低致病性H7N7禽流感病毒的分子进化分析及其致病性研究
发布时间：2022-01-03 19:38
禽流感病毒（Avian Influenza Virus,AIV）属于正黏病毒科（Orthomyxoviridae）,是一种RNA病毒。病毒表面有两种蛋白,分别为血凝素（Hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（Neuraminidase,NA）,在世界各地的野生鸟类和家禽中已发现16种HA（H1-H16）和9种NA（N1-N9）抗原亚型的流感病毒。H7亚型禽流感病毒是其中常见的一种亚型,其HA基因可以与N1-N9中的所有NA基因组合,这些组合的病毒大多数为低致病性,但也有部分是高致病性。H7亚型禽流感病毒通常在家禽中暴发,对养殖业造成了严重的经济损失,也可以突破种间屏障感染人,对公共卫生安全造成严重的威胁。野鸟是禽流感病毒的自然宿主,禽流感病毒可以通过粪便、污染水源、食物等方式从野鸟传播给家禽,再通过人与家禽之间的密切接触将病毒传播给人。在我们每年对上海野生鸟类携带禽流感病毒的主动预警和溯源研究中,2018年首次从上海崇明的野生鸟类中分离到一株新重组H7N7低致病性禽流感病毒（A/common teal/Shanghai/CM1216/2018）,我们将它作为研究对象,通过同源性...
【文章来源】：华东师范大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
A型流感病毒颗粒（Krammeretal.,2018）
华东师范大学2020届硕士学位论文23感病毒，其中两株H7N7禽流感病毒扩增得到了全基因组，经过序列对比分析发现这两株分离株的核苷酸序列是完全相同的。命名该病毒为A/commonteal/Shanghai/CM1216/2018，以下简称CM1216。对病毒的所有基因序列进行扩增，得到的核苷酸序列上传保存在Genbank中，登录号为MK554564-MK55571。图2-1采样地点地图上海位于东亚-澳大利西亚候鸟飞行区，图片由ArcGIS10.2软件绘制。Figure2-1MapofsamplingsiteatwhichtheCM1216wasisolated.ShanghaiislocatedintheEastAsian-Australasianmigratoryflyway.ThepicturewasmappedbyArcGIS10.2software.2.3.2同源性分析通过对CM1216的基因组序列进行分析表明，2018年CM1216的7个基因片段（NP基因除外）与同时期韩国野鸟中分离到的H7N7禽流感病毒（A/White-frontedGoose/SouthKorea/KNU18-119/2018）的核苷酸同源性最高（98.58%–99.90%），NP基因与2018年从野鸭分离的另一株韩国H7N1禽流感病毒（A/wildduck/SouthKorea/KNU2018-113/2018）核苷酸同源性最高（99.73%）（表2-7）。除与同期韩国H7禽流感病毒高度同源外，CM1216的HA和NA基因与格
华东师范大学2020届硕士学位论文26图2-2CM1216基因HA的系统发育树NJ树是用MEGA-X中的Kimura2-parameter模型构建的（http://www.megasoftwarenet/）。Bootstrap值设定为1000；未显示小于75%的值。CM1216以黑色三角形表示。其他基因进化树构建方式和HA基因相同。Figure2-2PhylogenetictreeoftheHAgeneofCM1216Theneighbour-joiningtreewasconstructedintheMEGA-XsoftwarewiththeKimura2-parametermodel(http://www.megasoftware.net/).1000bootstrapreplicateswereinstalled;valueslowerthan75%werenotshown.Thevirus(CM1216)characterizedinthisstudyisindicatedbyafilledtriangle.OthertreeswereconstructedinthesamewayasHAgene.
【参考文献】：
期刊论文
[1]H7N9禽流感病毒对人类致病的分子基础分析[J]. 于玉凤,郭晓兰,王颖,周俊梅,方丹云,曾谷城,晏辉钧,江丽芳. 中山大学学报(医学科学版). 2013(05)
[2]H5N1高致病性禽流感病毒的危害及生态问题[J]. 张继荣,赵德龙,尹祚华,雷富民. 动物学杂志. 2007(06)
[3]自主活动鸟类禽流感及新城疫的生态学与流行病学调查分析[J]. 李曦,符芳,崔尚金,童光志. 中国预防兽医学报. 2006(03)
[4]禽流感病毒分子生物学研究进展[J]. 何后军,戴益民,付光华. 江西农业大学学报(自然科学). 2004(02)
本文编号：3566859
【文章来源】：华东师范大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
A型流感病毒颗粒（Krammeretal.,2018）
华东师范大学2020届硕士学位论文23感病毒，其中两株H7N7禽流感病毒扩增得到了全基因组，经过序列对比分析发现这两株分离株的核苷酸序列是完全相同的。命名该病毒为A/commonteal/Shanghai/CM1216/2018，以下简称CM1216。对病毒的所有基因序列进行扩增，得到的核苷酸序列上传保存在Genbank中，登录号为MK554564-MK55571。图2-1采样地点地图上海位于东亚-澳大利西亚候鸟飞行区，图片由ArcGIS10.2软件绘制。Figure2-1MapofsamplingsiteatwhichtheCM1216wasisolated.ShanghaiislocatedintheEastAsian-Australasianmigratoryflyway.ThepicturewasmappedbyArcGIS10.2software.2.3.2同源性分析通过对CM1216的基因组序列进行分析表明，2018年CM1216的7个基因片段（NP基因除外）与同时期韩国野鸟中分离到的H7N7禽流感病毒（A/White-frontedGoose/SouthKorea/KNU18-119/2018）的核苷酸同源性最高（98.58%–99.90%），NP基因与2018年从野鸭分离的另一株韩国H7N1禽流感病毒（A/wildduck/SouthKorea/KNU2018-113/2018）核苷酸同源性最高（99.73%）（表2-7）。除与同期韩国H7禽流感病毒高度同源外，CM1216的HA和NA基因与格
华东师范大学2020届硕士学位论文26图2-2CM1216基因HA的系统发育树NJ树是用MEGA-X中的Kimura2-parameter模型构建的（http://www.megasoftwarenet/）。Bootstrap值设定为1000；未显示小于75%的值。CM1216以黑色三角形表示。其他基因进化树构建方式和HA基因相同。Figure2-2PhylogenetictreeoftheHAgeneofCM1216Theneighbour-joiningtreewasconstructedintheMEGA-XsoftwarewiththeKimura2-parametermodel(http://www.megasoftware.net/).1000bootstrapreplicateswereinstalled;valueslowerthan75%werenotshown.Thevirus(CM1216)characterizedinthisstudyisindicatedbyafilledtriangle.OthertreeswereconstructedinthesamewayasHAgene.
【参考文献】：
期刊论文
[1]H7N9禽流感病毒对人类致病的分子基础分析[J]. 于玉凤,郭晓兰,王颖,周俊梅,方丹云,曾谷城,晏辉钧,江丽芳. 中山大学学报(医学科学版). 2013(05)
[2]H5N1高致病性禽流感病毒的危害及生态问题[J]. 张继荣,赵德龙,尹祚华,雷富民. 动物学杂志. 2007(06)
[3]自主活动鸟类禽流感及新城疫的生态学与流行病学调查分析[J]. 李曦,符芳,崔尚金,童光志. 中国预防兽医学报. 2006(03)
[4]禽流感病毒分子生物学研究进展[J]. 何后军,戴益民,付光华. 江西农业大学学报(自然科学). 2004(02)
本文编号：3566859
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3566859.html
