西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因序列、遗传多样性及mRNA表达分析
发布时间:2022-01-16 23:28
西藏绒山羊羊绒品质远优于其他地区绒山羊品种,但其目前的羊绒产量远不能满足广大消费者的需求,因此,提高西藏绒山羊羊绒产量显得越来越迫切。目前的研究已经证明β-catenin、BMP4、Noggin基因是调控毛发生长的关键基因,但这三个基因的基因序列、遗传多样性及mRNA表达在西藏绒山羊的研究中未见相关报道。本试验以不同地区的210只西藏绒山羊作为研究对象,扩增了西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因的CDS区,对其编码外显子的遗传多样性进行了分析,进而检测了西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因的mRNA表达水平。取得的主要结果如下:1、西藏绒山羊β-catenin基因CDS全长2346 bp,编码781个氨基酸;BMP4基因CDS全长1230 bp,编码409个氨基酸;Noggin基因CDS全长699 bp,编码232个氨基酸。这三个基因与哺乳动物的氨基酸序列相似性均在97.79%以上。进化树分析显示,西藏绒山羊与山羊、绵羊、牛的亲缘关系较为接近,与非洲爪蟾、斑马鱼的亲缘关系最远。2、成功扩增出β-catenin基因的14个编码外显子,BMP4基因的...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
西藏绒山羊采样地理分布图(经纬度均标注在地图中)
β-catenin、BMP4、Noggin 基因 CDS 扩 β-catenin、BMP4、Noggin 基因 CDS 扩增A 为模板,用表 5 的引物扩增西藏绒山羊 β-catePCR 产物用 2%的琼脂糖凝胶电泳进行检测,如因扩增片段大小为 2874 bp(条带 1-2),有少许拖响切胶测序;BMP4 基因扩增片段大小为 1498 b带单一,特异性好,可以进行切胶测序;Noggin 5-6),条带单一明亮,特异性好,可以进行切胶梓熙生物技术有限公司进行测序。
2.1.2 西藏绒山羊 β-catenin、BMP4、Noggin 基因 CDS 序列分析将测序获得的序列结果与已有序列进行比对,扩增获得的片段为所需目的片段,获得的 β-catenin 基因 CDS 全长 2346 bp,编码 781 个氨基酸(图 3),NCBI登录号为 MF480651;BMP4 基因 CDS 全长 1230 bp,编码 409 个氨基酸(图 4),NCBI 登录号为 MF480652;Noggin 基因 CDS 全长 699 bp,编码 232 个氨基酸(图5),NCBI 登录号为 MF480653。
【参考文献】:
期刊论文
[1]DNA测序技术概述[J]. 付春鹏. 生物学教学. 2017(11)
[2]毛囊干细胞及Noggin对其调控作用的研究进展[J]. 马雨楠,曾林. 实验动物科学. 2016(01)
[3]影响藏西北绒山羊羊绒品质的主要因素[J]. 索朗达,吴玉江,巴贵,次仁德吉,德吉,益西多吉. 畜牧与饲料科学. 2015(10)
[4]Wnt10b、β-catenin、FGF18基因在‘甘肃高山细毛羊’胎儿皮肤毛囊中的表达规律研究[J]. 赵帅,岳耀敬,郭婷婷,吴瑜瑜,刘建斌,韩吉龙,郭健,牛春娥,孙晓萍,冯瑞林,王天翔,李桂英,李范文,史兆国,杨博辉. 甘肃农业大学学报. 2015(05)
[5]SNP检测方法的研究进展[J]. 许家磊,王宇,后猛,李强. 分子植物育种. 2015(02)
[6]中国美利奴羊BMP4基因的克隆、序列分析与真核表达[J]. 刘志龙,袁枫,贺三刚,李文蓉,贾斌. 石河子大学学报(自然科学版). 2014(06)
[7]绒山羊Noggin基因多态性与绒毛性状相关性分析[J]. 张燕军,王瑞军,苏蕊,张文广,李金泉. 中国草食动物科学. 2014(S1)
[8]基于茶树EST-SNP的CAPS标记开发[J]. 张成才,王丽鸳,韦康,成浩. 分子植物育种. 2013(06)
[9]西藏绒山羊产业现状及发展对策[J]. 吴玉江,益西多吉,索朗达,巴贵,次仁德吉,四朗玉珍. 家畜生态学报. 2013(09)
[10]绵羊Noggin基因的克隆、序列分析与原核表达[J]. 贺三刚,张宁,张雪梅,刘明军,李文蓉. 西北农业学报. 2012(11)
博士论文
[1]β-catenin在毛囊干细胞增殖与分化中作用的初步研究[D]. 张艺.第三军医大学 2008
硕士论文
[1]西藏绒山羊本品种选育效果分析[D]. 吴玉江.中国农业科学院 2013
[2]内蒙古绒山羊BMP家族和Noggin基因多态性与绒毛性状相关性分析[D]. 牧仁.内蒙古农业大学 2012
[3]内蒙古绒山羊胚胎毛囊形态发生及其β-catenin表达规律[D]. 孔德清.西北农林科技大学 2012
[4]藏西北地区绒山羊产绒性能研究[D]. 次仁德吉.中国农业科学院 2012
[5]持续埋植褪黑激素对绒相关基因SOX21、Noggin、BMP4表达影响的研究[D]. 冯林.内蒙古农业大学 2011
[6]湖羊BMP4基因克隆、表达与多态性分析[D]. 韦涛.南京农业大学 2011
[7]山羊BMP4基因多态性及其与生产性状关联性的研究[D]. 张驰.河南农业大学 2010
[8]黄淮山羊骨形态发生蛋白-4(BMP-4)基因的克隆与表达[D]. 石晓卫.甘肃农业大学 2008
[9]贵州香猪Noggin基因及其与BMP4基因的组织表达[D]. 彭雷.贵州大学 2006
本文编号:3593616
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
西藏绒山羊采样地理分布图(经纬度均标注在地图中)
β-catenin、BMP4、Noggin 基因 CDS 扩 β-catenin、BMP4、Noggin 基因 CDS 扩增A 为模板,用表 5 的引物扩增西藏绒山羊 β-catePCR 产物用 2%的琼脂糖凝胶电泳进行检测,如因扩增片段大小为 2874 bp(条带 1-2),有少许拖响切胶测序;BMP4 基因扩增片段大小为 1498 b带单一,特异性好,可以进行切胶测序;Noggin 5-6),条带单一明亮,特异性好,可以进行切胶梓熙生物技术有限公司进行测序。
2.1.2 西藏绒山羊 β-catenin、BMP4、Noggin 基因 CDS 序列分析将测序获得的序列结果与已有序列进行比对,扩增获得的片段为所需目的片段,获得的 β-catenin 基因 CDS 全长 2346 bp,编码 781 个氨基酸(图 3),NCBI登录号为 MF480651;BMP4 基因 CDS 全长 1230 bp,编码 409 个氨基酸(图 4),NCBI 登录号为 MF480652;Noggin 基因 CDS 全长 699 bp,编码 232 个氨基酸(图5),NCBI 登录号为 MF480653。
【参考文献】:
期刊论文
[1]DNA测序技术概述[J]. 付春鹏. 生物学教学. 2017(11)
[2]毛囊干细胞及Noggin对其调控作用的研究进展[J]. 马雨楠,曾林. 实验动物科学. 2016(01)
[3]影响藏西北绒山羊羊绒品质的主要因素[J]. 索朗达,吴玉江,巴贵,次仁德吉,德吉,益西多吉. 畜牧与饲料科学. 2015(10)
[4]Wnt10b、β-catenin、FGF18基因在‘甘肃高山细毛羊’胎儿皮肤毛囊中的表达规律研究[J]. 赵帅,岳耀敬,郭婷婷,吴瑜瑜,刘建斌,韩吉龙,郭健,牛春娥,孙晓萍,冯瑞林,王天翔,李桂英,李范文,史兆国,杨博辉. 甘肃农业大学学报. 2015(05)
[5]SNP检测方法的研究进展[J]. 许家磊,王宇,后猛,李强. 分子植物育种. 2015(02)
[6]中国美利奴羊BMP4基因的克隆、序列分析与真核表达[J]. 刘志龙,袁枫,贺三刚,李文蓉,贾斌. 石河子大学学报(自然科学版). 2014(06)
[7]绒山羊Noggin基因多态性与绒毛性状相关性分析[J]. 张燕军,王瑞军,苏蕊,张文广,李金泉. 中国草食动物科学. 2014(S1)
[8]基于茶树EST-SNP的CAPS标记开发[J]. 张成才,王丽鸳,韦康,成浩. 分子植物育种. 2013(06)
[9]西藏绒山羊产业现状及发展对策[J]. 吴玉江,益西多吉,索朗达,巴贵,次仁德吉,四朗玉珍. 家畜生态学报. 2013(09)
[10]绵羊Noggin基因的克隆、序列分析与原核表达[J]. 贺三刚,张宁,张雪梅,刘明军,李文蓉. 西北农业学报. 2012(11)
博士论文
[1]β-catenin在毛囊干细胞增殖与分化中作用的初步研究[D]. 张艺.第三军医大学 2008
硕士论文
[1]西藏绒山羊本品种选育效果分析[D]. 吴玉江.中国农业科学院 2013
[2]内蒙古绒山羊BMP家族和Noggin基因多态性与绒毛性状相关性分析[D]. 牧仁.内蒙古农业大学 2012
[3]内蒙古绒山羊胚胎毛囊形态发生及其β-catenin表达规律[D]. 孔德清.西北农林科技大学 2012
[4]藏西北地区绒山羊产绒性能研究[D]. 次仁德吉.中国农业科学院 2012
[5]持续埋植褪黑激素对绒相关基因SOX21、Noggin、BMP4表达影响的研究[D]. 冯林.内蒙古农业大学 2011
[6]湖羊BMP4基因克隆、表达与多态性分析[D]. 韦涛.南京农业大学 2011
[7]山羊BMP4基因多态性及其与生产性状关联性的研究[D]. 张驰.河南农业大学 2010
[8]黄淮山羊骨形态发生蛋白-4(BMP-4)基因的克隆与表达[D]. 石晓卫.甘肃农业大学 2008
[9]贵州香猪Noggin基因及其与BMP4基因的组织表达[D]. 彭雷.贵州大学 2006
本文编号:3593616
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