PEDV分子流行病学分析及间接ELISA检测方法的改进与应用
发布时间：2022-01-09 09:06
2010年底,中国多省市暴发猪流行性腹泻,引发数以百万计的仔猪死亡,给中国乃至世界生猪产业带来了灾难性损失。同时,临床流行病学研究发现,即使在疫苗免疫猪场,仍呈现了高水平的感染率和死亡率。为了解现流行PEDV毒株的遗传变异情况,本研究参考GenBank中PEDV经典CV777毒株基因组序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法对临床采集的疑似PEDV样品进行S基因和ORF3基因扩增、克隆和测序,并拼接获得完整S基因和ORF3基因序列各8条,进一步对本研究毒株进行遗传进化及同源性分析。结果显示,与经典CV777毒株的S基因核苷酸相似性介于93.6%94.1%,ORF3基因核苷酸相似性介于95.7%96.6%。推导的S蛋白氨基酸序列进行比对显示,S1区存在91个氨基酸突变位点,占总数的61.9%（91/147）,,暗示PEDV的S1区域比S2区域易发生变异S1和S2区均存在氨基酸插入和缺失现象;ORF3蛋白存在17处氨基酸突变,未见缺失和插入现象。表明目前中国PEDV流行株已经发生了变异,在一定程度揭示了免疫猪群仍然发病的原因。有研究表明,S蛋白的...
【文章来源】：河南农业大学河南省
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
PEDV的结构模式图
图 2 PEDV 的基因组模式图Fig.2 Genome model of PEDV.3 PEDV 主要编码蛋白及功能.3.1 ORF1a/bORF1 基因由 ORF1a（12,354 nt）和 ORF1b（8037 nt）组成，基因全长约 20,346 nt，二
图 1-1 检测 PEDV 的 RT-PCR 扩增Fig.1-1 RT-PCR amplification of PEDV detection Marker DL2000; 1-8.阳性 PEDV 样品 RT-PCR 扩增结果rker DL2000; 1-8.PCR product of positive PEDV sample; 9 ORF3 基因扩增结果
本文编号：3578402
【文章来源】：河南农业大学河南省
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【学位级别】：硕士
【部分图文】：
PEDV的结构模式图
图 2 PEDV 的基因组模式图Fig.2 Genome model of PEDV.3 PEDV 主要编码蛋白及功能.3.1 ORF1a/bORF1 基因由 ORF1a（12,354 nt）和 ORF1b（8037 nt）组成，基因全长约 20,346 nt，二
图 1-1 检测 PEDV 的 RT-PCR 扩增Fig.1-1 RT-PCR amplification of PEDV detection Marker DL2000; 1-8.阳性 PEDV 样品 RT-PCR 扩增结果rker DL2000; 1-8.PCR product of positive PEDV sample; 9 ORF3 基因扩增结果
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