猪流行性腹泻病毒陕西分离株的鉴定及全基因组序列分析
发布时间：2022-01-12 17:54
猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea,PED）是由猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）引起的一种急性传染病,PEDV是猪重要的肠道病毒病原之一。本病以引起呕吐、严重腹泻和脱水为主要临床症状,对哺乳仔猪的危害最大,5日龄内仔猪感染后的死亡率可达100%。近年来,PED在全世界范围内频繁爆发,给我国和世界养猪业造成了巨大的经济损失。研究表明,PEDV的变异是导致疫情频发的主要原因之一,因此,PEDV越来越成为当前猪病研究的热点。自2010年以来,本病在陕西省的猪群中发生率明显增多。本研究旨在对从陕西地区猪场中分离的PEDV进行全基因的克隆和序列分析,为猪流行性腹泻的流行病学调查提供一定的实验数据和研究素材,进而为本地区有效地防控PED提供理论依据和指导意义。本研究以实验室保存的陕西某猪场的PEDV分离株命名为PEDV-SX株为研究对象,将病毒增殖后,首先通过RT-PCR扩增其S基因,并测序证实。序列分析结果显示:PEDV-SX株的S基因在碱基44-46位插入了3 nt（TTG）,在碱基57-60位插入了4 ...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
CV777株基因组结构示意图
A:正常 Vero 细胞 B:感染 PEDV 后的 Vero 细胞A: NormalVero cells B: Vero cells infected with PEDV图 2-1 病毒增殖的细胞病变镜检Fig. 2-1 Cytopathic microscopy of viral proliferation in Vero cells镜检未接毒 Vero 细胞与已接毒 Vero 细胞，发现接毒后的细胞变圆，细胞之间融合胞质内出现空泡，形成合胞体，此为典型的 CPE（细胞病变），镜检结果见图 2-1。2.2.2 PEDV S 基因片段的 RT-PCR 扩增采用设计的 2 对引物对 PEDV 陕西分离株进行 RT-PCR 扩增，均扩增出与预期一致的片段，S1 片段大小：2880bp；S2 片段大小：2215bp（见图 2-2）。
M：Trans 2K plus DNA Marker ；1：S1；2：S2；M: Trans 2K plus DNA Marker; 1: S1; 2: S2; 3: Ne图 2-2：PEDV S 基因 RT-PCR 扩增产物Fig. 2-2 The RT-PCR amplification products of P重组克隆化到 Trans1-T1 感受态细胞后，通过氨苄青用两对鉴定引物对克隆片段进行鉴定，结果图 2-3）。
本文编号：3585208
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
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【学位级别】：硕士
【部分图文】：
CV777株基因组结构示意图
A:正常 Vero 细胞 B:感染 PEDV 后的 Vero 细胞A: NormalVero cells B: Vero cells infected with PEDV图 2-1 病毒增殖的细胞病变镜检Fig. 2-1 Cytopathic microscopy of viral proliferation in Vero cells镜检未接毒 Vero 细胞与已接毒 Vero 细胞，发现接毒后的细胞变圆，细胞之间融合胞质内出现空泡，形成合胞体，此为典型的 CPE（细胞病变），镜检结果见图 2-1。2.2.2 PEDV S 基因片段的 RT-PCR 扩增采用设计的 2 对引物对 PEDV 陕西分离株进行 RT-PCR 扩增，均扩增出与预期一致的片段，S1 片段大小：2880bp；S2 片段大小：2215bp（见图 2-2）。
M：Trans 2K plus DNA Marker ；1：S1；2：S2；M: Trans 2K plus DNA Marker; 1: S1; 2: S2; 3: Ne图 2-2：PEDV S 基因 RT-PCR 扩增产物Fig. 2-2 The RT-PCR amplification products of P重组克隆化到 Trans1-T1 感受态细胞后，通过氨苄青用两对鉴定引物对克隆片段进行鉴定，结果图 2-3）。
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