糖基化位点。ACKYN12019和ACKYN72... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(03)北大核心

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【部分图文】：

H9亚型禽流感病毒反转录PCR扩增结果

用测序引物(H9F/HR和N2F/N2R)通过反转录PCR扩增,获得ACKYN12019和ACKYN72019两个毒株HA和NA基因,基因片段大小分别为1 687和1 402 bp(图2),与预期结果吻合。产物通过凝胶纯化、回收目的基因进行测序。2.4 HA基因遗传进化分析

云南2019年2株H9N2毒株与参考毒株进行系统进化分析,结果表明ACKYN12019和ACKYN72019毒株属于欧亚系中的Y280-like(ADKHKY28097)分支,与华东经典毒株ACKZJFSQ2011、华中经典毒株ACKAHWBQ2011同属于一个分支(图5)。图4 H9N2 AIV HA基因氨基酸同源性分析

【参考文献】：
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本文编号：3539371